Staphylococcus

редактировать
Род грамположительных бактерий

Staphylococcus
Staphylococcus aureus 01.jpg
Сканирующая электронная микрофотография колоний S. aureus: обратите внимание на виноград -подобное группирование, обычное для видов Staphylococcus.
Научная классификация
Домен:Бактерии
Тип:Firmicutes
Класс:Bacilli
Порядок:Bacillales
Семейство:Staphylococcaceae
Род:Staphylococcus . Rosenbach 1884
Виды

Staphylococcus - это род из грамположительных бактерий семейства Staphylococcaceae из отряда Бациллы. Под микроскопом они кажутся сферическими (кокки ) и образуются в виде гроздей, похожих на виноград. Виды Staphylococcus - факультативные анаэробные организмы (способные к росту как в аэробных, так и в анаэробных условиях).

Название было придумано в 1880 году шотландским хирургом и бактериологом Александром Огстоном (1844–1929) по образцу, установленному пятью годами ранее с присвоением названия Streptococcus. Он сочетает в себе приставку «стафило-» (от древнегреческий : σταφυλή, романизированный : staphylē, букв. 'гроздь винограда') и с суффиксом современной латыни : кокк, лит. «сферическая бактерия» (от древнегреческого: κόκκος, латинизировано: kókkos, лит.'зерно, семя, ягода').

Стафилококк включает не менее 40 видов. Из них девять имеют два подвида, один - три подвида, а один - четыре подвида. Многие виды не могут вызывать заболевания и обычно обитают на коже и слизистых оболочках людей и других животных. Было обнаружено, что стафилококк является микробом, населяющим нектар. Они также являются незначительным компонентом микробиома почвы.

Содержание
  • 1 Таксономия
    • 1.1 Подвиды
    • 1.2 Группы
    • 1.3 Примечания
  • 2 Биохимическая идентификация
    • 2.1 Производство коагулазы
  • 3 Геномика и молекулярная биология
  • 4 Диапазон хозяев
  • 5 Клинические
  • 6 См. Также
  • 7 Ссылки
  • 8 Внешние ссылки
Таксономия

Таксономия основана на 16s рРНК, и большинство видов стафилококков делятся на 11 кластеров:

  1. S. группа aureus - S. argenteus, S. aureus, S. schweitzeri, S. simiae
  2. S. auricularis группа - S. auricularis
  3. S. carnosus - S. carnosus, S. condimenti, S. debuckii, S. massiliensis, S. piscifermentans, S. simulans
  4. S. группа epidermidis - S. capitis, S. caprae, S. epidermidis, S. saccharolyticus
  5. S. haemolyticus - S. devriesei, S. haemolyticus, S. hominis
  6. S. группа hyicus-intermediateus - S. agnetis, S. chromogenes, S. cornubiensis, S. felis, S. delphini, S. hyicus, S. intermediateus, S. lutrae, S. microti, S. muscae, S. pseudintermedius, S.. rostri, S. schleiferi
  7. S. lugdunensis группа - S. lugdunensis
  8. S. saprophyticus группа - S. arlettae, S. caeli, S. cohnii, S. equorum, S. gallinarum, S. kloosii, S. leei, S. nepalensis, S. saprophyticus, S. succinus, S. xylosus
  9. С. sciuri группы - S. fleurettii, S. lentus, S. sciuri, S. stepanovicii, S. vitulinus
  10. S. группа simulans - S. simulans
  11. S. группа warneri - S. pasteuri, S. warneri

Двенадцатая группа - S. caseolyticus - теперь переведена в новый род, Macrococcus, виды которого в настоящее время являются ближайшими известными родственниками Staphylococcus.

В 2015 году были описаны два вида - Staphylococcus argenteus и оба из которых ранее считались вариантами S. aureus.

Новый коагулазонегативный вид - - был выделен из Антарктиды. Этот вид, вероятно, принадлежит к группе S. saprophyticus.

Подвид

  • S. aureus subsp. aureus
  • S. aureus subsp. anaerobius
  • S. capitis subsp. capitis
  • С. capitis subsp. urealyticus
  • S. carnosus subsp. carnosus
  • S. carnosus subsp. utilis
  • S. cohnii subsp. cohnii
  • С. cohnii subsp. urealyticus
  • S. equorum subsp. equorum
  • S. equorum subsp. белье
  • S. hominis subsp. hominis
  • S. hominis subsp. novobiosepticus
  • S petrasii subsp. croceilyticus
  • S petrasii subsp. jettensis
  • S petrasii subsp. petrasii
  • S petrasii subsp. pragensis
  • S. saprophyticus subsp. bovis
  • С. saprophyticus subsp. saprophyticus
  • S. schleiferi subsp. coagulans
  • S. schleiferi subsp. schleiferi
  • С. sciuri subsp. carnaticus
  • S. sciuri subsp. rodentium
  • S. sciuri subsp. sciuri
  • С. succinus subsp. casei
  • С. succinus subsp. succinus

Группы

На основе анализа содержания ортологичных генов были предложены три группы (A, B и C).

Группа A включает S. aureus, S. capitis, S. S. epidermidis, S. haemolyticus, S. hominis, S. lugdunensis, S. pettenkoferi, S. simiae и S. warneri.

Группа B включает S. arlettae, S. cohnii, S. equorum, S. saprophyticus и S. xylosus.

Группа C включает S. delphini, S. intermediateus и S. pseudintermedius.

Примечания

Группы S. saprophyticus и S. sciuri обычно устойчивы к новобиоцину, как и S. hominis subsp. novobiosepticus.

Члены группы S. sciuri являются оксидазой -позитивными из-за наличия у них фермента цитохром с оксидазы. Эта группа является единственной кладой стафилококков, обладающей этим геном.

Группа S. sciuri, по-видимому, является наиболее близким родственником роду Macrococcus.

S. pulvereri является младшим синонимом S. vitulinus.

Внутри этих кладов группы S. haemolyticus и S. simulans, по-видимому, связаны, как и группы S. aureus и S. epidermidis.

С. lugdunensis, по-видимому, относится к группе S. haemolyticus.

С. petrasii может быть связан с S. haemolyticus, но это требует подтверждения.

Таксономическое положение S. lyticans, S. pettenkoferi, S. petrasii и S. pseudolugdunensis еще предстоит уточнить. Опубликованные описания этих видов, похоже, не были опубликованы надлежащим образом.

Биохимическая идентификация

Отнесение штамма к роду Staphylococcus требует, чтобы он был грамположительным кокком, который образует кластеры, имеет соответствующий структура клеточной стенки (включая тип пептидогликана и присутствие тейхоевой кислоты) и содержание G + C в ДНК в диапазоне 30-40 мол.%.

Виды стафилококков можно отличить от других аэробных и факультативно анаэробных грамположительных кокков с помощью нескольких простых тестов. Виды стафилококков - это факультативные анаэробы (способные к росту как в аэробных, так и в анаэробных условиях). Все виды растут в присутствии солей желчных кислот.

Все виды Staphylococcus aureus когда-то считались коагулазо-положительными, но с тех пор это опровергнуто.

Рост также может происходить в 6,5% Раствор NaCl. На среде Бэрда Паркера виды Staphylococcus растут ферментативно, за исключением S. saprophyticus, который растет окислительно. Виды стафилококков устойчивы к бацитрацину (диск 0,04 U: устойчивость = < 10 mm zone of inhibition) and susceptible to фуразолидон (диск 100 мкг: устойчивость = < 15 mm zone of inhibition). Further biochemical testing is needed to identify to the species level.

) Когда эти бактерии делятся, они делятся по двум осям, поэтому образуют скопления бактерий. В отличие от стрептококков, которые делятся вдоль одной оси, образуя цепочки (strep означает скрученный или гибкий).

Производство коагулазы

Одним из наиболее важных фенотипических признаков, используемых при классификации стафилококков, является их способность продуцировать коагулазу, фермент, вызывающий образование тромба.

Семь видов: В настоящее время признаны коагулазоположительными: S. aureus, S. delphini, S. hyicus, S. intermediateus, S. lutrae, S. pseudintermedius и S. schleiferi subsp. coagulans. Эти виды принадлежат к двум отдельным группам - S..aureus (только S. aureus) и группа S. hyicus-intermediateus (остальные пять).

Также был описан восьмой вид - Staphylococcus leei - fr у пациентов с гастритом.

S. aureus является коагулазо-положительным, что означает, что он производит коагулазу. Однако, хотя большинство штаммов S. aureus являются коагулазо-положительными, некоторые из них могут быть атипичными, поскольку они не продуцируют коагулазу. S. aureus является каталазой -положительным (это означает, что он может продуцировать фермент каталазу) и способен преобразовывать перекись водорода (H2O2) в воду и кислород, что делает тест на каталазу полезным для различения стафилококков. из энтерококков и стрептококков.

S. pseudintermedius обитает, а иногда и поражает кожу домашних собак и кошек. Этот организм также может нести генетический материал, придающий множественную бактериальную устойчивость. Он редко вызывает инфекции у людей, как зооноз.

S. epidermidis, коагулазонегативный вид, является комменсалом кожи, но может вызывать тяжелые инфекции у пациентов с ослабленным иммунитетом и пациентов с центральными венозными катетерами. С. saprophyticus, другой коагулазонегативный вид, который является частью нормальной микрофлоры влагалища, преимущественно участвует в инфекциях мочеполовых путей у сексуально активных молодых женщин. В последние годы несколько других видов Staphylococcus были замешаны в инфекциях человека, в частности, S. lugdunensis, S. schleiferi и S. caprae.

Распространенными сокращениями для коагулазонегативных стафилококков являются CoNS, CNS или CNST. Американское общество микробиологии сокращает количество коагулазонегативных стафилококков как «CoNS».

Геномика и молекулярная биология

Первыми секвенированными геномами S. aureus были геномы N315 и Mu50 в 2001 году. Было проведено гораздо больше полных геномов S. aureus отправлено в общедоступные базы данных, что делает его одной из наиболее широко секвенируемых бактерий. Использование геномных данных в настоящее время широко распространено и является ценным ресурсом для исследователей, работающих с S. aureus. Технологии полного генома, такие как проекты секвенирования и микроматрицы, показали огромное разнообразие штаммов S. aureus. Каждый из них содержит разные комбинации поверхностных белков и разные токсины. Связь этой информации с патогенным поведением - одно из основных направлений исследований стафилококков. Развитие методов молекулярного типирования позволило отслеживать различные штаммы S. aureus. Это может привести к лучшему контролю штаммов вспышек. Лучшее понимание того, как эволюционируют стафилококки, особенно благодаря приобретению мобильных генетических элементов, кодирующих гены устойчивости и вирулентности, помогает идентифицировать новые штаммы вспышек и может даже предотвратить их появление.

Широко распространенная заболеваемость Устойчивость к антибиотикам у различных штаммов S. aureus или у разных видов Staphylococcus была приписана горизонтальному переносу генов, кодирующих устойчивость к антибиотикам / металлам и вирулентность. Недавнее исследование продемонстрировало, что степень горизонтального переноса генов среди стафилококков намного выше, чем ожидалось ранее, и охватывает гены, функции которых выходят за рамки устойчивости к антибиотикам и вирулентности, и выходят за рамки генов, находящихся в мобильных генетических элементах.

Различные штаммы стафилококков доступны в центрах биологических исследований, таких как Национальная коллекция типовых культур.

Диапазон хозяев
Неизвестная разновидность стафилококка, окрашенный по Граму - пронумерованные отметки на шкале 11 мкм на расстоянии

Члены рода Staphylococcus часто колонизируют кожу и верхние дыхательные пути млекопитающих и птиц. Определенная видовая специфичность наблюдалась в диапазоне хозяев, например, виды Staphylococcus, наблюдаемые у некоторых животных, реже появляются у более отдаленных видов хозяев. Некоторые из наблюдаемых специфических характеристик хозяина включают:

Клинические

Стафилококк может вызывать широкий спектр заболеваний у людей и животных в результате выработки или проникновения токсинов. Стафилококковые токсины являются частой причиной пищевых отравлений, поскольку они могут вырабатываться бактериями, растущими в неправильно хранимых продуктах питания. Наиболее часто сиаладенит вызывается стафилококками, как бактериальные инфекции.

См. также
  • icon Биологический портал
Литература
Extern al links
Викискладе есть медиафайлы, связанные с Staphylococcus.
Wikispecies, есть информация, связанная с Staphylococcus
  • Staphylococcus геномами, и связанная информация на PATRIC, ресурсный центр по биоинформатике, финансируемый NIAID
Последняя правка сделана 2021-06-09 08:06:57
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте