ДНК-полимераза лямбда

редактировать
ОПРОС
ДНК-полимераза lambda.png
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы POLL, BETAN, POLKAPPA, полимераза (ДНК) лямбда, ДНК-полимераза лямбда
Внешние идентификаторыOMIM: 606343 MGI: 1889000 HomoloGene: 40863 Генные карты: ОПРОС
Местоположение гена (человек)
Хромосома 10 (человека)
Chr. Хромосома 10 (человек)
Хромосома 10 (человека) Геномное местоположение для POLL Геномное местоположение для POLL
Полоса 10q24.32Начало101578882 bp
Конец101588270 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE POLL 221049 в fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

27343

56626

Ensembl

ENSG00000166169

ENSMUSG00000025218

UniProt

Q9UGP5

Q9QUG2. NM9QXE2

RefSeq (mRNA_MRNA)

NM_008117>NM_013274

NM_020032. NM_001330506. NM_001330507

RefSeq (белок)

NP_001167555. NP_001167556. NP_001295311. NP_037406 <1332534. NP_037406 <1332534>NP_037406 <13400_00 NP_13400_00 NP_037400_13 317>NP_001334535. NP_036178.

NP_001317435. NP_001317436. NP_064416

Местоположение (UCSC)Chr 10: 101,58 - 101,59 Мб Chr 19: 45,55 - 45,56 МБ
Pub поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-полимераза лямбда, также известный как Pol λ, представляет собой фермент, обнаруженный во всех эукариотах. У человека он кодируется геном POLL .

. Функция

Pol λ является членом семейства X ДНК-полимераз. Считается, что он повторно синтезирует недостающие нуклеотиды во время негомологичного соединения концов (NHEJ), пути репарации двухцепочечных разрывов ДНК (DSB). NHEJ - основной путь репарации DSB ДНК у высших эукариот. Хромосомные DSB являются наиболее тяжелым типом повреждения ДНК. Во время NHEJ дуплексы, созданные выравниванием разорванных концов ДНК, обычно содержат небольшие промежутки, которые необходимо заполнить ДНК-полимеразой. ДНК-полимераза лямбда может выполнять эту функцию.

Кристаллическая структура pol λ показывает, что, в отличие от ДНК-полимераз, которые катализируют репликацию ДНК, pol λ устанавливает обширные контакты с 5'-фосфатом нижестоящая цепь ДНК. Это позволяет полимеразе стабилизировать два конца двухцепочечного разрыва и объясняет, как pol λ однозначно подходит для роли в негомологичном соединении концов.

Помимо NHEJ, pol λ также может участвовать в эксцизионная репарация (BER), где она обеспечивает резервную активность в отсутствие Pol β. BER является основным путем репарации небольших повреждений оснований, возникающих в результате алкилирования, окисления, депуринации / депиримидирования и дезаминирования ДНК.

Помимо своего каталитического полимеразного домена, pol λ имеет домен 8 кДа и домен BRCT. Домен 8 кДа обладает лиазной активностью, которая может удалять 5'-дезоксирибозофосфатную группу с конца разрыва цепи. Домен BRCT является доменом связывания фосфопептидов, который является общим для белков репарации ДНК и, вероятно, участвует в координации белок-белковых взаимодействий. Pol λ структурно и функционально связан с pol μ, другим членом семейства X, который также участвует в негомологичном соединении концов. Подобно pol μ, pol λ участвует в рекомбинации V (D) J, процессе, посредством которого формируется разнообразие В-клеток и Т-клеточных рецепторов у позвоночных иммунная система. В то время как pol μ важен для перегруппировок тяжелых цепей, pol λ, по-видимому, более важен для перегруппировок легких цепей. Дрожжи Saccharomyces cerevisiae имеют один гомолог как pol λ, так и pol μ, называемый Pol4.

Синтез транслезии - это механизм устойчивости к повреждениям, в котором специализированные ДНК-полимеразы заменяют репликативные полимеразы при копировании через ДНК. повреждения при репликации. ДНК-полимераза лямбда, по-видимому, участвует в транс-повреждении абазических сайтов и в повреждениях 8-oxodG.

Взаимодействия

Было показано, что Pol λ взаимодействует с PCNA.

Ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-16 09:17:37
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте