Домен BEN

В молекулярной биологии домен BEN представляет собой домен белка, который встречается в различных белках включая:

• SMAR1 (белок 1, связывающий область прикрепления каркаса / матрицы; также известный как BANP ), MAR-связывающий белок, подавляющий опухоль, который подавляет экспрессию циклина D1 путем привлечения корепрессора HDAC1-mSin3A комплекса в локусе промотора Cyclin D1; SMAR1 является мишенью для остановки роста, вызванной простагландином A2 (PGA2).
• NACC1, новый член POZ / BTB (Pox вирус и цинк finger / Bric-a-bracTramtrack Broad complex), но который отличается от других белков этого класса тем, что в нем отсутствует характерная ДНК-связывающая изоформа мотива.
• Mod (mdg4) C, модификатор mdg4 локуса в Drosophila melanogaster (плодовая муха), где mdg4 кодирует хроматин белки, которые участвуют в положении эффект разнообразия, установление границ хроматина, поиск нервных путей, спаривание мейотических хромосом и апоптоз. Транс-сплайсинг Mod (mdg4) продуцирует не менее 26 транскриптов.
• BEND2, белок с неизвестной функцией, который, как предполагается, участвует в модификации хроматина и клинически ассоциирован с заболеваниями центральной нервной системы.
• Белок E5R из хордопоксвируса виросомы, которые обнаруживаются в цитоплазматических сайтах вируса l Репликация ДНК.
• Несколько белков полиднавирусов.

Предполагается, что домен BEN будет функционировать как адаптер для структурирования хроматина высшего порядка и привлечения модифицирующих хроматин факторов в регуляция транскрипции. Было предложено опосредовать взаимодействия белок-ДНК и белок-белок во время организации хроматина и транскрипции. Присутствие BEN доменов в раннем виросомном белке поксвируса и в полиднавирусных белках также предполагает возможную роль в организации вирусной ДНК во время репликации или транскрипции. Обычно они связаны с другими глобулярными доменами с функциями, связанными с транскрипционной регуляцией и структурой хроматина, такими как BTB, C4DM и C2H2 пальцы.

Предполагается, что этот домен образует полностью альфа складку с четырьмя консервативными спиралями. Его паттерн консервации выявил несколько консервативных остатков, большинство из которых имеют гидрофобные боковые цепи и, вероятно, стабилизируют складку через спираль- спиральная упаковка. Структура первого домена BEN человека (BEND3) решается вместе с доменом TPR (ERCC6L) и стимулирует транслоказную и АТФазную активности ERCC6L (7).

7. Новое взаимодействие домена TPR-BEN опосредует ассоциацию PICH-BEND3.