Транс-сплайсинг представляет собой особую форму обработки РНК, где экзоны из двух различных первичных транскриптов РНК соединены конец в конец и лигированы. Обычно он обнаруживается у эукариот и опосредуется сплайсосомой, хотя некоторые бактерии и археи также имеют «полугены» для тРНК.
Тогда как «нормальный» (цис-) сплайсинг обрабатывает одну молекулу, транс-сплайсинг генерирует один транскрипт РНК из множества отдельных пре-мРНК. Этот феномен можно использовать в молекулярной терапии для воздействия на продукты мутировавших генов.
Хотя некоторые слитые транскрипты возникают посредством транс-сплайсинга в нормальных клетках человека, транс-сплайсинг также может быть механизмом, лежащим в основе некоторые онкогенные слитые транскрипты.
Сплайсинг-лидер (SL) транс-сплайсинг используется некоторыми микроорганизмами, особенно простейшими из класса Kinetoplastae, для экспрессии генов. У этих организмов транскрибируется кэпированная лидерная РНК сплайсинга, и одновременно гены транскрибируются в длинные полицистроны. Лидер сплайсинга с кэпом трансформируется в каждый ген для получения моноцистронных кэпированных и полиаденилированных транскриптов. Эти рано расходящиеся эукариоты используют несколько интронов, а сплайсосомы, которыми они обладают, демонстрируют некоторые необычные вариации в их структурной сборке. Они также обладают множеством изоформ eIF4E со специализированными ролями в кэппировании.
Некоторые другие эукариоты, особенно среди динофлагеллят, губок, нематод., книдарии, гребневики, плоские черви, ракообразные, хетогнаты, коловратки и оболочки также более или менее часто используют транс-сплайсинг SL. В оболочке Ciona Кишечник степень транс-сплайсинга SL лучше описывается количественным анализом, распознающим часто и редко транс-сплайсинговые гены, а не бинарной и стандартной категорией транс-сплайсинга по сравнению с не транс-сплайсингом. сплайсированные гены.
Одной из функций транс-сплайсинга SL является разделение полицистронных транскриптов оперонов на отдельные 5'-кэпированные мРНК. Эта обработка достигается, когда внешние части трансформируются в непарные, расположенные ниже акцепторные сайты, смежные с цистроном открытыми рамками считывания.
.