LDB3

редактировать
LDB3
Белок LDB3 PDB 1rgw.png
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы LDB3, CMD1C, CMPD3, CYPHER, LDB3Z1, LDB3Z4, LVNC3, MFM4, ORACLE, PDLIM6, ZASP, CMH24, привязка домена LIM 3
Внешние идентификаторыOMIM: 605906 MGI: 1344412 HomoloGene: 134626 GeneCard: LDB3
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человека)
Chr. Хромосома 10 (человек)
Хромосома 10 (человека) Геномное расположение LDB3 Геномное расположение LDB3
Полоса 10q23.2Начало86,668,449 bp
Конец86,736068 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE LDB3 213717 на fs.png .. PBB GE LDB3 216887 s at fs.png .. PBB GE LDB3 213371 at fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

11155

24131

Ensembl

ENSG00000122367

ENSMUSG00000021798

UniProt

O75112

Q9JKS4

RefSeq (mRNA_35108011>35108011>>NM_001080115. NM_001080116. NM_001171610. NM_001171611.

NM_007078. NM_001368063. NM_001368064. NM_001368065. NM_00136003803671>NM_001368065_348>NM_00136006006166166. NM_001039073. NM _001039074. NM_001039075.

NM_001039076. NM_011918

RefSeq (белок)

Связывание домена LIM 3 (LDB3 ), также известное как Z-полоса, альтернативно сплайсированная PDZ-мотив (ZASP ), является белок, который у человека кодируется геном LDB3 . ZASP принадлежит к подсемейству белков Enigma и стабилизирует саркомер (основные единицы мышц) во время сокращения за счет взаимодействия с актином в сердечной и скелетные мышцы. Мутации в гене ZASP были связаны с несколькими мышечными заболеваниями.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Функция
  • 3 Клиническая значимость
  • 4 Взаимодействия
  • 5 См. Также
  • 6 Ссылки
  • 7 Дополнительная литература
  • 8 Внешние ссылки
Структура

ZASP представляет собой белок, содержащий домен PDZ. Мотивы PDZ представляют собой модульные домены белок-белкового взаимодействия, состоящие из 80-120 аминокислотных остатков. Белки, содержащие домен PDZ, взаимодействуют друг с другом в сборке цитоскелета или с другими белками, участвующими в нацеливании и кластеризации мембранных белков. ZASP взаимодействует с альфа- актинином -2 через свой N-концевой домен PDZ и с протеинкиназой C через свой C-концевой Домены LIM. Домен LIM представляет собой мотив, богатый цистеином, определяемый 50-60 аминокислотами, содержащими два цинк-связывающих модуля. Этот белок также взаимодействует со всеми тремя членами семейства миозенинов.

ZASP человека может существовать в сердечных и скелетных клетках в виде шести различных изоформ на основе альтернативного сплайсинга 16 экзонов. Существует 2 короткие формы ZASP (Uniprot ID: O75112-6, 31,0 кДа, 283 аминокислоты; и Uniprot ID: O75112-5, 35,6 кДа, 330 аминокислот); и 4 длинные формы ZASP (Uniprot ID: O75112-4, 42,8 кДа, 398 аминокислот; Uniprot ID: O75112-3, 50,6 кДа, 470 аминокислот; Uniprot ID: O75112-2, 66,6 кДа, 617 аминокислот; и Uniprot ID: O75112, 77,1 кДа, 727 аминокислот). Все изоформы ZASP имеют N-концевой домен PDZ ; внутренние консервативные последовательности, известные как ZASP-подобные мотивы (ZM); и четыре длинные изоформы имеют три C-концевых домена LIM.

Функция

ZASP функционирует для поддержания структурной целостности саркомеров во время сокращения, и было показано, что они участвуют в передача сигналов протеинкиназы A. Также было показано, что ZASP совместно активирует интегрины α5β1 вместе с белком TLN1.

Клиническая значимость

Мутации в ZASP были связаны с миофибриллярной миопатией, дилатационная кардиомиопатия, аритмогенная кардиомиопатия правого желудочка, некомпактная кардиомиопатия и мышечная дистрофия.

Взаимодействия

PDZ-домен ZASP связывает C-конец альфа-актинина-2, а ZMs связывают стержневой домен альфа-актинина-2. Было показано, что LIM-домены взаимодействуют с протеинкиназой C. Специфическая для сердца область ZASP, кодируемая экзоном 4, включает мотив ZP и связывает регуляторную субъединицу протеинкиназы A.

См. Также
Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.

Последняя правка сделана 2021-05-26 08:27:21
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте