Войти
| Коронавирус человека HKU1 | |
|---|---|
 | |
| Формирование HcoV-HKU1. | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Царство: | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Писувирикота |
| Класс: | Pisoniviricetes |
| Порядок: | Нидовиралес |
| Семья: | Coronaviridae |
| Род: | Бетакоронавирус |
| Подрод: | Эмбековирус |
| Разновидность: | Коронавирус человека HKU1 |
Коронавирус человека HKU1 ( HCoV-HKU1) - это разновидность коронавируса человека. Он вызывает заболевание верхних дыхательных путей с симптомами простуды, но может прогрессировать до пневмонии и бронхиолита. Впервые он был обнаружен в январе 2004 года у одного человека в Гонконге. Последующие исследования показали, что он имеет глобальное распространение и более раннее происхождение.
Вирус является оболочкой, положительным смысле, одноцепочечной РНК - вирус, который вступает в клетку - хозяина путем связывания с N-ацетил-9-O-ацетилнейраминовую рецептора кислоты. Он имеет ген гемагглютининэстеразы (HE), который отличает его как члена рода Betacoronavirus и подрода Embecovirus.
HCoV-HKU1 был впервые обнаружен в январе 2004 года у 71-летнего мужчины, который был госпитализирован из-за острого респираторного дистресс-синдрома и рентгенологически подтвержденной двусторонней пневмонии. Мужчина недавно вернулся в Гонконг из Шэньчжэня, Китай.
Ву и его коллеги безуспешно пытались вырастить изолят HCoV-HKU1, но смогли получить полную геномную последовательность. Филогенетический анализ показал, что HKU1 наиболее тесно связан с вирусом гепатита мышей (MHV) и отличается в этом отношении от других известных бета-коронавирусов человека, таких как HCoV-OC43.
При анализе генов РНК-зависимой РНК-полимеразы (RdRp), шипа (S) и нуклеокапсида (N) были обнаружены несовместимые филогенетические отношения. Полное секвенирование генома 22 штаммов HCoV-HKU1 подтвердило, что это произошло из-за естественной рекомбинации. HCoV-HKU1, вероятно, произошел от грызунов.
HCoV-HKU1 - один из семи известных коронавирусов, заражающих людей. Остальные шесть:
Структуры белков HCoV-HKU1 spike (S) и HE были определены Cryo-EM в 2016 и 2020 годах соответственно. Белок S ( PDB : 5I08 ) известен своим большим размером. Белок HE ( PDB : 6Y3Y ) отличается от обычных белков ( таких как белок OC43) наличием гораздо меньшего рудиментарного лектинового домена. Этот домен защищен от распознавания иммунной системой за счет изменения размера и гликозилирования.
Обратный анализ носоглоточных аспиратов, отрицательных по SARS, от пациентов с респираторным заболеванием во время периода SARS в 2003 году выявил присутствие РНК CoV-HKU1 в образце от 35-летней женщины с пневмонией.
После первых сообщений об открытии HCoV-HKU1 вирус был идентифицирован в том же году у 10 пациентов в северной Австралии. Образцы дыхательных путей были собраны в период с мая по август (зима в Австралии). Исследователи обнаружили, что большая часть образцов, положительных по HCoV-HKU1, была получена у детей в более поздние зимние месяцы.
Первые известные случаи заболевания в Западном полушарии были обнаружены в 2005 году после анализа более старых образцов клиническими вирусологами из больницы Йель-Нью-Хейвен в Нью-Хейвене, штат Коннектикут, которым было любопытно узнать, есть ли HCoV-HKU1 в их районе. Они провели исследование образцов, собранных за 7-недельный период (декабрь 2001 г. - февраль 2002 г.) у 851 младенца и ребенка. Образцы девяти детей имели коронавирус человека HKU1. У этих детей были инфекции дыхательных путей на момент сбора образцов (у одной девочки были настолько тяжелые, что потребовалась искусственная вентиляция легких), в то время как тесты были отрицательными по другим причинам, таким как респираторно-синцитиальный вирус человека (RSV), вирусы парагриппа (типы 1-3), вирусы гриппа A и B и аденовирус с помощью прямого иммунофлуоресцентного анализа, а также метапневмовирус человека и HCoV-NH с помощью полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией (RT-PCR). Исследователи сообщили, что штаммы, обнаруженные в Нью-Хейвене, были похожи на штаммы, обнаруженные в Гонконге, и предположили, что они распространены по всему миру. Эти штаммы, обнаруженные в Нью-Хейвене, не следует путать с HCoV-NH (коронавирус Нью-Хейвена), который является штаммом человеческого коронавируса NL63.
В июле 2005 г. во Франции было зарегистрировано шесть случаев. В этих случаях французские исследователи использовали усовершенствованные методы выделения вируса из носоглоточного аспирата и образцов стула.
Данные, относящиеся к человеческому коронавирусу HKU1, в Wikispecies