Бетакоронавирус

редактировать
Род вирусов в подсемействе Orthocoronavirinae
Бетакоронавирус
109239.fig.001abcd.png
Коронавирус мышей (MHV) вирион электронная микрофотография, схематическая структура и геном
Классификация вирусов e
(без рейтинга):Вирус
Область:Ri boviria
Королевство:Orthornavirae
Тип:Pisuviricota
Класс:Pisoniviricetes
Порядок:Nidovirales
Семейство:Coronaviridae
Подсемейство :Orthocoronavirinae
Род:Betacoronavirus
Типовой вид
Коронавирус мышей (MHV).
Подроды и виды

См. Текст

Betacoronavirus (β -CoVs или Beta-CoVs) является одним из четырех родов (Alpha -, Beta-, Gamma- и Delta- ) коронавирусов. Вирусы-члены - это окруженные, вирусы с положительной цепью РНК, которые инфицируют людей и млекопитающих. Естественным резервуаром для бета-коронавирусов являются летучие мыши и грызуны. Грызуны являются резервуаром для подрода Embecovirus, тогда как летучие мыши являются резервуаром для других подродов.

Каждый род коронавируса состоит из различных вирусных линий с бета-коронавирусом. род, содержащий четыре таких линии: A, B, C, D. В более ранней литературе этот род также известен как «коронавирусы группы 2». Род входит в подсемейство Orthocoronavirinae в семействе Coronaviridae, порядка Nidovirales.

Бета-коронавирусы, имеющие наибольшее клиническое значение для человека, - это OC43 и HKU1 (которые могут вызывать простуду ) линии A, SARS-CoV и SARS-CoV-2 (которые вызывает заболевание COVID-19 ) линии B и MERS-CoV линии C. MERS-CoV - первый бета-коронавирус, принадлежащий к линии C, который, как известно, заражает людей. 223>Содержание

  • 1 Этимология
  • 2 Структура
  • 3 Геном
  • 4 Рекомбинация
  • 5 Патогенез
  • 6 Классификация
    • 6.1 Эмбековирус (линия A)
    • 6.2 Сарбековирус (линия B)
    • 6.3 Мербековирус (линия C)
    • 6.4 Нобековирус (линия D)
    • 6.5 Hibecovirus
  • 7 См. Также
  • 8 Ссылки
  • 9 Внешние ссылки

Этимология

Название «бета-коронавирус» происходит от древнегреческого βῆτα (bē̂ta, «вторая буква в греческом a lphabet ") и κορώνη (korṓnē,« гирлянда, венок »), что означает корона, который описывает внешний вид видимых под электронной микроскопией выступов на поверхности, которые напоминают солнечную корону. Эта морфология создается вирусным спайком (S) пепломерами, которые представляют собой белки, которые населяют поверхность вируса и определяют тропизм хозяина. Орден Nidovirales назван от латинского nidus, что означает «гнездо». Это относится к производству в этом порядке 3'-котерминального вложенного набора субгеномных мРНК во время инфекции.

Структура

Иллюстрация SARSr-CoV вирион

Некоторые структуры белков спайков были разрешены. Рецептор-связывающий домен в спайковом белке альфа- и бета-коронавирусов внесен в каталог как InterPro : IPR018548. Спайковый белок, машина слияния типа 1, собирается в тример (PDB : 3jcl, 6acg ); его основная структура напоминает структуру белков парамиксовируса F (слитые). Использование рецепторов не очень консервативно; например, среди сарбековируса только суб-линия, содержащая SARS, имеет общий рецептор ACE2.

Вирусы подрода Embecovirus отличаются от всех других вирусов этого рода тем, что они имеют дополнительный более короткий (8 нм) шиповидный белок, называемый гемагглютининэстеразой (HE) (P15776 ). Считается, что он был получен от вируса гриппа C.

Геном

Геномы альфакоронавирусов и бета-коронавирусов

Коронавирусы имеют большой геном, размер которого варьируется от От 26 до 32 килобаз. Общая структура генома β-CoV аналогична таковой для других CoV, с полипротеином репликазы ORF1ab (rep, pp1ab), предшествующим другим элементам. Этот полипротеин расщепляется на 16 неструктурных белков (см. Аннотацию UniProt к SARS rep, P0C6X7 ).

По состоянию на май 2013 года GenBank имеет 46 опубликованных полных геномов α- (группа 1), β- (группа 2), γ- (группа 3) и δ- ( группа 4) CoV.

Рекомбинация

Генетическая рекомбинация может происходить, когда два или более вирусных генома присутствуют в одной и той же клетке-хозяине. дромадер верблюд Beta-CoV HKU23 демонстрирует генетическое разнообразие в популяции африканских верблюдов. Этому разнообразию способствуют несколько событий рекомбинации, которые имели место в прошлом между близкородственными бета-коронавирусами подрода Embecovirus. Также бета-коронавирус, Human SARS-CoV, по-видимому, имел сложную историю рекомбинации между предковыми коронавирусами, которые были размещены в нескольких разных группах животных.

Патогенез

Альфа- и бета-коронавирусы в основном заражают летучих мышей, но они также заражают другие виды, такие как люди, верблюды и грызуны. Бетакоронавирусы, вызвавшие эпидемии у людей, обычно вызывают лихорадку и респираторные симптомы. К ним относятся:

Классификация

Филогенетическое дерево линий рода Betacoronavirus с подробностями для SARS-CoV и MERS-CoV

Внутри рода Betacoronavirus (группа 2 CoV) четыре подроды или линии (A, B, C и D) традиционно признаются. Четыре линии передачи также были названы греческими буквами или цифрами. Пятый подрод, Hibecovirus, был добавлен совсем недавно. Подроды и виды-члены включают:

Эмбековирус (линия A)

Бетакоронавирус 1

. Коронавирус человека HKU1. Коронавирус мышей

Сарбековирус (линия B)

Коронавирус, связанный с тяжелым острым респираторным синдромом

Мербековирус (происхождение C)

Коронавирус ежа 1. Коронавирус, связанный с респираторным синдромом Ближнего Востока. Коронавирус летучих мышей Pipistrellus HKU5. Коронавирус летучих мышей Tylonycteris HKU4

Nobecovirus (линия D)

.. RousettusKU coronavirus Hibecovirus

См. Также

Ссылки

Внешние ссылки

Последняя правка сделана 2021-05-12 14:20:40
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте