TCF7L2

редактировать
Ген, кодирующий белок у человека
TCF7L2
Белок TCF7L2 PDB 1jdh.png
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы TCF7L2, TCF-4, TCF4, фактор транскрипции 7, например 2
Внешние идентификаторыOMIM: 602228 MGI: 1202879 HomoloGene: 7564 GeneCards: TCF7L2
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человека)
Chr. хромосома 10 (человека)
Хромосома 10 (человека) Геномное расположение TCF7L2 Геномное расположение TCF7L2
полоса 10q25.2-q25.3начало112,950,247 bp
конец113,167,678 bp
Экспрессия РНК паттерн
PBB GE TCF7L2 212762 s на fs.png .. PBB GE TCF7L2 212759 s на fs.png .. PBB GE TCF7L2 212761 на fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

6934

21416

Ensembl

ENSG00000148737

ENSMUSG00000024985

UniProt

Q9NQB0

Q924A0

RefSeq (mRNA)
RefSeq (белок)
Местоположение (UCSC)Chr 10: 112.95 - 113.17 Мб Chr 19: 55.74 - 55.93 Мб
PubMed поиск
Wikidata
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Фактор транскрипции 7, подобный 2 (специфичный для Т-клеток, HMG-бокс), также известный как TCF7L2 или TCF4 представляет собой белок , действующий как фактор транскрипции, который у людей кодируется геном TCF7L2 . Ген TCF7L2 расположен на хромосоме 10q25.2 – q25.3, содержит 19 экзонов и имеет аутосомно-доминантное наследование. Ген TCF7L2 является полиморфным и плейотропным. Как член семейства TCF, TCF7L2 может образовывать двусторонний транскрипционный фактор и влиять на несколько биологических путей, включая сигнальный путь Wnt.

однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в этом Особенно известно, что ген связан с повышенным риском развития диабета 2 типа, гестационного диабета и множества других заболеваний. SNP rs7903146 ​​в гене TCF7L2 на сегодняшний день является наиболее значимым генетическим маркером, связанным с риском диабета 2 типа.

Структура комплекса между TCF7L2 (оранжевый), β-катенином (красный) и BCL9 (коричневый)
Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Структура
  • 3 Распределение в тканях
  • 4 Клиническая значимость
    • 4.1 Тип 2 Диабет
    • 4.2 Гестационный диабет (ГСД)
    • 4.3 Рак
    • 4.4 Шизофрения
    • 4.5 Рассеянный склероз
  • 5 Модельные организмы
  • 6 Номенклатура
  • 7 См. Также
  • 8 Ссылки
  • 9 Дополнительная литература
  • 10 Внешние ссылки
Функция

TCF7L2 - это фактор транскрипции, влияющий на транскрипцию нескольких генов, тем самым выполняя большое количество разнообразных функций внутри клетки. Он является членом семейства TCF, который может образовывать двудольный фактор транскрипции (β-катенин / TCF ) вместе с β-катенином. Факторы двусторонней транскрипции могут иметь большое влияние на сигнальный путь Wnt. Стимуляция пути передачи сигналов Wnt приводит к ассоциации β-катенина с BCL9, транслокации в ядро ​​и ассоциации с TCF7L2, что, в свою очередь, приводит к активации генов-мишеней Wnt. Активация генов-мишеней Wnt специфически подавляет синтез проглюкагона в энтероэндокринных клетках. Репрессия TCF7L2 с использованием репрессора HMG-бокса (HBP1) ингибирует передачу сигналов Wnt. Следовательно, TCF7L2 является эффектором в сигнальном пути Wnt. Роль TCF7L2 в метаболизме глюкозы проявляется во многих тканях, таких как кишечник, мозг, печень и скелетные мышцы. Однако TCF7L2 не регулирует напрямую метаболизм глюкозы в β-клетках, но регулирует метаболизм глюкозы в тканях поджелудочной железы и печени.

Ген TCF7L2, кодирующий фактор транскрипции TCF7L2, проявляет множество функций благодаря своему полиморфизму и, таким образом, известен как плейотропный ген. Восприимчивость к диабету 2 типа T2DM проявляется у носителей полиморфизмов rs7903146C>T и rs290481T>C TCF7L2. Тем не менее, полиморфизм TCF7L2 rs290481T>C не показал значительной корреляции с предрасположенностью к гестационному сахарному диабету (GDM) в китайской ханьской популяции, тогда как T-аллели rs7903146 ​​и rs1799884 увеличивают восприимчивость к GDM у китайцев. Население хань. Различие в эффектах различных полиморфизмов гена указывает на то, что ген действительно является плейотропным.

Структура

Ген TCF7L2, кодирующий белок TCF7L2, расположен на хромосоме 10q25.2-q25.3. Ген содержит 19 экзонов и имеет аутосомно-доминантное наследование. Из 19 экзонов 5 являются альтернативой. Белок TCF7L2 содержит 619 аминокислот, а его молекулярная масса составляет 67919 Да. Вторичная структура TCF7L2 представляет собой структуру спираль-спираль.

Распределение в тканях

TCF7L2 в первую очередь экспрессируется в мозге, печени, кишечнике и жировых клетках. Он не действует в основном на β-клетки поджелудочной железы.

Клиническая значимость

Диабет 2 типа

Несколько однонуклеотидных полиморфизмов в гене TCF7L2 были связаны с типом 2 сахарный диабет. Исследования, проведенные Равиндранатом Дуггиралой и Майклом Стерном в Центре медицинских наук Университета Техаса в Сан-Антонио, были первыми, кто выявил сильную связь для диабета 2 типа в области на хромосоме. 10 у американцев мексиканского происхождения Этот сигнал был позже уточнен Струаном Грантом и его коллегами из DeCODE genetics и выделен для гена TCF7L2. Молекулярные и физиологические механизмы, лежащие в основе ассоциации TCF7L2 с диабетом 2 типа, активно исследуются, но вполне вероятно, что TCF7L2 играет важную биологическую роль во многих метаболических тканях, включая поджелудочную железу, печень и жировую ткань. Полиморфизм TCF7L2 может повышать предрасположенность к диабету 2 типа за счет снижения продукции глюкагоноподобного пептида-1 (GLP-1) .

гестационного диабета (GDM)

TCF7L2 модулирует островок поджелудочной железы функция β-клеток, что указывает на его значительную связь с риском GDM. Аллели T полиморфизмов TCF7L2 rs7903146 ​​и rs1799884 повышают восприимчивость к GDM в популяции китайской хань.

Рак

TCF7L2 играет роль в колоректальном раке. Мутация сдвига рамки считывания TCF7L2 предоставила доказательства того, что TCF7L2 вовлечен в колоректальный рак. Подавление TCF7L2 в клетках колоректального рака KM12 предоставило доказательства того, что TCF7L2 играет роль в пролиферации и метастазировании раковых клеток при колоректальном раке.

Варианты гена, скорее всего, участвуют во многих других типах рака. TCF7L2 косвенно участвует в раке простаты благодаря своей роли в активации пути PI3K / Akt, пути, вовлеченного в рак простаты.

Шизофрения

Однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) в гене TCF7L2 показали увеличение предрасположенности к шизофрении в арабских, европейских и китайских ханьских популяциях. В китайской популяции хань SNP rs12573128 в TCF7L2 является вариантом, который был связан с увеличением риска шизофрении. Этот маркер используется в качестве преддиагностического маркера шизофрении.

Рассеянный склероз

TCF7L2 находится ниже путей WNT / β-катенина.. Активация путей WNT / β-катенин была связана с демиелинизацией при рассеянном склерозе. TCF7L2 не регулируется во время ранней ремиелинизации, что заставляет ученых полагать, что он участвует в ремиелинизации. TCF7L2 может действовать в зависимости или независимо от путей WNT / β-катенина.

Модельные организмы

Модельные организмы использовались в исследовании функции TCF7L2. Условная линия нокаутной мыши, названная Tcf7l2, была сгенерирована в Wellcome Trust Sanger Institute. Самцы и самки животных подвергались стандартизированному фенотипическому скринингу для определения эффектов делеции. Проведенные дополнительные скрининги: - Углубленное иммунологическое фенотипирование

Вариации гена, кодирующего белок, обнаружены у крыс, рыб-данио, дрозофил и почкующихся дрожжей. Следовательно, все эти организмы могут использоваться в качестве модельных организмов при изучении функции TCF7L2.

Номенклатура

TCF7L2 - это символ, официально одобренный Комитетом по номенклатуре генов HUGO для гена фактора транскрипции 4 (TCF4).

См. Также
Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
  • TCF7L2 здесь называется функциями TCF4 на этом веб-сайте пути Wnt: Сигнальные молекулы Wnt TCF
  • Определение структуры TCF7L2: запись PDB 2GL7 и соответствующая публикация на PubMed
  • PubMed GeneRIFs (резюме соответствующих научных публикаций) - [1]
  • Генная карта Института Вейцмана для TCF7L2
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9NQB0 (фактор транскрипции 7-подобный 2) на PDBe-KB.
Последняя правка сделана 2021-06-09 05:38:25
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте