SREBF1 |
|
Доступные конструкции | PDB | Ортолог поиск: PDBe RCSB | Список идентификационных кодов PDB | 1AM9 | | |
Идентификаторы |
Псевдонимы | SREBF1, SREBP-1c, SREBP1, bHLHd1, SREBP1a, фактор транскрипции, связывающий стериновый регуляторный элемент 1 |
Внешние идентификаторы | OMIM : 184756 MGI : 107606 HomoloGene : 3079 GeneCards : SREBF1 |
|
Расположение гена ( Мышь ) | | Chr. | Хромосома 11 (мышь) | | Группа | 11 | 11 B2 | Начинать | 60 199 089 п.н. | Конец | 60 222 581 п.н. | |
|
Онтология генов | Молекулярная функция | • Связывание ДНК • Связывание ДНК, специфичное для последовательности • Активность димеризации белков • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Связывание элементов ответа на стерол • Связывание хроматина • GO: 0000980 РНК-полимераза II Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области • Активность фактора транскрипции, связывание с последовательностью проксимальной области корового промотора РНК-полимеразы II • Связывание с белком GO: 0001948 • Связывание с протеинкиназой • Связывание ДНК с последовательностью регуляторной области РНК-полимеразы II • GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051 Активность ядерного рецептора • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Активность ДНК-связывающего активатора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая • Связывание комплекса, содержащего белок GO: 0032403 • Активность активатора фермента GO: 0010577 | Сотовый компонент | • цитоплазма • интегральный компонент мембраны • цитозоль • аппарат Гольджи • ядерная оболочка • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • внутриклеточная мембранно-ограниченная органелла • мембрана Гольджи • нуклеоплазма • эндоплазматический ретикулум • ER в мембрану транспортных пузырьков Гольджи • GO: 0016023 цитоплазматический пузырек • ядро • протеиносодержащий комплекс | Биологический процесс | • позитивная регуляция деацетилирования гистонов • сигнальный путь рецептора инсулина • позитивная регуляция процесса биосинтеза триглицеридов • процесс метаболизма стероидов • негативная регуляция секреции инсулина • ответ на жирные кислоты • процесс биосинтеза липидов • ответ на глюкагон • регуляция стабильности белка • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ответ на ретиноевую кислоту • ответ на органическое циклическое соединение • развитие легких • липидный метаболизм • регуляция секреции инсулина • регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • клеточный ответ на голодание • ответ на прогестерон • старение • ответ на пептидный гормон • транскрипция мРНК с помощью РНК-полимеразы II • процесс метаболизма холестерина • негативная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • ответ на глюкозу • транскрипция, ДНК-шаблон • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ответ на липиды • клеточный ответ на жирную кислоту • регуляция аутофагии митохондрии • re регуляция белка, нацеленного на митохондрии • регуляция процесса метаболизма жирных кислот • циркадный ритм • клеточный ответ на инсулиновый стимул • ответ на пищу • положительное регулирование процесса биосинтеза холестерина • ответ на цАМФ • регулирование частоты сердечных сокращений с помощью химического сигнала • дифференцировка жировых клеток • ответ на лекарство • внутриклеточный сигнальный путь рецептора • позитивная регуляция транскрипции РНК-полимеразой II • регуляция процесса биосинтеза холестерина • транскрипция РНК-полимеразой II • позитивная регуляция транскрипции pri-miRNA с помощью РНК-полимеразы II • GO: 0048554 позитивная регуляция каталитической активности | Источники: Amigo / QuickGO | |
Ортологи |
Разновидность | Человек | Мышь |
Entrez | | |
Ансамбль | | |
UniProt | | |
RefSeq (мРНК) | | |
RefSeq (белок) | | |
Расположение (UCSC) | Chr 17: 17,81 - 17,84 Мб | Chr 11: 60.2 - 60.22 Мб |
PubMed поиск | | |
Викиданные |
|
Стерол регуляторный элемент-связывающий фактор транскрипции 1 ( SREBF1), также известный как стерол регуляторный элемент-связывающего белка 1 ( SREBP-1) представляет собой белок, который у человека кодируется SREBF1 гена.
Этот ген расположен в области синдрома Смита-Магениса на хромосоме 17. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. Изоформы - это SREBP-1a и SREBP-1c (последняя также называется ADD-1). SREBP-1a экспрессируется в кишечнике и селезенке, тогда как SREBP-1c в основном экспрессируется в печени, мышцах и жире (среди других тканей).
СОДЕРЖАНИЕ
- 1 Выражение
- 2 Функция
- 3 Клиническая значимость
- 4 взаимодействия
- 5 См. Также
- 6 Ссылки
- 7 Дальнейшее чтение
- 8 Внешние ссылки
Выражение
Основная статья:
Стерол-регуляторный элемент-связывающий белок Белки, кодируемые этим геном, представляют собой факторы транскрипции, которые связываются с последовательностью в промоторе различных генов, называемой регуляторным элементом стерола-1 (SRE1). Этот элемент представляет собой декамер ( олигомер с десятью субъединицами), фланкирующий ген рецептора ЛПНП и другие гены, участвующие, например, в биосинтезе стеролов. Белок синтезируется в виде предшественника, который прикрепляется к ядерной мембране и эндоплазматическому ретикулуму. После расщепления зрелый белок перемещается в ядро и активирует транскрипцию путем связывания с SRE1. Стерины ингибируют расщепление предшественника, и зрелая ядерная форма быстро катаболизируется, тем самым снижая транскрипцию. Белок является членом семейства основных факторов транскрипции спираль-петля-спираль-лейциновая застежка-молния ( bHLH-Zip ).
SREBP-1a регулирует гены, связанные с выработкой липидов и холестерина, и его активность регулируется уровнями стерола в клетке.
SREBP-1a и SREBP-1c кодируются одним и тем же геном, но транскрибируются разными промоторами. У животных в состоянии натощак экспрессия SREBP-1c подавляется в печени, но еда с высоким содержанием углеводов (за счет высвобождения инсулина) сильно индуцирует экспрессию SREBP-1c.
Функция
SREBP-1 играет ключевую роль в индукции липогенеза печенью. mTORC1 активируется инсулином (гормоном изобилия питательных веществ), что приводит к увеличению выработки SBREP-1c, что способствует хранению жирных кислот (избыточных питательных веществ) в виде триглицеридов.
Клиническая значимость
SREBP-1c регулирует гены, необходимые для метаболизма глюкозы и производства жирных кислот и липидов, и его экспрессия индуцируется инсулином. Стимулируемый инсулином SREBP-1c увеличивает гликолиз за счет активации фермента глюкокиназы и увеличивает липогенез (превращение углеводов в жирные кислоты). Стимуляция SREBP-1c инсулином опосредуется Х-рецептором печени (LXR) и mTORC1.
Высокий уровень инсулина в крови из-за инсулинорезистентности часто приводит к стеатозу печени из-за активации SREBP-1. Подавление SREBP-1c сиртуином 1 или другими способами защищает от развития ожирения печени.
SREBP-1 высокоактивен при раке, потому что опухолевым клеткам необходимы липиды для клеточных мембран, вторичных мессенджеров и энергии.
Взаимодействия
Было показано, что SREBF1 взаимодействует с:
Смотрите также
использованная литература
дальнейшее чтение
- Осборн TF (август 2001 г.). «Создание печени без SCAP удерживает SREBP в мембране ER и предотвращает повышенный синтез липидов в ответ на низкий уровень холестерина и высокий уровень инсулина». Гены и развитие. 15 (15): 1873–8. DOI : 10,1101 / gad.916601. PMID 11485982.
- Коцка Дж., Мюллер-Виланд Д. (апрель 2004 г.). «Стерол-регуляторный элемент-связывающий белок (SREBP) -1: генная регуляторная мишень для инсулинорезистентности?». Мнение экспертов о терапевтических целях. 8 (2): 141–9. DOI : 10.1517 / 14728222.8.2.141. PMID 15102555. S2CID 34317215.
- Szolkiewicz M, Chmielewski M, Nogalska A, Stelmanska E, Swierczynski J, Rutkowski B (январь 2007 г.). «Потенциальная роль факторов транскрипции белков, связывающих регуляторный элемент стерола, в повреждении почек». Журнал почечного питания. 17 (1): 62–5. DOI : 10,1053 / j.jrn.2006.10.009. PMID 17198935.
- Ферре П., Фуфель Ф (2007). «Фактор транскрипции SREBP-1c и липидный гомеостаз: клиническая перспектива». Гормональные исследования. 68 (2): 72–82. DOI : 10.1159 / 000100426. PMID 17344645.
- Хуа Х, Йокояма С., Ву Дж., Бриггс М.Р., Браун М.С., Гольдштейн Дж. Л., Ван Х (декабрь 1993 г.). «SREBP-2, второй белок основной спирали, петли, спирали, лейциновой молнии, который стимулирует транскрипцию путем связывания с регуляторным элементом стерола». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 90 (24): 11603–7. Bibcode : 1993PNAS... 9011603H. DOI : 10.1073 / pnas.90.24.11603. PMC 48032. PMID 7903453.
- Сато Р., Ян Дж., Ван Х, Эванс М.Дж., Хо Ю.К., Гольдштейн Д.Л., Браун М.С. (июнь 1994 г.). «Назначение доменов прикрепления к мембране, связывания ДНК и активации транскрипции белка-1, связывающего регуляторный элемент стерола (SREBP-1)». Журнал биологической химии. 269 (25): 17267–73. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (17) 32550-4. PMID 8006035.
- Ван Х, Сато Р., Браун М.С., Хуа Х, Гольдштейн Дж. Л. (апрель 1994 г.). «SREBP-1, мембраносвязанный фактор транскрипции, высвобождаемый стерин-регулируемым протеолизом». Cell. 77 (1): 53–62. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90234-8. PMID 8156598. S2CID 44899129.
- Ван Х, Бриггс М.Р., Хуа Х, Ёкояма С., Гольдштейн Д.Л., Браун М.С. (июль 1993 г.). «Ядерный белок, который связывает стериновый регуляторный элемент промотора рецептора липопротеинов низкой плотности. II. Очистка и характеристика». Журнал биологической химии. 268 (19): 14497–504. DOI : 10.1016 / S0021-9258 (19) 85266-3. PMID 8314806.
- Хуа Х, Сакаи Дж., Браун М.С., Гольдштейн Дж. Л. (апрель 1996 г.). «Регулируемое расщепление белков, связывающих регуляторный элемент стерола, требует последовательностей на обеих сторонах мембраны эндоплазматического ретикулума». Журнал биологической химии. 271 (17): 10379–84. DOI : 10.1074 / jbc.271.17.10379. PMID 8626610.
- Шимомура I, Шимано Х, Хортон Дж. Д., Гольдштейн Дж. Л., Браун М. С. (март 1997 г.). «Дифференциальная экспрессия экзонов 1a и 1c в мРНК для белка-1, связывающего регуляторный элемент стерола в человеческих и мышиных органах и культивируемых клетках». Журнал клинических исследований. 99 (5): 838–45. DOI : 10.1172 / JCI119247. PMC 507890. PMID 9062340.
- Miserez AR, Cao G, Probst LC, Hobbs HH (февраль 1997 г.). «Структура гена человека, кодирующего белок 2, связывающий регуляторный элемент стерола (SREBF2)». Геномика. 40 (1): 31–40. DOI : 10.1006 / geno.1996.4525. PMID 9070916.
- Párraga A, Bellsolell L, Ferré-D'Amaré AR, Burley SK (май 1998 г.). «Сокристаллическая структура стеринового регуляторного элемента, связывающего белок 1a с разрешением 2,3 A». Структура. 6 (5): 661–72. DOI : 10.1016 / S0969-2126 (98) 00067-7. PMID 9634703.
- Ericsson J, Edwards PA (июль 1998 г.). «CBP необходим для регулируемой стеролами и регулируемой стерол-регуляторным элементом-связывающим белком транскрипции». Журнал биологической химии. 273 (28): 17865–70. DOI : 10.1074 / jbc.273.28.17865. PMID 9651391.
- Беннетт М.К., Нго Т.Т., Атаникар Дж. Н., Розенфельд Дж. М., Осборн Т.Ф. (май 1999 г.). «Костимуляция промотора гена рецептора липопротеинов низкой плотности белком, связывающим регуляторный элемент стерола, и Sp1 специфически нарушается белком инь-янь 1». Журнал биологической химии. 274 (19): 13025–32. DOI : 10.1074 / jbc.274.19.13025. PMID 10224053.
- Мольдес М., Бойзард М., Лиепвр XL, Фев Б, Дугайль I, Пайро Дж. (Декабрь 1999 г.). «Функциональный антагонизм между ингибитором связывания ДНК (Id) и определением адипоцитов и транс-факторами фактора дифференцировки 1 / стерол-регуляторного элемента-связывающего белка-1c (ADD1 / SREBP-1c) для регуляции промотора синтазы жирных кислот в адипоцитах». Биохимический журнал. 344 Pt 3 (3): 873–80. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3440873. PMC 1220711. PMID 10585876.
- ДеБоз-Бойд Р.А., Браун М.С., Ли В.П., Нохтурффт А., Гольдштейн Д.Л., Эспеншад П.Дж. (декабрь 1999 г.). «Транспортно-зависимый протеолиз SREBP: перемещение протеазы сайта 1 из Гольджи в ER устраняет необходимость в транспорте SREBP в Гольджи». Cell. 99 (7): 703–12. DOI : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81668-2. PMID 10619424.
- Roth G, Kotzka J, Kremer L, Lehr S, Lohaus C, Meyer HE, Krone W, Müller-Wieland D (октябрь 2000 г.). «Киназы MAP Erk1 / 2 фосфорилируют белок, связывающий регуляторный элемент стерола (SREBP) -1a по серину 117 in vitro». Журнал биологической химии. 275 (43): 33302–7. DOI : 10.1074 / jbc.M005425200. PMID 10915800.
- Шимомура И., Мацуда М., Хаммер Р.Э., Башмаков Ю., Браун М.С., Гольдштейн Д.Л. (июль 2000 г.). «Снижение IRS-2 и увеличение SREBP-1c приводят к смешанной инсулинорезистентности и чувствительности в печени липодистрофических мышей и мышей ob / ob». Молекулярная клетка. 6 (1): 77–86. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 00009-5. PMID 10949029.
внешние ссылки
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.