PRDM1

PRDM1
Доступные конструкции PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3DAL
Идентификаторы
Псевдонимы	PRDM1, Blimp1, PRDI-BF1, домен PR 1, PR / домен SET 1
Внешние идентификаторы	OMIM : 603423 MGI : 99655 HomoloGene : 925 GeneCards : PRDM1
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 6 (человек) Группа 6q21 Начинать 105 993 463 п.н. Конец 106 109 939 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 10 (мышь) Группа 10 B2 | 10 23,24 см Начинать 44 437 177 п.н. Конец 44 528 501 п.н.
Паттерн экспрессии РНК Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • Метилтрансферазная активность • Трансферазная активность • Связывание с ДНК • Последовательно-специфическое связывание с ДНК • Связывание гистондеацетилазы • Связывание с ионами металла • GO: 0000980 Цис-регуляторная область РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности связывание ДНК • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфическая для РНК-полимеразы II • Связывание с белком GO: 0001948 • связывание с нуклеиновой кислотой • специфическое для промотора связывание с хроматином • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 ДНК-связывающий фактор транскрипции активность • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая • РНК-полимераза II регуляторной области транскрипции, специфичное для последовательности связывание ДНК • Связывание с ДНК хроматина Сотовый компонент • цитоплазма • ядро • нуклеоплазма Биологический процесс • развитие зародышевых клеток • дифференцировка гигантских клеток трофобласта • развитие сердечной перегородки • обязательство клеточной судьбы • развитие сердечного клапана • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие желудочковой перегородки • развитие кишечных эпителиальных клеток • положительная регуляция дифференцировки B-клеток • развитие эмбриональной плаценты • внутриутробное эмбриональное развитие • негативная регуляция транскрипции с помощью РНК-полимеразы II • постэмбриональное развитие • развитие коронарной сосудистой сети • негативная регуляция экспрессии генов • морфогенез ветвящейся структуры • транскрипция, основанная на ДНК • негативная регуляция сигнального пути, опосредованного липополисахаридами • развитие аорты • метилирование • позитивная регуляция экспрессии генов • развитие материнской плаценты • регуляция пролиферации клеточной популяции • морфогенез артерий • развитие глазных фоторецепторных клеток • пролиферация секретирующих кожный жир клеток • негативная регуляция пролиферации В-клеток • адаптивный иммунный ответ sponse • системный процесс иммунной • регулирование дифференциации естественных клеток - киллеров • регуляция extrathymic дифференцировки Т - клеток • врожденной иммунной реакции • регуляция дифференцировки Т - клеток NK Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	639	12142
Ансамбль	ENSG00000057657	ENSMUSG00000038151
UniProt	O75626	Q60636
RefSeq (мРНК)	NM_001198 NM_182907	NM_007548
RefSeq (белок)	NP_001189 NP_878911	NP_031574
Расположение (UCSC)	Chr 6: 105,99 - 106,11 Мб	Chr 10: 44,44 - 44,53 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

PR-домен цинковый палец-белок 1 или белок-1 созревания, индуцированного В-лимфоцитами ( BLIMP-1), представляет собой белок у людей, кодируемый геном PRDM1, расположенным на хромосоме 6q21. BLIMP-1 экспрессируется как в B, так и в T-клетках и играет важную роль в развитии B-клеток и продукции антител. В В-клетках он является регулятором дифференцировки плазматических клеток. В Т-клетках он имеет решающее значение для дифференцировки большинства терминальных эффекторных клеток в CD 4 и CD8 Т-лимфоциты. Дирижабль-1 действует как репрессор из бета-интерферона экспрессии гена (β-ИФН). Белок специфически связывается с PRDI (элементом положительного регуляторного домена I) промотора гена β-IFN. Транскрипция этого гена увеличивается при индукции вируса.

• 1 Функция
• 2 Развитие В-клеток
• 3 Развитие Т-клеток
• 4 истощение Т-лимфоцитов
• 5 Второй рак после лучевой терапии
• 6 Ссылки
• 7 Дальнейшее чтение
• 8 Внешние ссылки

BLIMP-1 является важным регулятором дифференцировки плазматических клеток. За исключением наивных В-клеток и В-клеток памяти, все секретирующие антитела клетки экспрессируют BLIMP-1 независимо от их местоположения и истории дифференцировки. В отсутствие BLIMP-1 пролиферирующие В-клетки неспособны дифференцироваться в плазматические клетки, что приводит к серьезному снижению продукции всех изотипов иммуноглобулина.

Повышенная экспрессия белка Blimp-1 в В-лимфоцитах, Т-лимфоцитах, NK-клетках и других клетках иммунной системы приводит к иммунному ответу через пролиферацию и дифференцировку плазматических клеток, секретирующих антитела. Blimp-1 также считается «главным регулятором» гемопоэтических стволовых клеток. Другие клетки иммунной системы, такие как моноциты и гранулоциты периферической крови человека, также экспрессируют BLIMP-1. В моноцитарной клеточной линии сверхэкспрессия BLIMP-1 может приводить к дифференцировке в зрелые макрофаги. BLIMP-1 также играет роль в остеокластогенезе, а также в модуляции дендритных клеток.

Как репрессор транскрипции, BLIMP-1 играет критическую роль в основе клона зародышевых клеток мыши, поскольку его нарушение вызывает блокировку на ранних этапах процесса образования первичных зародышевых клеток. BLIMP-1-дефицитные мутантные эмбрионы образуют плотный кластер примерно из 20 первичных зародышевых клеток, подобных клеткам, которые не способны проявлять характерную миграцию, пролиферацию и последовательную репрессию генов гомеобокса, которые обычно сопровождают спецификацию первичных зародышевых клеток. Эксперименты по отслеживанию генетических клонов показывают, что BLIMP-1-положительные клетки, происходящие из клеток проксимального заднего эпибласта, действительно являются предшественниками первичных зародышевых клеток с ограниченным клонированием.

Во время развития B-клеток, B-клетка может дифференцироваться либо в короткоживущие плазматические клетки, либо в B-клетки зародышевого центра после получения надлежащей активации и совместной стимуляции. BLIMP-1 действует как главный ген, регулирующий транскрипционную сеть, которая регулирует терминальную дифференцировку В-клеток. Экспрессия BLIMP-1 тщательно контролируется, поскольку его преждевременная экспрессия в первичных В-клетках приводит к гибели клеток. Таким образом, выжить и дифференцироваться способны только клетки, которые готовы инициировать транскрипцию, управляемую BLIMP-1.

BLIMP-1 играет ключевую роль в поддержании нормального гомеостаза Т-клеток. Он регулирует реакцию Т-клеток посредством репрессии цитокина IL-2 в петле отрицательной обратной связи. Активация Т-клеток приводит к выработке ИЛ-2. Затем передача сигналов IL-2 приводит к транскрипции PRDM1, а BLIMP-1 отвечает за репрессию транскрипции гена IL-2.

BLIMP-1 помогает продуцированию короткоживущих эффекторных Т-клеток и клонально истощенных Т-клеток. Это также помогает с миграцией Т-клеток из селезенки и лимфатических узлов в периферические ткани. Однако BLIMP-1 не способствует производству долгоживущих эффекторных клеток памяти. BLIMP-1 позволяет продуцировать некоторые более долгоживущие эффекторные клетки памяти, но его отсутствие позволяет генерировать клетки долговременной центральной памяти, которые, как считается, имеют более высокий потенциал пролиферации при вторичном заражении.

Исследование ассоциации генома определил два генетических вариаций вблизи гена PRDM1, которые предсказывают повышенную вероятность развития рака второй после лучевой терапии для лимфомы Ходжкина.

• Хуан С. (июль 1994 г.). «Blimp-1 является мышиным гомологом репрессора транскрипции человека PRDI-BF1». Cell. 78 (1): 9. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (94) 90565-7. PMID   8033216. S2CID   34007883.
• Мок Б.А., Лю Л., ЛеПаслиер Д., Хуанг С. (октябрь 1996 г.). «Фактор транскрипции BLIMP1 / PRDI-BF1, способствующий созреванию В-лимфоцитов, отображается на D6S447 на хромосоме 6q21-q22.1 человека и в синтенической области хромосомы 10 мыши». Геномика. 37 (1): 24–8. DOI : 10.1006 / geno.1996.0516. PMID   8921366.
• Рен Б., Чи К.Дж., Ким Т.Х., Маниатис Т. (январь 1999 г.). «Репрессия PRDI-BF1 / Blimp-1 опосредуется корепрессорами из семейства белков Groucho». Гены и развитие. 13 (1): 125–37. DOI : 10.1101 / gad.13.1.125. PMC   316372. PMID   9887105.
• Анжелин-Дюкло С., Катторетти Дж., Лин К.И., Каламе К. (ноябрь 2000 г.). «Приверженность В-лимфоцитов судьбе плазматических клеток связана с экспрессией Blimp-1 in vivo». Журнал иммунологии. 165 (10): 5462–71. DOI : 10.4049 / jimmunol.165.10.5462. PMID   11067898.
• Гупта С., Энтони А., Пернис А.Б. (май 2001 г.). «Этап-специфическая модуляция функции IFN-регуляторного фактора 4 белками цинкового пальца типа Krüppel». Журнал иммунологии. 166 (10): 6104–11. DOI : 10.4049 / jimmunol.166.10.6104. PMID   11342629.
• Medina F, Segundo C, Campos-Caro A, González-García I, Brieva JA (март 2002 г.). «Неоднородность, демонстрируемая человеческими плазматическими клетками миндалин, крови и костного мозга, выявляет ступенчатые стадии увеличения зрелости, но локальные профили экспрессии молекул адгезии». Кровь. 99 (6): 2154–61. DOI : 10.1182 / blood.V99.6.2154. PMID   11877292.
• Shaffer AL, Lin KI, Kuo TC, Yu X, Hurt EM, Rosenwald A, et al. (Июль 2002 г.). «Blimp-1 управляет дифференцировкой плазматических клеток, подавляя программу экспрессии гена зрелых В-клеток». Иммунитет. 17 (1): 51–62. DOI : 10.1016 / S1074-7613 (02) 00335-7. PMID   12150891.
• Васанвала Ф.Х., Кусам С., Тони Л.М., Дент А.Л. (август 2002 г.). «Подавление функции AP-1: механизм регуляции экспрессии Blimp-1 и дифференцировки B-лимфоцитов протоонкогеном B-клеточной лимфомы-6». Журнал иммунологии. 169 (4): 1922–9. DOI : 10.4049 / jimmunol.169.4.1922. PMID   12165517.
• Борсон Н.Д., Лейси М.К., Веттштейн П.Дж. (декабрь 2002 г.). «Измененная экспрессия мРНК Pax5 и Blimp-1 в В-клетках при множественной миеломе». Кровь. 100 (13): 4629–39. DOI : 10.1182 / blood.V100.13.4629. PMID   12453881.
• Дьёри И., Фейер Г., Гош Н., Сето Э., Райт К.Л. (март 2003 г.). «Идентификация функционально нарушенного репрессора транскрипции фактора 1 связывания позитивного регуляторного домена I в клеточных линиях миеломы». Журнал иммунологии. 170 (6): 3125–33. DOI : 10.4049 / jimmunol.170.6.3125. PMID   12626569.
• Дьори И., Ву Дж., Фейер Дж., Сето Э., Райт К.Л. (март 2004 г.). «PRDI-BF1 привлекает гистоновую H3-метилтрансферазу G9a для подавления транскрипции». Иммунология природы. 5 (3): 299–308. DOI : 10.1038 / ni1046. PMID   14985713. S2CID   33178299.
• Lotz C, Mutallib SA, Oehlrich N, Liewer U, Ferreira EA, Moos M, et al. (Июль 2005 г.). «Нацеливание на факторы транскрипции фактора 1, связывающего положительный регуляторный домен I, и факторов транскрипции белка 1, связывающего X-бокс, с помощью множественных миеломно-реактивных CTL». Журнал иммунологии. 175 (2): 1301–9. DOI : 10.4049 / jimmunol.175.2.1301. PMID   16002735.
• Там В., Гомес М., Чадберн А., Ли Дж. В., Чан В. К., Ноулз Д. «Мутационный анализ PRDM1 указывает на роль супрессора опухолей в диффузных больших B-клеточных лимфомах». Кровь. 107 (10): 4090–100. DOI : 10.1182 / кровь-2005-09-3778. PMID   16424392.
• Паскуалуччи Л., Компаньо М., Хулдсворт Дж., Монти С., Грюн А., Нандула С.В. и др. (Февраль 2006 г.). «Инактивация гена PRDM1 / BLIMP1 при диффузной В-клеточной лимфоме». Журнал экспериментальной медицины. 203 (2): 311–7. DOI : 10,1084 / jem.20052204. PMC   2118216. PMID   16492805.
• Гонсалес-Гарсия I, Оканья Э., Хименес-Гомес Дж., Кампос-Каро А., Бриева Дж. А. (апрель 2006 г.). «Вызванное иммунизацией нарушение пула плазматических клеток крови человека: прогрессирующее созревание, чувствительность к IL-6 и высокая экспрессия PRDI-BF1 / BLIMP1 являются критическими различиями между антиген-специфическими и неспецифическими плазматическими клетками». Журнал иммунологии. 176 (7): 4042–50. DOI : 10.4049 / jimmunol.176.7.4042. PMID   16547239.
• Гарсия Дж. Ф., Ронкадор Дж., Гарсия Дж. Ф., Санц А. И., Маэстре Л., Лукас Э. и др. (Апрель 2006 г.). «Экспрессия PRDM1 / BLIMP-1 в множественных В- и Т-клеточных лимфомах». Haematologica. 91 (4): 467–74. PMID   16585013.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу К., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руаль Дж. Ф. и др. (Май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Cell. 125 (4): 801–14. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID   16713569. S2CID   13709685.

• PRDM1 + ​​белок, + человек по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)
• FactorBook PRDM1

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, который находится в общественном достоянии.