Войти
| Отрицательный фактор, (F-белок) или структура Nef | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 ЯМР белка NEF на основе PDB : 2NEF координаты. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | F-белок | ||||||||
| Pfam | PF00469 | ||||||||
| InterPro | IPR001558 | ||||||||
| SCOPe | 1avv / SUPFAM | ||||||||
| OPM суперсемейство | 269 | ||||||||
| OPM белок | 2nef | ||||||||
| |||||||||
Nef (отрицательный регуляторный фактор) представляет собой небольшой миристоилированный белок массой 27-35 кДа, кодируемый лентивирусами приматов. К ним относятся вирусы иммунодефицита человека (ВИЧ-1 и ВИЧ-2) и вирус иммунодефицита обезьян (SIV). Nef локализуется в основном в цитоплазме, но также частично в плазматической мембране (PM) и является одним из многих патоген-экспрессируемых белков, известных как вирулентность. факторы, которые действуют для манипулирования клеточными механизмами хозяина и, таким образом, позволяют инфицирование, выживание или репликацию патогена. Nef означает «отрицательный фактор», и, хотя его часто считают незаменимым для репликации ВИЧ-1, у инфицированных хозяев вирусный белок заметно повышает титры вируса.
Экспрессия Nef на ранних этапах жизненного цикла вируса обеспечивает T- активация клетки и установление устойчивого состояния инфекции, два основных атрибута инфекции ВИЧ. Вирусная экспрессия Nef вызывает многочисленные изменения в инфицированной клетке, включая модуляцию экспрессии белка на поверхности клетки, ремоделирование цитоскелета и передачу сигнала. Поскольку состояние активации инфицированной клетки играет важную роль в успешности инфицирования ВИЧ-1, важно, чтобы покоящиеся Т-клетки были примированы для ответа на стимулы Т-клеточного рецептора (TCR). Nef ВИЧ-1 снижает порог активации лимфоцитов CD4, но этого недостаточно, чтобы вызвать активацию в отсутствие экзогенных стимулов.
Путем подавления экспрессии CD4 на клеточной поверхности и Lck, Nef создает узкую реакцию TCR, которая, вероятно, оптимизирует продукцию вируса ВИЧ-1 и генерирует восприимчивую популяцию клеток для дальнейшего заражения. Nef перенаправляет киназно-активные Lck с плазматической мембраны на ранние и рециклирующие эндосомы (RE), а также в сеть Транс-Гольджи (TGN). Субпопуляции Lck, ассоциированные с RE / TGN, в клетках, экспрессирующих Nef, находятся в каталитически активной конформации и, следовательно, компетентны в передаче сигналов. В то время как передача сигналов TCR происходит на плазматической мембране (PM), активация Ras - GTPase происходит во внутриклеточных компартментах, включая аппарат Гольджи. Nef-индуцированное обогащение активных Lck в этих компартментах приводит к увеличению локальной активности RAS и усиленной активации киназы Erk и продукции интерлейкина-2 (IL-2). Поскольку известно, что IL-2 активирует рост, пролиферацию и дифференцировку Т-клеток, чтобы стать эффекторными Т-клетками; это корыстный эффект, который создает новую популяцию клеток, которые может инфицировать ВИЧ-1. Самоактивация инфицированной клетки IL-2 также стимулирует клетку к превращению в эффекторную клетку и запускает механизм, на который ВИЧ-1 полагается для своей собственной пролиферации.
Для дальнейшего уклонения от иммунного ответа хозяина Nef подавляет клеточную поверхность и общую экспрессию отрицательного иммуномодулятора CTLA-4, нацеливая белок на лизосомальный деградация. В отличие от CD28, который активирует Т-клетки, CTLA-4 по существу является «выключателем», который подавлял бы продукцию вируса, если бы он был активирован. Лентивирусы, такие как ВИЧ-1, приобрели белки, такие как Nef, которые выполняют широкий спектр функций, включая идентификацию CTLA-4 до того, как он достигнет ПМ, и пометку его для разложения. Также известно, что Nef фосфорилирует и инактивирует Bad, проапоптотический член семейства Bcl-2, таким образом защищая инфицированные клетки от апоптоз.
Считается, что ремоделирование цитоскелета снижает передачу сигналов TCR во время ранней инфекции и также в некоторой степени модулируется Nef. Ремоделирование актина обычно модулируется кофилином, расщепляющим актин фактором. Nef способен связываться с клеточной киназой PAK2, которая фосфорилирует и инактивирует кофилин и препятствует ранней передаче сигналов TCR.
Когорта Сиднейского банка крови (SBBC) представляла собой группу из восьми пациентов, у которых не было симптомов через много лет после первоначального инфицирования при переливании крови от инфицированного донора. Более поздние анализы показали, что штамм вируса был вариантом с удаленным Nef.
Вакцина от вируса с удаленным Nef не испытывалась на людях, хотя она была успешно протестирована на макаках-резус.
