Фарнезоидный рецептор X

редактировать

NR1H4

Доступные структуры

Поиск по ортологу: PDBe RCSB

Список PDB идентификационные коды
1OSH, 3BEJ, 3DCT, 3DCU, 3FLI, 3FXV, 3GD2, 3HC5, 3HC6, 3L1B, 3OKH, 3OKI, 3OLF, 3OMK, 3OMM, 3OOF, 3OOK, 3RUT, 3RUU, 3RVF, 3P88, 3P89, 4OIV, 4WVD, 4QE6, 4QE8

Идентификаторы

Псевдонимы

NR1H4, BAR, FXR, HRR-1, HRR1, RIP14, член 4 группы H подсемейства ядерных рецепторов 1, PFIC5

Внешние идентификаторы

OMIM: 603826 MGI: 1352464 HomoloGene: 3760 GeneCard: NR1H4

Расположение гена (человек)

Chr.	Хромосома 12 (человек)

Полоса	12q23.1	Начало	100,473,708 bp
Полоса	12q23.1	конец	100,564,414 bp

Местоположение гена ( Мышь)

Chr.	Хромосома 10 (мышь)

Группа	10 C2 \| 10 44,98 см	Начало	89,454,234 bp
Группа	10 C2 \| 10 44,98 см	Конец	89,533,585 bp

Экспрессия РНК паттерн

Дополнительные справочные данные по экспрессии

Онтология генов
Молекулярная функция	•GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II. •специфичное для последовательности связывание ДНК. •связывание ДНК. •GO: 0001106 корепрессорная активность транскрипции. •GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции. •GO: 0001105 транскрипция коактиваторная активность. •связывание с ионом цинка. •GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 ДНК-связывающая активность активатора транскрипции, специфическая для РНК-полимеразы II. •связывание с ионами металлов. •связывание рецептора ретиноида X. •активность рецептора стероидного гормона. •связывание желчной кислоты. •GO: 0001948 связывание с белком. •лиганд-зависимое связывание ядерного рецептора. •активность фактора транскрипции, дистальная энхансерная последовательность РНК-полимеразы II-s специфическое связывание. •связывание хенодезоксихолевой кислоты. •связывание ДНК, специфичное для последовательности регуляторной области транскрипции. •связывание ДНК регуляторной области РНК-полимеразы II, специфичное для последовательности. •GO: 0038050, GO: 0004886, GO: 0038051, активность ядерного рецептора. •активность рецептора желчных кислот. •GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, РНК-полимераза II-специфическая. •связывание фактора транскрипции. •лиганд-зависимая активность коактиватора транскрипции ядерного рецептора. •активность сигнального рецептора.
клеточный компонент	•ядерный эухроматин. •нуклеоплазма. •клеточное ядро . •комплекс факторов транскрипции РНК-полимераза II.
биологический процесс	•сигнальный путь Notch. •гомеостаз клеточного триглицерида. •клеточный ответ на азоторганическое соединение. •регуляция секреции инсулина, участвующая в клеточном ответе на стимул глюкозы. •позитивная регуляция цикла ассимиляции аммиака. •сигнальный путь толл-подобного рецептора 4. •иммунная система процесс. •метилирование гистона H3-R17. •регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •негативная регуляция секреции интерферона-гамма. •позитивная регуляция процесса метаболизма глутамата. •путь передачи сигнала внутриклеточного рецептора желчных кислот. •негативная регуляция апоптотического процесса. •негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •транскрипция, ДНК-шаблон. •регуляция клиренса липопротеинов низкой плотности. •регуляция процесса биосинтеза желчных кислот. •регуляция процесса метаболизма холестерина. •регуляция метаболического процесса мочевины. •сигнальный путь внутриклеточного рецептора. •отрицательная регуляция процесса биосинтеза желчных кислот. •клеточный ответ на жирные кислоты. •транспорт желчных кислот и солей желчных кислот. •азот катаболитная активация транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •отрицательная регуляция секреции фактора некроза опухоли. •секреция интерлейкина-17. •инициация транскрипции с Промотор РНК-полимеразы II. •воспалительный ответ. •врожденная иммунная система. •передача сигнала. •сигнальный путь, опосредованный стероидным гормоном. •гомеостаз жирных кислот. •положительная регуляция сигнального пути рецептора инсулина. •клеточный ответ на липополисахарид. •негативная регуляция выработки интерлейкина-2. •позитивная регуляция секреции инсулина, участвующая в клеточном ответе на стимул глюкозы. •негативная регуляция воспалительного ответа. •гомеостаз глюкозы. •негативная регуляция фактора транскрипции NF-kappaB активность. •позитивная регуляция развития жировой ткани. •сборка межклеточных соединений. •сигнальный путь толл-подобного рецептора 9. •негативная регуляция продукции хемотаксического белка-1 моноцитами. •метаболический процесс желчных кислот. •отрицательная регуляция передачи сигналов I-kappaB / NF-kappaB. •отрицательная регуляция сигнального пути, опосредованного фактором некроза опухоли. •защитный ответ на бактерию. •отрицательная регуляция i Продукция нтерлейкина-1. •отрицательная регуляция продукции фактора некроза опухоли. •отрицательная регуляция продукции интерлейкина-6. •гомеостаз триглицеридов. •отрицательная регуляция продукции интерферона-гамма. •регуляция транскрипции, по шаблону ДНК. •сигнальный путь желчных кислот. •позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II. •позитивная регуляция процесса биосинтеза фосфатидных кислот. •гомеостаз холестерина. •метаболизм липидов. •развитие многоклеточного организма. •дифференцировка клеток. •липидный гомеостаз. •клеточный гомеостаз глюкозы.
Источники: Amigo / QuickGO

Orthologs

Species

Human

Mouse

Entrez


9971


20186

Ensembl


ENSG00000012504


ENSMUSG00000047638

UniProt


Q96RI1


Q60641

RefSeq (mRNA)

NM_001206977 <42069_008>NM_001>NM_001206992. NM_001206993.
NM_005123


NM_001163504. NM_001163700. NM_009108

RefSeq (белок)

NP_001193906. NP_001193907. NP_001193908. NP_001193921. NP_001193922.
NP_005114. NP_001193906.1. NP_001193_908.1


NP_49517234>NP_001193908.1

NP_4957311569 Местоположение (UCSC)

Chr 12: 100,47 - 100,56 Мб

Chr 10: 89,45 - 89,53 Мб

PubMed поиск

Викиданные

Просмотр / редактирование человека

Просмотр / редактирование мыши

рецептор желчной кислоты (BAR ), также известный как рецептор фарнезоида X (FXR ) или NR1H4 (подсемейство ядерных рецепторов 1, группа H, член 4) представляет собой ядерный рецептор, который кодируется геном NR1H4 у человека.

Содержание

1 Функция
2 Взаимодействия
3 лиганды
4 ссылки
5 Дополнительная литература
6 Внешние ссылки

Функция

FXR экспрессируется на высоких уровнях в печени и кишечнике. Хенодезоксихолевая кислота и другие желчные кислоты являются природными лигандами для FXR. Подобно другим ядерным рецепторам, при активации FXR перемещается в клеточное ядро , образует димер (в данном случае гетеродимер с RXR ) и связывается с гормональные ответные элементы на ДНК, которые повышают или понижают экспрессию определенных генов.

Одной из основных функций активации FXR является подавление альфа-гидроксилазы холестерина 7 (CYP7A1), фермент, ограничивающий скорость синтеза желчных кислот из холестерина. FXR не связывается напрямую с промотором CYP7A1. Скорее, FXR индуцирует экспрессию малого гетеродимерного партнера (SHP), который затем действует, чтобы ингибировать транскрипцию гена CYP7A1. Таким образом, устанавливается путь отрицательной обратной связи, в котором синтез желчных кислот ингибируется, когда клеточные уровни уже высоки.

FXR также оказался важным в регуляции уровней триглицеридов в печени. В частности, активация FXR подавляет липогенез и способствует окислению свободных жирных кислот посредством активации PPARα. Исследования также показали, что FXR регулирует экспрессию и активность эпителиальных транспортных белков, участвующих в гомеостазе жидкости в кишечнике, таких как регулятор трансмембранной проводимости при муковисцидозе (CFTR).

Активация FXR у мышей с диабетом снижает уровень глюкозы в плазме и улучшает чувствительность к инсулину, тогда как инактивация FXR имеет противоположный эффект.

Взаимодействия

рецептор фарнезоида X взаимодействуют с:

Лигандами

Известен ряд лигандов для FXR, из как естественного, так и синтетического происхождения.

Агонисты

Антагонисты

Гуггулстерон

Ссылки

Дополнительная литература

Внешние ссылки

«Фарнезоидный рецептор X (NR1H4)». Ресурс ядерного рецептора. Архивировано с оригинального 12 января 2015 года. Проверено 12 января 2015.
фарнезоид + X-активированный + рецептор в Национальной медицинской библиотеке США Медицинские предметные рубрики (MeSH)

Последняя правка сделана 2021-05-20 11:12:36

Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).

Обратная связь: support@alphapedia.ru

Соглашение

О проекте