Филамин A, альфа (FLNA ) - это белок, который кодируется у человека геном FLNA .
Актин-связывающий белок, или филамин, представляет собой белок массой 280 кДа, который перекрестно связывает актиновые филаменты в ортогональные сети в кортикальной цитоплазме и участвует в закреплении мембранных белков для актинового цитоскелета. Ремоделирование цитоскелета играет центральную роль в модуляции формы и миграции клеток. Филамин А, кодируемый геном FLNA, представляет собой широко экспрессируемый филамин, который регулирует реорганизацию актинового цитоскелета путем взаимодействия с интегринами, трансмембранными рецепторными комплексами и вторичными мессенджерами. [Предоставлено OMIM]
Структура белка включает актин связывающий N-концевой домен, 24 внутренних повтора и 2 шарнирные области.
Было показано, что филамин взаимодействует с:
Отредактированный остаток был ранее записан как однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в dbSNP.
A - I катализируется семейство аденозиндезаминаз, действующих на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре-мРНК и дезаминируют их до инозина. Инозины распознаются механизмом трансляции клеток как гуанозин. Есть три члена семейства ADAR, ADAR 1-3, причем ADAR 1 и ADAR 2 являются единственными ферментативно активными членами. Считается, что ADAR3 играет регулирующую роль в мозге. ADAR1 и ADAR 2 широко экспрессируются в тканях, в то время как ADAR 3 ограничивается мозгом. Двухцепочечные области РНК образуются спариванием оснований между остатками в области, комплементарной области сайта редактирования. Эта комплементарная область обычно находится в соседнем интроне, но также может располагаться в экзонной последовательности. Область, которая образует пары оснований с областью редактирования, известна как редактируемая дополняющая последовательность (ECS).
Один сайт редактирования пре-мРНК FLNA расположен в пределах аминокислоты 2341 конечного белка. Кодон глутамина (Q) изменен из-за сайт-специфического дезаминирования аденозина в сайте редактирования до кодона аргинина (R). Предполагается, что область редактирования будет образовывать двухцепочечную область длиной 32 пары оснований с комплементарной последовательностью примерно на 200 нуклеотидов ниже по ходу от сайта редактирования. Этот ECS находится в интронной последовательности. Редактирование на сайте Q / R, вероятно, будет включать как ADAR1, так и ADAR2. Нокауты ADAR2 на мышах показывают уменьшение редактирования на сайте Q / R. Двойные вычеркивания ADAR1 не влияют на редактирование.
Отредактированный аденозин находится в 22 иммуноглулиноподобном повторе белка. Эта область представляет собой связывающий домен интегрина β и связывающий домен RAC1. Замена аминокислоты, вероятно, повлияет на электростатический потенциал связывающих доменов. Сайт редактирования FLNA - это 2 нуклеотида от сайта сплайсинга, такого как R / G-сайт GluR-2. Оба транскрипта имеют 7/8 идентичных нуклеотидов вокруг сайтов редактирования. Поскольку широко распространено мнение, что редактирование на сайте GLUR-2 Q / R влияет на сплайсинг, сходство последовательности и сайта редактирования может означать, что редактирование на сайте FLNA может также регулировать сплайсинг. Эксперименты с gluR-2 in vitro показали, что присутствие ADAR2 приводит к ингибированию сплайсинга. Анализ данных EST для FLNA показывает, что существует связь между редактированием последнего кодона экзона и сохранением следующего интрона.
Изменение электростатического потенциала, вероятно, повлияет на связывание FLNA ко многим белкам, с которыми она взаимодействует.