FLNA

редактировать
FLNA
Белок FLNA PDB 2aav.png
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы FLNA, A BP-280, ABPX, CSBS, CVD1, FLN, FLN-A, FLN1, FMD, MNS, NHBP, OPD, OPD1, OPD2, XLVD, XMVD, filamin A, FGS2
Внешние идентификаторыOMIM: 300017 MGI: 95556 HomoloGene: 1119 Генные карты: FLNA
Расположение гена (человек)
X-хромосома (человека)
Chr. Х-хромосома (человек)
X-хромосома (человека) Местоположение генома для FLNA Местоположение генома для FLNA
Полоса Xq28Начало154,348,524 bp
Конец154,374,638 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE FLNA 214752 x at fs.png .. PBB GE FLNA 200859 x at fs.png .. PBB GE FLNA 213746 s at fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
SpeciesHumanMouse
Entrez

2316

192176

Ensembl

ENSG00000196924

ENSMUSG00000031328

UniProt

P21333

Q8BTM8

RefSeq (мРНК)

NM_001110556. NM_001456

NM_001290421 <104227Se>(белок) NM_001290421>NP_001104026. NP_001447

NP_001277350. NP_034357

Местоположение (UCSC)Chr X: 154,35 - 154,37 Мб Chr X: 74,22 - 74,25 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Филамин A, альфа (FLNA ) - это белок, который кодируется у человека геном FLNA .

Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Структура
  • 3 Взаимодействия
  • 4 Редактирование РНК
    • 4.1 Тип
    • 4.2 Сайт
    • 4.3 Структура
    • 4.4 Функция
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
  • 7 Внешние ссылки
Функция

Актин-связывающий белок, или филамин, представляет собой белок массой 280 кДа, который перекрестно связывает актиновые филаменты в ортогональные сети в кортикальной цитоплазме и участвует в закреплении мембранных белков для актинового цитоскелета. Ремоделирование цитоскелета играет центральную роль в модуляции формы и миграции клеток. Филамин А, кодируемый геном FLNA, представляет собой широко экспрессируемый филамин, который регулирует реорганизацию актинового цитоскелета путем взаимодействия с интегринами, трансмембранными рецепторными комплексами и вторичными мессенджерами. [Предоставлено OMIM]

Структура

Структура белка включает актин связывающий N-концевой домен, 24 внутренних повтора и 2 шарнирные области.

Взаимодействия

Было показано, что филамин взаимодействует с:

Редактирование РНК

Отредактированный остаток был ранее записан как однонуклеотидный полиморфизм (SNP) в dbSNP.

Тип

A - I катализируется семейство аденозиндезаминаз, действующих на РНК (ADAR), которые специфически распознают аденозины в двухцепочечных областях пре-мРНК и дезаминируют их до инозина. Инозины распознаются механизмом трансляции клеток как гуанозин. Есть три члена семейства ADAR, ADAR 1-3, причем ADAR 1 и ADAR 2 являются единственными ферментативно активными членами. Считается, что ADAR3 играет регулирующую роль в мозге. ADAR1 и ADAR 2 широко экспрессируются в тканях, в то время как ADAR 3 ограничивается мозгом. Двухцепочечные области РНК образуются спариванием оснований между остатками в области, комплементарной области сайта редактирования. Эта комплементарная область обычно находится в соседнем интроне, но также может располагаться в экзонной последовательности. Область, которая образует пары оснований с областью редактирования, известна как редактируемая дополняющая последовательность (ECS).

Сайт

Один сайт редактирования пре-мРНК FLNA расположен в пределах аминокислоты 2341 конечного белка. Кодон глутамина (Q) изменен из-за сайт-специфического дезаминирования аденозина в сайте редактирования до кодона аргинина (R). Предполагается, что область редактирования будет образовывать двухцепочечную область длиной 32 пары оснований с комплементарной последовательностью примерно на 200 нуклеотидов ниже по ходу от сайта редактирования. Этот ECS находится в интронной последовательности. Редактирование на сайте Q / R, вероятно, будет включать как ADAR1, так и ADAR2. Нокауты ADAR2 на мышах показывают уменьшение редактирования на сайте Q / R. Двойные вычеркивания ADAR1 не влияют на редактирование.

Структура

Отредактированный аденозин находится в 22 иммуноглулиноподобном повторе белка. Эта область представляет собой связывающий домен интегрина β и связывающий домен RAC1. Замена аминокислоты, вероятно, повлияет на электростатический потенциал связывающих доменов. Сайт редактирования FLNA - это 2 нуклеотида от сайта сплайсинга, такого как R / G-сайт GluR-2. Оба транскрипта имеют 7/8 идентичных нуклеотидов вокруг сайтов редактирования. Поскольку широко распространено мнение, что редактирование на сайте GLUR-2 Q / R влияет на сплайсинг, сходство последовательности и сайта редактирования может означать, что редактирование на сайте FLNA может также регулировать сплайсинг. Эксперименты с gluR-2 in vitro показали, что присутствие ADAR2 приводит к ингибированию сплайсинга. Анализ данных EST для FLNA показывает, что существует связь между редактированием последнего кодона экзона и сохранением следующего интрона.

Функция

Изменение электростатического потенциала, вероятно, повлияет на связывание FLNA ко многим белкам, с которыми она взаимодействует.

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-20 07:57:25
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте