Oct-4

редактировать
POU5F1
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы POU5F1, OCT3, OCT4, OTF-3, OTF3, OTF4, Oct-3, Oct-4, POU class 5 homeobox 1
Внешние идентификаторыOMIM: 164177 MGI: 101893 HomoloGene: 8422 Генные карты: POU5F1
Местоположение гена (человек)
Хромосома 6 (человека)
Chr. Хромосома 6 (человек)
Хромосома 6 (человека) Геномное расположение POU5F1 Геномное расположение POU5F1
Полоса 6p21.33Начало31,164,337 bp
Конец31,180,731 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE POU5F1 208286 x при fs.png .. PBB GE POU5F1 210265 x в fs.png .. PBB GE POU5F1 210905 x при fs.png
Дополнительные справочные данные по экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

5460

18999

Ensembl

ENSMUSG00000024406

UniProt

Q01860

P20263

RefSeq (mRNA)

NM_203289. NM_0011_123531007007>NM_001173531007008 294>NM_001252452. NM_013633

RefSeq (белок)

NP_001239381. NP_038661

Местоположение (UCSC)Chr 6: 31,16 - 31,18 Мб Chr 17: 35,51 - 35,51 Мб
PubMed поиск
Wikidata
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Oct-4 (октамер связывающий фактор транскрипции 4), также известный как POU5F1 (домен POU, класс 5, фактор транскрипции 1), представляет собой белок, который у человека кодируется геном POU5F1 . Oct-4 представляет собой фактор транскрипции гомеодомена семейства POU. Он критически участвует в самообновлении недифференцированных эмбриональных стволовых клеток. По существу, он часто используется в качестве маркера для недифференцированных клеток. Экспрессия Oct-4 должна строго регулироваться; слишком много или слишком мало вызовет дифференцировку клеток.

Octamer-связывающий фактор транскрипции 4, OCT-4, представляет собой белок фактора транскрипции, который кодируется геном Pou5f1 и является частью POU (Pit- Oct-Unc) семья. OCT-4 состоит из мотива октамера, определенной последовательности ДНК AGTCAAAT, которая связывается с их генами-мишенями и активирует или деактивирует определенные выражения. Эти экспрессии генов затем приводят к фенотипическим изменениям дифференцировки стволовых клеток во время развития эмбриона млекопитающего. Он играет жизненно важную роль в определении судьбы как внутренних массовых клеток, так и эмбриональных стволовых клеток и обладает способностью поддерживать плюрипотентность на протяжении всего эмбрионального развития. Недавно было отмечено, что OCT-4 не только поддерживает плюрипотентность в эмбриональных клетках, но также обладает способностью регулировать пролиферацию раковых клеток и может быть обнаружен при различных раковых заболеваниях, таких как опухоли поджелудочной железы, легких, печени и яичек половых клеток во взрослых половых клетках.. Другой дефект, который может иметь этот ген, - это диспластический рост в эпителиальных тканях, который вызван недостатком OCT-4 в эпителиальных клетках.

Содержание
  • 1 Экспрессия и функция
  • 2 Ортологи
  • 3 Структура
  • 4 Последствия заболевания
  • 5 Плюрипотентность в развитии эмбриона
    • 5.1 Модель на животных
  • 6 Роль в репрограммировании
  • 7 В эмбриональных стволовых клетках
  • 8 Во взрослых стволовых клетках
  • 9 См. Также
  • 10 Ссылки
  • 11 Дополнительная литература
  • 12 Внешние ссылки
Экспрессия и функция

Фактор транскрипции Oct-4 изначально активен как материнский фактор в ооцит и остается активным в эмбрионах на протяжении всего доимплантационного периода. Экспрессия Oct-4 связана с недифференцированным фенотипом и опухолями. Нокдаун гена Oct-4 способствует дифференцировке, демонстрируя роль этих факторов в самообновлении эмбриональных стволовых клеток человека. Oct-4 может образовывать гетеродимер с Sox2, так что эти два белка связывают ДНК вместе.

Эмбрионы мыши, дефицитные по Oct-4 или имеющие низкие уровни экспрессии Oct-4, не могут формируют внутреннюю клеточную массу, теряют плюрипотентность и дифференцируются в трофэктодерму. Следовательно, уровень экспрессии Oct-4 у мышей жизненно важен для регуляции плюрипотентности и ранней дифференцировки клеток, поскольку одна из его основных функций - удерживать эмбрион от дифференцировки.

Ортологи

Ортологи Oct-4 у людей и других видов включают:

ВидEntrez GeneIDХромосомаМестоположениеRefSeq (мРНК)RefSeq (белок)
Mus musculus (мышь)18999 17,17 B1; 17 19,23 смNC_000083.4, 35114104..35118822 (Plus Strand)NM_013633.1 NP_038661.1
Homo sapiens (человек)5460 6, 6p21.31NC_000006.10, 31246432-31240107 (минус Strand)NM_002701.3 NP_002692.2 (полноразмерная изоформа). NP_002692.1 (N-концевая усеченная изоформа)
Rattus norvegicus (крыса)294562 20NW_001084776, 650467-655015 (минус-цепь)NM_001009178 NP_001009178
Данио рерио (рыба данио)303333 21NC_007127.1, 27995548-28000317 (Минус-прядь)NM_131112 NP_571187
Структура

Oct-4 содержит следующее белковые домены :

ДоменОписаниеДлина (AA)
Домен POU Обнаружен в факторах транскрипции Pit-Oct-Unc75
Гомеодомен ДНК-связывающие домены, участвующие в регуляции транскрипции ключевых процессов развития эукариот; может связываться с ДНК в виде мономеров или гомодимеров и / или гетеродимеров специфическим для последовательности образом.59
Влияние на заболевание

Oct-4 участвует в онкогенезе взрослых зародышей клетки. Было обнаружено, что эктопическая экспрессия фактора у взрослых мышей вызывает образование диспластических поражений кожи и кишечника. Дисплазия кишечника возникла в результате увеличения популяции клеток-предшественников и усиления транскрипции β-катенина за счет ингибирования клеточной дифференцировки.

Плюрипотентность в развитии эмбриона

Модель на животных

В 2000 году Нива и др. использовали условную экспрессию и репрессию в мышиных эмбриональных стволовых клетках для определения потребности в Oct-4 для поддержания способности к развитию. Хотя определение транскрипции часто рассматривается как бинарная система контроля включения-выключения, они обнаружили, что точный уровень Oct-4 управляет 3 разными судьбами ES-клеток. Увеличение экспрессии менее чем в 2 раза вызывает дифференцировку в примитивную энтодерму и мезодерму. Напротив, репрессия Oct-4 вызывает потерю плюрипотентности и дедифференцировку трофэктодермы. Таким образом, критическое количество Oct-4 необходимо для поддержания самообновления стволовых клеток, а повышающая или понижающая регуляция индуцирует дивергентные программы развития. Изменения уровней Oct-4 не вызывают независимой дифференцировки, но также контролируются уровнями Sox2. Снижение Sox2 сопровождает повышенные уровни Oct-4, способствуя мезендодермальной судьбе, при этом Oct-4 активно ингибирует эктодермальную дифференцировку. Подавленные уровни Oct-4, которые приводят к эктодермальной дифференцировке, сопровождаются увеличением Sox2, который эффективно ингибирует мезэндодермальную дифференцировку. Niwa et al. предположили, что их находки установили роль Oct-4 как главного регулятора плюрипотентности, который контролирует приверженность клонов, и продемонстрировали сложность критических регуляторов транскрипции и, как следствие, важность количественного анализа.

Факторы транскрипции Oct-4, Sox2 и Nanog являются частью сложной регуляторной сети с Oct-4 и Sox2, способной напрямую регулировать Nanog путем связывания с его промотором, и необходимы для поддержания самообновляющейся недифференцированной состояние внутренней клеточной массы бластоцисты, линии эмбриональных стволовых клеток (которые представляют собой клеточные линии, полученные из внутренней клеточной массы) и индуцированные плюрипотентные стволовые клетки. Хотя было показано, что дифференциальная повышающая и понижающая регуляция Oct-4 и Sox2 способствует дифференцировке, для продолжения дифференцировки должна происходить понижающая регуляция Nanog.

Роль в перепрограммировании

Oct- 4 является одним из факторов транскрипции, используемых для создания индуцированных плюрипотентных стволовых клеток (ИПСК), вместе с Sox2, Klf4 и часто c- Myc (OSKM) у мыши, демонстрируя его способность вызывать состояние, подобное эмбриональным стволовым клеткам. Эти факторы часто называют «факторами перепрограммирования Яманаки». Этот эффект перепрограммирования также наблюдался с возвращением человеческих фибробластных клеток в ИПСК через Oct-4 вместе с Sox2, Nanog и. Использование факторов репрограммирования Томсона позволяет избежать избыточной экспрессии онкогена c-Myc. Позже было определено, что только двух из этих четырех факторов, Oct4 и Klf4, было достаточно для репрограммирования нейральных стволовых клеток взрослых мышей. Наконец, было показано, что для этого преобразования достаточно одного фактора, Oct-4. Более того, в то время как Sox2, Klf4 и cMyc могут быть заменены соответствующими членами их семей, более близкие родственники Oct4, Oct1 и Oct6, не могут вызвать плюрипотентность, тем самым демонстрируя исключительность Oct4 среди Факторы транскрипции ПОУ. Однако позже было показано, что Oct4 можно полностью исключить из коктейля Yamanaka, а оставшиеся три фактора, Sox2, Klf4 и cMyc (SKM) могут генерировать iPSC мыши с резко увеличенным потенциалом развития. Это говорит о том, что Oct4 увеличивает эффективность перепрограммирования, но снижает качество получаемых ИПСК.

В эмбриональных стволовых клетках
  • В экспериментах in vitro с эмбриональными стволовыми клетками мыши Oct-4 часто использовался в качестве маркера стволовости, поскольку дифференцированные клетки демонстрируют пониженную экспрессию этого маркера.
  • Oct3 / 4 может как репрессировать, так и активировать промотор из Rex1. В клетках, которые уже экспрессируют высокий уровень Oct3 / 4, экзогенно трансфицированный Oct3 / 4 приведет к репрессии Rex1. Однако в клетках, которые активно не экспрессируют Oct3 / 4, экзогенная трансфекция Oct3 / 4 приведет к активации Rex1. Это подразумевает двойную регулирующую способность Oct3 / 4 на Rex1. При низких уровнях белка Oct3 / 4 активируется промотор Rex1, в то время как при высоких уровнях белка Oct3 / 4 промотор Rex1 репрессируется.
  • Oct4 способствует быстрому клеточному циклу ЭСК, стимулируя прогрессирование через фазу G1, в частности, посредством ингибирования транскрипции циклин-зависимых киназ ингибиторов, таких как p21.
  • CRISPR-Cas9 нокаут гена в эмбриональных стволовых клетках человека продемонстрировали, что Oct-4 необходим для развития после оплодотворения.
Во взрослых стволовых клетках

Некоторые исследования предполагают роль Oct-4 в поддержании способности к самообновлению взрослые соматические стволовые клетки (т.е. стволовые клетки эпителия, костного мозга, печени и т. Д.). Другие ученые представили доказательства обратного и отвергают эти исследования как артефакты культивирования in vitro или интерпретируют фоновый шум как сигнал и предупреждают о псевдогенах Oct-4 , дающих ложное определение экспрессии Oct-4. Oct-4 также участвует в качестве маркера раковых стволовых клеток.

См. Также
Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-01 07:52:53
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте