Bordetella trematum

Bordetella trematum - разновидность грамотрицательных бактерий, идентифицированных в 1996 г. путем сравнения 10 штаммов B. trematum с другими хорошо охарактеризованными видами Bordetella и Alcaligenes. Термин «трема» относится к чему-то проколотому или пробитому, или к разрыву. «Trematum» относится к открытым вещам и относится к наличию бактерий в ранах и других открытых частях тела. Штамм LMG 13506 является эталонным штаммом для этого вида.

• 1 Выделение
• 2 Характеристики
• 3 Метаболизм
• 4 Таксономия
• 5 Геномика
• 6 Патогенность
• 7 Ссылки
• 8 Внешние ссылки

Виды Bordetella обычно инфицируют дыхательные пути людей, но B. trematum никогда не выделяли из дыхательных путей человека или животных. Он был выделен из человеческих инфекций уха и ран конечностей. Ниже приводится список известных штаммов B. trematum, альтернативное обозначение штамма, а также дата и источник, где они были впервые выделены:

Bordetella trematum грамотрицательная, капсулированная, неспорообразующий, стержень шириной около 0,5 мкм и длиной 1,0–1,8 мкм, но наблюдались стержни длиной 2,4 мкм. Растет в аэробных условиях при температуре 25–42 ° C, оптимальная температура для роста - 35–37 ° C. Микроаэробный рост может наблюдаться при оптимальных температурах. Он подвижен через перитрихиальный жгутик. B. trematum каталаза положительна. Он уникален тем, что является оксидазно-отрицательным, поскольку все другие виды Bordetella являются оксидазно-положительными.

Bordetella trematum может культивироваться на агаре с лошадиной кровью, агар МакКонки и агар Борде-Генгу. При выращивании на агаре Bordet-Gengou, который является стандартным агаром для выделения Bordetella, колонии являются выпуклыми, жемчужными, гладкими, почти прозрачными и блестящими и окружены зоной гемолиза. При выращивании на кровяном агаре колонии имеют вид от серовато-кремового до белого, круглые и выпуклые.

Мало что известно о метаболизме вида B. trematum, поскольку он был обнаружен сравнительно недавно. Как и все виды Bordetella, B. trematum является хемоорганотрофом и требует никотинамида, органической серы, такой как цистеин, и органического азота, такого как аминокислоты для роста за счет респираторного метаболизма. Его метаболизм не сахаролитический, что означает, что он не использует сахар в какой-либо форме для получения энергии. Шесть из десяти известных штаммов способны восстанавливать нитрат до нитрита. Это индол отрицательный и мочевина отрицательный.

ДНК-рРНК гибридизация была использована для размещения B. trematum LMG 13506 в семействе Alcaligenaceae. Рестрикционный анализ амплифицированной рибосомной ДНК выявил 94% сходства между эталонным штаммом B. trematum и эталонным видом Bordatella, B. коклюш. Позже дополнительные доказательства для определения размещения на уровне рода были получены в результате гибридизации ДНК-ДНК штаммов B. trematum LMG 13506 и LMG 14446 против эталонных штаммов других видов Bordetella и Alcaligenes. Результаты показали, что вид B. trematum больше всего похож на представителей рода Bordetella. SDS-PAGE анализ цельноклеточных белков позволил разработать дендрограмму, показывающую, что Bordetella не монофилетический. Гибридизация ДНК-рРНК и анализ последовательности 16S рРНК показывает тесную взаимосвязь между Bordetella и Alcaligenes. Часто бывает трудно провести различие между двумя родами; фактически, некоторые виды из всех родов фенотипически идентичны.

Bordetella trematum и B. holmesii - единственный вид, который не колонизирует дыхательные пути. Б. pertussis и B. parapertussis - респираторные патогены, вызывающие коклюш. Б. bronchiseptica и B. avium являются респираторными патогенами других животных. B. hinzii не является патогеном и заселяет дыхательные пути птиц. B. holmesii был выделен из крови человека. Члены рода Alcaligenes колонизируют людей, но не дыхательные пути, почву и воду.

Геном B. trematum был секвенирован в 2013 году и в настоящее время проходит аннотацию . По оценкам, геном содержит 4145 кодирующих последовательностей с большинством последовательностей, кодирующих аминокислоты, производные аминокислот и углеводные пути. Предполагается, что около 184 гена участвуют в мембранном транспорте. Содержит 64-65% GC. Общий размер генома в настоящее время неизвестен.

Bordetella trematum - это непатогенный, условно-патогенный организм, единственным источником изоляции которого являются открытые человеческие раны. Он может быть выведен из организма без медицинского вмешательства.

Bordetella эндотоксины уникальны для данного рода, вида и штамма. B. trematum - единственный вид Bordetella с полукруглым липополисахаридом, который содержит одну О-звено. единица липида A B. trematum идентична таковой у условно-патогенных бактерий B. hinzii, но в отличие от любых других видов Bordetella.

• Типовой штамм Bordetella trematum в BacDive - База метаданных по бактериальному разнообразию