Биливердин редуктаза

редактировать
биливердин редуктаза
1hdo.jpg
Идентификаторы
Номер EC 1.3. 1.24
номер CAS 9074-10-6
Базы данных
IntEnz IntEnz view
BRENDA BRENDA entry
ExPASy NiceZyme view
KEGG запись KEGG
MetaCyc метаболический путь
PRIAM профиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Онтология генов AmiGO / QuickGO
биливердинредуктазы A
BLVRA 2H63. png Кристаллографическая структура человеческой биливердинредуктазы A на основе PDB : 2H63 координаты. Фермент отображается в виде рисунка цвета радуги (N-конец = синий, C-конец = красный), а кофактор NADP отображается как модель заполнения пространства (углерод = белый, кислород = красный, азот = синий, фосфор = оранжевый).
Идентификаторы
СимволBLVRA
Альт. символыBLVR
ген NCBI 644
HGNC 1062
OMIM 109750
RefSeq NM_000712
UniProt P53004
Прочие данные
Номер ЕС 1.3.1.24
Locus Chr. 7 p14-cen
биливердин редуктаза B
Идентификаторы
СимволBLVRB
Альт. символыFLR
Ген NCBI 645
HGNC 1063
OMIM 600941
RefSeq NM_000713
UniProt P30043
Прочие данные
Номер ЕС 1.3.1.24
Locus Chr. 19 q13.1-13.2
Биливердинредуктаза, каталитическая
PDB 1lc3 EBI.jpg кристаллическая структура комплекса фермент-кофактор биливердинредуктазы
Идентификаторы
СимволBiliv-reduc_cat
Pfam PF09166
InterPro IPR015249
SCOPe 1lc0 / SUPFAM

Биливердинредуктаза (BVR ) - фермент (EC 1.3.1.24 ), обнаруженный во всех тканях в нормальных условиях, но особенно в ретикуло-макрофагах печени и селезенки. BVR способствует превращению биливердина в билирубина посредством восстановления двойной связи между вторым и третьим пиррольным кольцом в одиночное -облигация.

Существует два изофермента у человека, каждый из которых кодируется собственным геном: биливердинредуктаза A (BLVRA) и биливердинредуктаза B ( BLVRB).

Содержание
  • 1 Механизм катализа
  • 2 Структура
  • 3 Функция
  • 4 Актуальность болезни
  • 5 Ссылки
  • 6 Внешние ссылки
Механизм катализа

BVR действует на биливердин, восстанавливая его двойную связь между пиррольными кольцами до одинарной связи. Это достигается с помощью НАДФН + Н в качестве донора электронов, образуя билирубин и НАДФ в качестве продуктов.

BVR катализирует эту реакцию через перекрывающийся сайт связывания, включая Lys, Lys, Lys, Arg и Arg в качестве ключевых остатков. Этот сайт связывания прикрепляется к биливердину и вызывает его диссоциацию от гемоксигеназы (HO) (которая катализирует реакцию гема трехвалентного железа ->биливердина ), вызывая последующее восстановление до билирубина.

Восстановление биливердина до билирубин, катализируемый биливердинредуктазой.
Структура

BVR состоит из двух тесно упакованных доменов длиной 247-415 аминокислот, содержащих складку Россмана. Также было определено, что BVR является цинк-связывающим белком, причем каждый ферментный белок имеет один сильно связывающийся атом цинка.

C-концевая половина BVR содержит каталитический домен, который принимает структуру , содержащую шестицепочечный бета-лист, который фланкирован с одной стороны несколькими альфа-спиралями. Этот домен содержит каталитический активный сайт, который восстанавливает гамма-метеновый мостик открытого тетрапиррола, биливердина IX альфа, до билирубина с сопутствующим окисление кофактора NADH или NADPH .

Функция

BVR работает с окислительно-восстановительным циклом биливердин / билирубин. Он превращает биливердин в билирубин (сильный антиоксидант), который затем превращается обратно в биливердин под действием активных форм кислорода (ROS). Этот цикл позволяет нейтрализовать АФК и повторно использовать продукты биливердина. Биливердин также пополняется в цикле за счет его образования из гемовых звеньев через гемоксигеназу (HO), локализованную в эндоплазматическом ретикулуме.

Билирубин, являющийся одним из последних продуктов гема распад в печени, далее обрабатывается и выводится с желчью после конъюгации с глюкуроновой кислотой. Таким образом, BVR важен для многих млекопитающих для удаления катаболитов гема - особенно у плода, где плацентарные мембраны проницаемы для билирубина, но не проницаемы для биливердина, что способствует удалению накопления потенциально токсичного белка.

BVR также недавно был признан регулятором метаболизма глюкозы, а также контроля роста клеток и апоптоза благодаря его киназному характеру двойной специфичности. Этот контроль метаболизма глюкозы указывает на то, что BVR может играть роль в патогенезе множества метаболических заболеваний, наиболее заметным из которых является диабет за счет контроля вышестоящего активатора фактора роста инсулина-1 (IGF-1) и сигнальный путь митоген-активируемой протеинкиназы (MAPK).

Актуальность заболевания

BVR действует как средство для регенерации билирубина в повторяющемся окислительно-восстановительном цикле без значительного изменения концентрации доступного билирубина. При сохранении этих уровней кажется, что BVR представляет собой новую стратегию лечения рассеянного склероза и других типов заболеваний, опосредованных окислительным стрессом. Этот механизм обусловлен усилением мощного антиоксидантного действия билирубина, так как это может облегчить заболевания, опосредованные свободными радикалами.

Исследования показали, что окислительно-восстановительный цикл BVR необходим для обеспечения физиологической цитопротекции. Генетические нокауты и снижение уровней BVR продемонстрировали повышенное образование ROS и приводят к усиленной гибели клеток. Клетки, у которых наблюдалось снижение BVR на 90%, имели в три раза больше нормальных уровней ROS. Посредством этого защитного и усиливающего цикла BVR позволяет низким концентрациям билирубина преодолевать в 10000 раз более высокие концентрации ROS.

Ссылки
Внешние ссылки
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR015249
Последняя правка сделана 2021-05-12 05:33:18
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте