Войти
В биохимии два биополимеры являются антипараллельными, если они проходят параллельно друг другу, но с противоположной направленностью (выравнивания). Примером могут служить две комплементарные нити ДНК двойной спирали, которые проходят в противоположных направлениях рядом друг с другом.
Молекулы нуклеиновой кислоты имеют фосфорильный (5 ') конец и гидроксил (3') конец. Это обозначение следует из номенклатуры органической химии и может использоваться для определения движения ферментов, таких как ДНК-полимеразы, относительно цепи ДНК произвольным образом.
Различные типы топологий в G-квадруплексах, пропеллерные, латеральные и диагональные. G-квадруплексы, также известные как ДНК G4, являются вторичными структурами, обнаруженными в нуклеиновой кислоте. кислоты, богатые гуанином. Эти структуры обычно расположены на теломерах (концах хромосом). G-квадруплекс может быть параллельным или антипараллельным в зависимости от конфигурации петли, которая является составной частью структуры. Если все нити ДНК идут в одном направлении, это называется параллельным квадруплексом и известен как переворот нити / пропеллер, соединяющий соседние параллельные нити. Если одна или несколько нитей ДНК проходят в противоположном направлении, это называется антипараллельным квадруплексом, и он может иметь форму латерального / реберного, соединяющего соседние антипараллельные нити, или диагонали, соединяющей две по диагонали. противоположные пряди. Структура этих G-квадруплексов может быть определена катионом.
В ДНК 5 'углерод расположен наверху ведущей цепи, а 3'-углеродный атом расположен в нижней части отстающей пряди. Последовательности нуклеиновой кислоты комплементарны и параллельны, но они идут в противоположных направлениях, отсюда антипараллельное обозначение. Антипараллельная структура ДНК важна в репликации ДНК, потому что она реплицирует ведущую цепь одним способом, а отстающую - другим. Во время репликации ДНК ведущая цепь непрерывно реплицируется, в то время как отстающая цепь реплицируется в сегментах, известных как фрагменты Окадзаки.
Важность антипараллельной двойной спиральной структуры ДНК обусловлена тем, что его водородная связь между комплементарными азотистыми парами оснований. Если бы структура ДНК была параллельной, образование водородных связей было бы невозможным, поскольку пары оснований не были бы спарены известным способом. Четыре пары оснований: аденин, гуанин, цитозин и тимин, где аденин дополняет тимин, а гуанин дополняет цитозин. Транскрипция была бы другой проблемой, если бы структура ДНК была параллельна, не имея смысла в информации, считываемой из ДНК. Это также может привести к продуцированию неправильных белков.
Полипептиды имеют N-конец и C-конец, которые относятся к к концам полимера таким образом, чтобы отражать направление, в котором полимер был синтезирован. Хронологическая последовательность каждой аминокислотной субъединицы является основой для обозначения направленности в полипептидах; данный белок может быть представлен как его набор уникальных сокращений аминокислот внутри N-конца и C-конца.
Антипараллельный и параллельный бета-лист Многие белки могут принимать бета-лист как часть своей вторичной структуры. В бета-листах участки одного полипептида могут располагаться бок о бок и антипараллельно друг другу, чтобы обеспечить водородную связь между их цепями основной цепи. Бета-листы также могут иметь параллельную или антипараллельную вторичную структуру. Однако антипараллельный бета-лист значительно более стабилен, чем параллельная структура, благодаря хорошо выровненным Н-связям, которые расположены под углом 90 °.
