NOBOX

редактировать
NOBOX
Идентификаторы
Псевдонимы NOBOX, OG-2, OG2, OG2X, POF5, TCAG_12042, NOBOX oogenesis homeobox
Внешние идентификаторыOMIM: 610934 MGI: 108011 HomoloGene: 51066 Генные карты: NOBOX
Местоположение гена (человек)
Хромосома 7 (человек)
Chr. Хромосома 7 (человек)
Хромосома 7 (человек) Расположение в геноме NOBOX Расположение в геноме NOBOX
Полоса 7q35Начало144,397,240 bp
конец144,410,227 bp
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Энтрез

135935

18291

Ensembl

ENSG00000106410. ENSG00000285328

ENSMUSG00000029736

UniProt

O60393

Q8VIH1

RefSeq10413717001

RefSeq1041381700>RefSeq (белок)

NP_001073882

NP_570939

Расположение (UCSC)Chr 7: 144,4 - 144,41 МБ Chr 6: 43,3 - 43,31 МБ PubMed поискВикиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок гомеобокса NOBOX, также известный как гомеобоксный белок яичников новорожденного, представляет собой белок, который у человека кодируется геном NOBOX . Официальный символ (NOBOX) и официальное полное название (NOBOX oogenesis homeobox) поддерживаются HGNC. Ген NOBOX сохраняется у шимпанзе, макаки-резуса, коровы, мыши и крысы. Существует 175 организмов, которые имеют ортологи с человеческим геном NOBOX. Он способен регулировать другие гены, важные для развития фолликулов. Фолликулы не развиваются, а ооциты при их отсутствии уменьшаются, что приводит к бесплодию.

Содержание
  • 1 Открытие
  • 2 Расположение гена
  • 3 Структура белка
  • 4 Функция
  • 5 Мутации и клиническое значение
  • 6 Взаимодействия
  • 7 Ссылки
  • 8 Дополнительная литература
Discovery

NOBOX - это открытие in silico вычитания, когда Suzumori et al. провели поиск новых генов, участвующих в фолликулогенезе ранних млекопитающих в 2002 году. Это один из нескольких генов, обнаруженных при поиске в базах данных экспрессируемых тегов последовательности (EST) мышей. Затем он был клонирован и охарактеризован по его геномной структуре.

Расположение гена

NOBOX человека находится в хромосоме 7q35, тогда как NOBOX мыши находится в проксимальной хромосоме 6.

Структура белка

NOBOX человека находится в белок размером 14 т.п.н. и кодируется 8 экзонами. Он имеет богатый пролином С-конец и предполагаемые домены SH3 и WW. Считается, что этот С-конец является критическим для его транскрипционной активности, когда он связан со специфическими для ооцита генами. NOBOX принадлежит к семейству белков, содержащих гомеодомен. Гомеодомен представляет собой участок из 32 специфических аминокислот у приматов, расположенный ниже остатка NOBOX Arg303, и очень хорошо консервативен среди видов. Он содержит остаток аспарагина в положении 51, который важен для его взаимодействия с парами оснований ДНК.

Функция

NOBOX представляет собой ген гомеобокса, который преимущественно экспрессируется в ооцитах. У мышей он важен для фолликулогенеза и регуляции генов, специфичных для ооцитов. Регуляция этих специфичных для ооцитов генов осуществляется посредством прямого связывания NOBOX с его промоторными областями через специфические консенсусные последовательности, ДНК-связывающие элементы NOBOX (NBE). Было идентифицировано три NBE: 5'-TAATTG-3 ', 5'-TAGTTG-3' и 5'-TAATTA-3 '. Нокаут-исследование NOBOX против яичников дикого типа у новорожденных самок мышей показало, что 74% (28/38 генов) подавлены более чем в 5 раз, а 15% (5/33 гена) - более чем в 5 раз. Однако популяция микроРНК не подвержена влиянию NOBOX в яичниках новорожденных. NOBOX также играет важную роль в подавлении генов, определяющих самцов, таких как Dmrt1. Его недостаток может вызвать быструю потерю постнатальных ооцитов, а во время его отсутствия у самок мышей фолликулы замещаются фиброзной тканью. Недавно была обнаружена новая роль NOBOX в контроле остановки G2 / M.

Мутации и клиническое значение

Мутация в гене NOBOX связана с преждевременная недостаточность яичников (ПНЯ), также известная как преждевременная недостаточность яичников (ПНЯ). Это состояние, при котором яичники теряют свою нормальную функцию в возрасте до 40 лет. Это наследственное заболевание у 30% пациентов, которое характеризуется вторичным бесплодием, аменореей, гипоэстрогенизмом и повышенным уровнем фолликулостимулирующего гормона уровни в сыворотке (ФСГ>40 МЕ / литр). От него страдают ≈1% женщин младше 40 лет. Исследование, проведенное с участием 96 белых женщин с ПНЯ, выявило один случай гетерозиготной мутации в гомеодомене NOBOX, p.Arg355His, у одного пациента. Эта мутация отсутствовала в контрольной популяции и значительно нарушает связывание NOBOX с NBE. Arg355 имеет решающее значение для связывания ДНК и сохраняется в гомеодомене NOBOX от рыбок данио к людям. Более того, его значительный отрицательный эффект предполагает, что гомеодомен NOBOX может функционировать как димер, но его редкое появление предполагает низкий вклад в POF. Дальнейшие исследования ПНЯ были проведены на женщинах европеоидной, африканской, китайской и японской национальностей с диагнозом ПОЯ. Несколько мутаций потери функции NOBOX наблюдались у женщин европеоидной расы и африканских женщин, составляя 6,2%, 5,6% и 6,4%. Эти результаты предполагают, что ген NOBOX является сильным аутосомным кандидатом на ПОЯ, и его генетический механизм включает гаплонедостаточность. Однако эти мутации не были обнаружены у китайских и японских женщин, что делает их менее распространенным объяснением POF в этом регионе.

Синдром POF - очень гетерогенное клиническое заболевание, но недавнее исследование показало первые гомозиготные мутация, связанная с потерей функции NOBOX. У одного пациента из 96 популяции с диагнозом ПНЯ в Китае был обнаружен один новый гомозиготный укороченный вариант в гене NOBOX. Этот усеченный вариант вызвал дефектную активацию транскрипции GDF9, хорошо известной мишени для NOBOX, что привело к потере способности NOBOX вызывать арест G2 / M. Этот вывод не согласен с тем, что мутации - менее распространенное объяснение POF в азиатской популяции.

Понимание мутаций в гомеодомене NOBOX важно для исследователей и клиницистов при разработке диагностических и терапевтических подходов к POF, таких как генетический контроль продолжительности репродуктивной жизни млекопитающих, регуляция фертильности и создание зрелых яиц в лаборатории.

Взаимодействия
  1. GDF9
  2. POU5F1
  3. DNMT10
  4. FOXL2
  5. FIGLA
  6. RSPO2
  7. DMRT1
Ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-05-31 07:13:55
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте