NEIL1

редактировать
NEIL1
Белок NEIL1 PDB 1tdh.png
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы NEIL1, FPG1, NEI1, hFPG1, nei-подобная ДНК-гликозилаза 1
Внешние идентификаторыOMIM: 608844 MGI: 1920024 HomoloGene: 11616 GeneCards: NEIL1
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человека)
Chr. Хромосома 15 (человек)
Хромосома 15 (человека) Геномное расположение NEIL1 Геномное расположение NEIL1
Полоса 15q24.2Начало75,346,955 bp
Конец75,357,115 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE NEIL1 219396 s в fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

79661

72774

Ensembl

ENSG00000140398

ENSMUSG00000032298

UniProt

Q96FI4

Q8K4Q6

RefSeq (mRNA_3608122>mRNA_360230>. NM_001352519. NM_001352520

NM_028347. NM_001357409

RefSeq (белок)

NP_001243481. NP_078884. NP_001339448. NP_001339449

NP_08262383430>NP_0826238346>U Chr 15: 75,35 - 75,36 Мб

Chr 9: 57,14 - 57,15 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование Человека Просмотр / редактирование мыши

Подобное эндонуклеазе VIII 1 представляет собой фермент, который у человека кодируется геном NEIL1 .

NEIL1 принадлежит к классу ДНК-гликозилаз, гомологичных бактериальному семейству Fpg / Nei. Эти гликозилазы инициируют первую стадию эксцизионной репарации оснований, расщепляя основания, поврежденные активными формами кислорода (ROS), и вводя разрыв цепи ДНК посредством связанной лиазной реакции.

Содержание
  • 1 Цели
  • 2 Дефицит рака
  • 3 Сохранение памяти
  • 4 Профилактика инсульта
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
Цели

NEIL1 распознает (цели) и удаляет определенные основания, поврежденные ROS, а затем надрезает базисный сайт посредством β, δ элиминирования, оставляя 3 'и 5' фосфатные концы. NEIL1 распознает окисленные пиримидины, формамидопиримидины, тимин остатки, окисленные по метильной группе, и оба стереоизомера тимингликоля. Лучшими субстратами для человеческого NEIL1, по-видимому, являются поражения гидантоином, гуанидиногидантоин и спироиминодигидантоин, которые являются продуктами дальнейшего окисления 8-oxoG. NEIL1 также способен удалять повреждения из одноцепочечной ДНК, а также из пузырьковых и разветвленных структур ДНК. Поскольку экспрессия NEIL1 зависит от клеточного цикла и поскольку он действует на разветвленные структуры ДНК и взаимодействует с PCNA и FEN-1, было высказано предположение, что NEIL1 функционирует в связанных с репликацией Ремонт ДНК.

Дефицит рака

NEIL1 является одним из генов репарации ДНК, наиболее часто гиперметилированных в плоскоклеточной карциноме головы и шеи (HNSCC). Когда 160 генов репарации ДНК человека были оценены на предмет аберрантного метилирования в опухолях HNSCC, 62% опухолей были гиперметилированы в промоторной области NEIL1, что привело к репрессии информационной РНК NEIL1 и белка NEIL1. Когда 8 генов репарации ДНК оценивали в опухолях немелкоклеточного рака легкого (NSCLC), 42% были гиперметилированы в области промотора NEIL1. Это был наиболее частый дефицит репарации ДНК среди 8 протестированных генов репарации ДНК. NEIL1 также был одним из шести генов репарации ДНК, которые, как было обнаружено, гиперметилированы в своих промоторных областях при колоректальном раке.

, тогда как другие гены репарации ДНК, такие как MGMT и MLH1, часто оцениваются на предмет эпигенетической репрессии при многих типах рака, эпигенетический дефицит NEIL1 обычно не оценивается, но может иметь значение и при таких видах рака.

Повреждение ДНК, по-видимому, является основной причиной рака. Если репарация ДНК недостаточна, повреждения ДНК имеют тенденцию к накоплению. Такое избыточное повреждение ДНК может увеличивать мутационные ошибки во время репликации ДНК из-за подверженного ошибкам синтеза трансфузии. Избыточное повреждение ДНК также может увеличивать эпигенетические изменения из-за ошибок во время репарации ДНК. Такие мутации и эпигенетические изменения могут вызывать рак (см. злокачественные новообразования ).

При раке толстой кишки мутации зародышевой линии в генах репарации ДНК вызывают только 2–5% случаев. Однако метилирование промоторной области генов репарации ДНК (включая NEIL1) часто связано с раком толстой кишки и может быть важным причинным фактором для этих видов рака.

Сохранение памяти

NEIL1 способствует кратковременному сохранению пространственной памяти. У мышей, лишенных NEIL1, наблюдается нарушение сохранения памяти в тесте в водном лабиринте.

Предупреждение инсульта

NEIL1 также защищает от ишемической инсульта -индуцированной дисфункции мозга и смерти у мышей. Дефицит NEIL1 вызывает повреждение головного мозга и функционально дефектный результат в модели инсульта на мышах.

Ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-05-31 06:41:27
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте