Войти
NP_000181. NP_001019553. NP_001245137. NP_001245137 <297233>Местоположение (UCSC) | Chr 11: 119,08 - 119,09 МБ | Chr 9: 44,34 - 44,34 МБ | |||||
| PubMed поиск | |||||||
| Викиданные | |||||||
| |||||||
Порфобилиногендеаминаза (гидроксиметилбилансинтаза или уропорфириноген I синтаза ) - это фермент (EC 2.5.1.61, который у людей кодируется геном HMBS . Порфобилиногендеаминаза участвует в третьей стадии пути биосинтеза гема. Он катализирует конденсацию четырех молекул порфобилиногена в линейный гидроксиметилбилан с высвобождением четырех молекул аммиака :
гидроксиметилбилан + 4 NH 3Функционально порфобилиноген дезаминаза катализирует потерю аммиака из мономера порфобилиногена (дезаминирование ) и его последующую полимеризацию до линейного тетрапиррола, который высвобождается в виде гидроксиметилбилана:
Структура порфобилиноген дезаминазы 40-42 кДа, которая является высококонсервативной среди организмов, состоит из трех доменов. Домены 1 и 2 структурно очень похожи: у человека каждый состоит из пяти бета-листов и трех альфа-спиралей. Домен 3 расположен между двумя другими и имеет геометрию сплющенного бета-листа. Дипиррол, кофактор этого фермента, состоящий из двух конденсированных молекул порфобилиногена, ковалентно присоединен к домену 3 и простирается в активный центр, щель между доменами 1 и 2. Несколько положительно заряженных аргинина остатков, расположенных напротив активного сайта из доменов 1 и 2, как было показано, стабилизируют карбоксилатные функции на поступающем порфобилиногене, а также на растущую пиррольную цепь. Эти структурные особенности предположительно способствуют образованию конечного продукта гидроксиметилбилана. Порфобилиноген дезаминаза обычно существует в виде димерных единиц в цитоплазме клетки.
Считается, что первая стадия включает удаление E1 аммиака из порфобилиногена с образованием промежуточного соединения карбокатиона (1). Затем этот промежуточный продукт подвергается атаке дипиррольного кофактора порфобилиногендеаминазы, которая после потери протона дает тример, ковалентно связанный с ферментом (2). Этот промежуточный продукт затем открыт для дальнейшей реакции с порфобилиногеном (1 и 2 повторяются еще три раза). После образования гексамера гидролиз позволяет высвобождать гидроксиметилбилан, а также регенерацию кофактора (3).
острой является наиболее известная проблема со здоровьем, связанная с порфобилиногендеаминазой. перемежающаяся порфирия, аутосомно-доминантное генетическое заболевание, при котором вырабатывается недостаточное количество гидроксиметилбилана, что приводит к накоплению порфобилиногена в цитоплазме. Это вызвано мутацией гена, которая в 90% случаев вызывает снижение количества фермента. Однако были описаны мутации, в которых были описаны менее активные ферменты и / или другие изоформы.
Синтез гема - обратите внимание, что некоторые реакции происходят в цитоплазме, а некоторые - в митохондрии (желтый) 
.. 
.. 