Таблица кодонов ДНК

редактировать
Список стендов Ard правила для преобразования кодированной ДНК информации в белки Графика, отображающая последовательность ДНК, триплеты нуклеотидов в ней и соответствующие аминокислоты Три последовательных основания ДНК, называемые нуклеотидными триплетами или кодонами, транслируются в аминокислоты (GCA на аланин, AGA с аргинином, GAT с аспарагиновой кислотой, AAT с аспарагином и TGT с цистеином в этом примере).

Стандартный генетический код традиционно представлен в виде таблицы кодонов РНК, потому что, когда белки производятся в клетке с помощью рибосом, это мРНК, который направляет синтез белка. Последовательность мРНК определяется последовательностью геномной ДНК. В этом контексте стандартный генетический код называется таблицей трансляции 1. Однако с появлением вычислительной биологии и геномики теперь обнаружено большинство генов. на уровне ДНК, поэтому таблица кодонов ДНК становится все более полезной. Кодоны ДНК в таких таблицах расположены на смысловой цепи ДНК и расположены в направлении 5 '→ 3'. В генетических кодах существуют симметричные и асимметричные характеристики.

В ДНК 64 различных кодона и таблицы ниже; все, кроме трех, указывают аминокислоту. Эти три других кодона, называемые стоп-кодонами, имеют определенные названия: UAG - янтарный, UGA - опаловый (иногда также называемый умброй) и UAA - охра. Эти последовательности, также называемые «терминирующими» или «бессмысленными» кодонами, сигнализируют о высвобождении растущего полипептида из рибосомы. Еще три кодона, которые определяют аминокислоту, называются стартовыми кодонами. Наиболее распространенным стартовым кодоном является AUG, который читается как метионин. Альтернативные стартовые кодоны в зависимости от организма включают «GUG» или «UUG»; эти кодоны обычно представляют собой валин и лейцин соответственно, но в качестве стартовых кодонов они переводятся как метионин или формилметионин. Эти стартовые кодоны вместе с последовательностями, такими как фактор инициации, инициируют трансляцию.

Первая таблица, стандартная таблица, может использоваться для трансляции триплетов нуклеотидов в соответствующую аминокислоту или соответствующий сигнал, если это стартовый или стоп-кодон. Вторая таблица, уместно названная обратной, делает противоположное: ее можно использовать для вывода возможного триплетного кода, если известен порядок аминокислот.

Содержание
  • 1 Таблицы кодонов
    • 1.1 Стандартная таблица кодонов ДНК
    • 1.2 Обратная таблица кодонов ДНК
  • 2 См. Также
  • 3 Примечания и ссылки
    • 3.1 Примечания
    • 3.2 Ссылки
  • 4 Дополнительная литература
  • 5 Внешние ссылки
Таблицы кодонов

Стандартная таблица кодонов ДНК

Стандартный генетический код
1-е. основание2-е основание3-е. основание
TCAG
TTTT(Phe / F) Фенилаланин TCT(Ser / S) серин TAT(Tyr / Y) Тирозин TGT(Cys / C) Цистеин T
TTCTCCTACTGCC
TTA(Leu / L) Leucine TCATAAStop (охра)TGAStop (Opal)A
TTGTCGTAGStop (желтый)TGG(Trp / W) Триптофан G
CCTTCCT(Pro / P) Proline CAT(His / H) Гистидин CGT(Arg / R) Аргинин T
CTCCCCCACCGCC
CTACCACAA(Gln / Q) глутам ine CGAA
CTGCCGCAGCGGG
AATT(Ile / I) Изолейцин ACT(Thr / T) Треонин AAT(Asn / N) Аспарагин AGT(Ser / S) Серин T
ATCACCAACAGCC
ATAACAAAA(Lys / K) Лизин AGA(Arg / R) Аргинин A
ATG(Met / M) Метионин ACGAAGAGGG
GGTT(Val / V) Валин GCT( Ala / A) Аланин GAT(Asp / D) Аспарагиновая кислота GGT(Gly / G) Глицин T
GTCGCCGACGGCC
GTAGCAGAA(Glu / E) Глутаминовая кислота GGAA
GTGGCGGAGGGGG
Аминокислота биохимические свойстваНеполярныйПолярныйОсновнойКислотныйОкончание: стоп-кодон

Таблица обратных кодонов ДНК

Обратная таблица для стандартного генетического кода (сжатая используя Обозначение IUPAC )
АминокислотныеКодоны ДНКСжатыеАминокислотныеКодоны ДНКСжатые
Ala, AGCT, GCC, GCA, GCGGCNIle, IATT, ATC, ATAATH
Arg, RCGT, CGC, CGA, CGG; AGA, AGGCGN, AGR; или. CGY, MGRLeu, LCTT, CTC, CTA, CTG; TTA, TTGCTN, TTR; или. CTY, YTR
Asn, NAAT, AACAAYLys, KAAA, AAGAAR
Asp, DGAT, GACGAYMet, MATG
Asn или Asp, BAAT, AAC; GAT, GACRAYPhe, FTTT, TTCTTY
Cys, CTGT, TGCTGYPro, PCCT, CCC, CCA, CCGCCN
Gln, QCAA, CAGCARSer, STCT, TCC, TCA, TCG; AGT, AGCTCN, AGY
Glu, EGAA, GAGGARThr, TACT, ACC, ACA, ACGACN
Gln или Glu, ZCAA, CAG; GAA, GAGSARTrp, WTGG
Gly, GGGT, GGC, GGA, GGGGGNTyr, YTAT, TACTAY
His, HCAT, CACCAYVal, VGTT, GTC, GTA, GTGGTN
STARTATGSTOPTAA, TGA, TAGTRA, TAR
См. Также
  • icon Портал биохимии
  • icon Портал биологии
  • icon Портал эволюционной биологии
Примечания и ссылки

Примечания

Кодон ATG и кодирует метионин, и служит сайтом инициации: первый ATG в кодировке мРНК область, где начинается трансляция в белок. Другие стартовые кодоны, перечисленные GenBank, редко встречаются у эукариот и обычно являются кодами для Met / fMet.
Историческая основа для обозначения стоп-кодонов как янтарь, охра и опал описана в автобиографии Сидней Бреннер и в исторической статье Боба Эдгара.

Ссылки

Дополнительная литература
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-16 09:17:01
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте