Transportin 1

TNPO1
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список id кодов PDB 1QBK, 2H4M, 2OT8, 2QMR, 2Z5J, 2Z5K, 2Z5M, 2Z5N, 2Z5O, 4FDD, 4FQ3, 4JLQ, 4OO6
Идентификаторы
Псевдонимы	TNPO1, IPO2, KPNB2, MIP, MIP1, TRN, Transportin 1
Внешний Идентификаторы	OMIM: 602901 MGI: 2681523 HomoloGene: 5358 GeneCard : TNPO1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек) Полоса 5q13.2 Начало 72,816,312 bp Конец 72,916,733 bp
Расположение гена (мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь) Полоса 13 D1 | 13 52,24 см Начало 98,839,019 bp Конец 98,926,384 bp
Экспрессия РНК шаблон .. .. Дополнительные справочные данные по экспрессии
Онтология генов Молекулярная функция •Ran GTPase связывание. •GO: 0001948 связывание с белком. •связывание с последовательностью в ядре. •связывание с РНК. клеточный компонент •цитоплазма. •цитозоль. •не мембрана. •периферия ядра. •внеклеточная экзосома. •ядро ​​клетки. •ресничка. •клетка. Биологический процесс •импорт рибосомного белка в ядро ​​. •регуляция стабильности мРНК. •транспорт белка. •GO: 0022415 вирусный процесс. •внутриклеточный транспорт белка. •импорт белка, несущего NLS i nto ядро ​​. •внутрицилиарный транспорт, участвующий в сборке ресничек. •транспорт. •импорт белка в ядро ​​. Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	3842	238799
Ensembl	ENSG00000083312	ENSMUSG00000009470
UniProt	Q92973	Q8BFY9
RefSeq (mRNA)>NM_002270. NM_153188

Transportin-1 (или Importin-β 2) - это белок, который у людей кодируется TNPO1 ген.

• 1 Функция
• 2 Цели
• 3 Клиническая значимость
• 4 Взаимодействия
• 5 Ссылки
• 6 Дополнительная литература

Этот белок кариоферин, который взаимодействует с последовательностью ядерной локализации для нацеливания ядерных белков на ядро. Классический рецепторный комплекс кариоферина, такой как комплекс, в котором используется Импортин-β1 (кодируемый геном KPNB1 ), представляет собой гетеродимер альфа-субъединицы, которая распознает сигнал ядерной локализации, и бета-субъединицы, которая присоединяет комплекс к нуклеопорины. Однако транспортин-1 может напрямую связываться с белками карго, и для этого ему может не потребоваться альфа-субъединица импортина.

Предполагается, что транспортин-1 использует тот же основной механизм для осуществления ядерного транспорта, что и другие импортины. Он опосредует стыковку с комплексом ядерной поры посредством связывания с нуклеопорином и впоследствии перемещается через пору с помощью механизма, требующего энергии. Затем в ядре Ran связывается с Transportin-1, он отделяется от груза, и Transportin-1 реэкспортируется из ядра в цитоплазму, где гидролиз GTP высвобождает Ran. Тогда Transportin-1 может привязать новый груз.

Кроме того, Transportin-1 участвует в содействии транспорту белка в первичную ресничку. Предполагается, что в этом случае функция транспортина-1 аналогична переносу белков в ядро ​​через ядерную пору. Transportin-1 связывает груз, а затем помогает ему пройти через пору в основании реснички. В этом механизме также участвуют Ran и нуклеопорины.

Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскрипта, кодирующим разные белки.

Транспортин 1 (TRN1) является частью неклассического пути ядерного импорта. В сочетании с каскадом гидролиза RanGTP TRN1 действует, чтобы импортировать выбранные белки в ядро ​​клеток. Эти мишени обычно содержат мотив PY, иначе известный как сигнал ядерной локализации M9. Хорошо описанные примеры включают hnRNP A1.

Тип грузовых белков, которые Транспортин 1 может переносить в ядро, включает РНК-связывающие белки (такие как hnRNP A1 и hnRNP F), а также рибосомные белки.

TRN1 участвует в патогенезе двух нейродегенеративных заболеваний, а именно бокового амиотрофического склероза и лобно-височной деменции.

Транспортин 1 был показан на взаимодействовать с:

• RGPD5 и
• Ран (биология).