Войти
| Тэнди Уорноу | |
|---|---|
 Тэнди Уорноу выступает на Интеллектуальных системах для молекулярной биологии (ISMB) конференция в 2018 г. | |
| Родилась | Тэнди Джо Варноу |
| Alma mater | Калифорнийский университет в Беркли (бакалавр, доктор философии) |
| Супруг (ы) | Джордж Чако |
| Награды |
|
| Научная карьера | |
| Области | Компьютерные науки. Вычислительная биология. Филогенетика. Метагеномика. Выравнивание множественных последовательностей |
| Учреждения | Университет Иллинойса в Урбане-Шампейне. Университет Пенсильвании. Университет Техаса |
| Диссертация | Комбинаторные алгоритмы для построения филогенетических деревьев (1991) |
| Докторант | Юджин Лоулер |
| Другие научные консультанты sors | Майкл Уотерман. Саймон Таваре |
| Докторанты | Луай Наклех |
| Веб-сайт | tandy.cs.illinois.edu |
Тэнди Варнау - американский ученый-компьютерщик, заслуженный руководитель инженерного факультета Университета штата Иллинойс в Урбана-Шампейн. Она известна своей работой по реконструкции эволюционных деревьев, как в биологии, так и в исторической лингвистике, а также методами множественного выравнивания последовательностей.
Варноу закончила бакалавриат и аспирантуру по математике в Калифорнийский университет в Беркли, получил степень бакалавра в 1984 году и докторскую степень в 1991 году под руководством Юджина Лоулера. Другими членами ее диссертационного комитета были Ричард Карп, Мануэль Блюм, Дэн Гасфилд и Дэвид Гейл.
После исследования в докторантуре в Университете Южной Калифорнии с 1991 по 1992 год (научные руководители Майкл Уотерман и Саймон Таваре ) и в Сандийских национальных лабораториях в Альбукерке с 1992 по 1993 год она занимала должность преподавателя в Пенсильванском университете, где она оставалась до тех пор, пока в 1999 году не перешла в Техасский университет. В 2014 году Варнов присоединилась к преподавательскому составу Университета Иллинойса в Урбане-Шампейне, где она является основателем, профессором инженерии и заместителем главы отдела компьютерных наук. Варноу были любезно назначены должности в отделах биологии животных, биоинженерии, электротехники и вычислительной техники, энтомологии, математики, биологии растений и статистики.
В 1995 году, по данным исследования Варноу, Дональда Ринга, и Энн Тейлор из Университета Пенсильвании на основе вычислений совершенной филогении предоставили исчерпывающую теорию для определения времени ранних подразделений в индоевропейских языках. Их расчеты подтвердили индо-хеттскую гипотезу, согласно которой первым из этих подразделений, отделившихся от остальных индоевропейских языков, были анатолийские языки. Их результаты также подтверждают гипотезу греко-армянского, согласно которой армянский язык и греческий язык образуют подсемейство индоевропейских. Они вписывают германские языки в эволюционное древо индоевропейских языков, ранее считавшееся проблематичным, предполагая, что протогерманский язык был тесно связан с балто-славянским языком. языки, но затем были изменены миграциями германских племен на запад, которые привели их к контакту с носителями италийского и кельтского. Позднее Варноу и его коллеги расширили этот идеальный филогенетический подход, чтобы учесть необнаруженное заимствование между языками, так что эволюция языка моделируется сетью, а не деревом.
В 2009 году Варнов и ее коллеги выпустили свою программу SATé. для совместной оценки биологического выравнивания множественных последовательностей и эволюционных деревьев. Их программное обеспечение в меньшей степени основано на твердых математических принципах, чем некоторые предыдущие методы совместной оценки (например, BAli-Phy), но оно значительно быстрее, что позволяет быстро создавать высокоточные деревья и выравнивания для тысяч видов. Для сравнения, низкая производительность предыдущих методов ограничивала их сравнением только десятков видов за раз.
Ее работа с 2014 по 2018 год была сосредоточена на трех темах: масштабирование нескольких выравниваний последовательностей до сверхбольших наборов данных, виды оценка дерева с использованием нескольких генов (и устранение неоднородности дерева генов из-за неполной сортировки по происхождению ) и метагеномики. Ее основной вклад в эти темы включает метод PASTA для совместной оценки выравниваний и деревьев, который улучшает SATé и может производить высокоточные сопоставления до 1 000 000 последовательностей. Она также разработала метод ASTRAL для оценки деревьев видов, который представляет собой статистически согласованный метод построения деревьев видов при неполной сортировке по родословным.
Варнов был назван основателем Профессор инженерии в Университете Иллинойса в Урбана-Шампейн в 2014 году и столетняя профессура компьютерных наук Дэвида Брутона-младшего в Техасском университете в Остине в 2010 году. Варнов также получил премию Фонда Джона Саймона Гуггенхайма. Стипендия в 2011 году, стипендия института Рэдклиффа в 2003 году, стипендия Фонда Дэвида и Люсиль Паккард в 1996 году и награда NSF Young Investigator Award в 1994 году. В 2015 году она была названа членом ассоциации Computing Machinery (ACM) «За вклад в математическую теорию, алгоритмы и программное обеспечение для крупномасштабной молекулярной филогенетики и исторической лингвистики». В 2017 году она была избрана членом Международного общества вычислительной биологии (ISCB).
Мать Варноу была известным архивистом Джоан Варнов. -Блюетт, а ее отцом был Мортон Уорноу, сын лидера группы Марка Варноу и племянника композитора Раймонда Скотта. Ее сестра-близнец - Киммен Шоландер, исследователь в области биоинформатики и преподаватель Калифорнийского университета. Она замужем за Джорджем Чако.
