Международное общество вычислительной биологии

редактировать
Международное общество вычислительной биологии
Iscb logo.png
АббревиатураISCB
Формирование1997 (1997)
ТипОбразованное общество
Штаб-квартираЛисбург, Вирджиния, США
Членство (2016)~ 3400
ПрезидентТомас Ленгауэр
Ключевые люди
Дочерние компании Студенческий совет ISCB
Веб-сайтiscb.org

Международное общество вычислительной биологии (ISCB ) - это научное общество для исследователей в области вычислительной биологии и биоинформатики. Общество было основано в 1997 году, чтобы обеспечить стабильный финансовый дом для конференции Интеллектуальные системы для молекулярной биологии (ISMB), и выросло в более крупное общество, работающее над продвижением понимания живых систем с помощью вычислений и обмена научными данными. продвигается по всему миру.

В дополнение к ISMB, общество также организует растущее число небольших конференций, более региональных или тематических, и вручает ряд ежегодных наград за научные достижения, включая Премию Овертона и Награды ISCB для старших ученых.

Содержание

  • 1 Обзор
  • 2 История
    • 2.1 Основание
    • 2.2 Расширение
  • 3 Лидерство и структура
    • 3.1 Президенты
    • 3.2 Совет директоров
    • 3.3 Стипендиаты
    • 3.4 Сообщества особых интересов (COSI)
    • 3.5 Студенческий совет
  • 4 Конференции
  • 5 Официальные журналы
  • 6 Аффилированные организации
  • 7 Источники

Обзор

Членство в обществе отражает приверженность развитию вычислительной биологии. ISCB - международная некоммерческая организация, члены которой являются представителями глобальных сообществ биоинформатики и вычислительной биологии. ISCB обслуживает своих членов по всему миру, предоставляя высококачественные встречи, публикации и отчеты о методах и инструментах; путем распространения ключевой информации о ресурсах биоинформатики и актуальных новостей из смежных областей; и путем активного содействия обучению, образованию, трудоустройству, развитию карьеры и созданию сетей. Общество также поддерживает и обеспечивает руководство ресурсами и политикой в ​​поддержку научных усилий и на благо общества в целом.

ISCB стремится довести значение вычислительной биологии до более широкого научного сообщества, правительственных организаций и широкой общественности; общество обслуживает своих членов на местном, национальном и международном уровнях; он обеспечивает руководство по научной политике, публикациям, встречам и распространяет информацию через несколько платформ. ISCB ежегодно организует конференцию Интеллектуальные системы для молекулярной биологии (ISMB), растущее число более мелких, более региональных или тематических ежегодных и двухгодичных конференций, а также имеет три официальных журнала: ISCB Community Journal, PLOS Computational Biology и Bioinformatics. Общество ежегодно присуждает три награды за научные достижения: Премию Овертона, Премию новатора ISCB и Премию ISCB Senior Scientist. Общество ежегодно избирает стипендиатов ISCB в честь членов, отличившихся выдающимся вкладом в области вычислительной биологии и биоинформатики. ISCB также присуждает премию ISCB Outstanding Contributions Award, чтобы отметить членов сообщества, которые внесли значительный вклад в успех организации.

История

Основание

Серия конференций Интеллектуальные системы для молекулярной биологии (ISMB) началась в 1993 году. В ответ на расширение конференции, ISCB был основан в 1997 году, и значительная часть его обязанностей заключалась в обеспечении стабильного финансового дома для ISMB. ISCB была юридически зарегистрирована в начале 1997 года, и Лоуренс Хантер был избран первым президентом членами учредительного совета директоров, в который входили Расс Альтман, Филип Борн, Дэвид Стейтс и Альфонсо Валенсия. ISCB организовывает конференцию ISMB с 1998 года.

В течение следующих нескольких лет основное внимание оставалось на управлении ежегодной конференцией ISMB, посещаемость которой в 1993 году приблизительно 200 исследователей увеличилась более чем в три раза к 1999 году.

Новое тысячелетие принесло новый президент Расс Альтман, в настоящее время заведующий кафедрой биоинженерии Стэнфордского университета и директор программы по биомедицинской информатике, и более 1200 делегатов посетили ISMB 2000 в Сан-Диего.. Альтман предпринял шаги по формализации некоторых юридических и административных аспектов ISCB, прежде чем передать эстафету в 2002 году Филипу Э. Борну, в настоящее время профессору кафедры фармакологии и Школе фармации и фармацевтических наук Скаггса в Калифорнийский университет, Сан-Диего. Борн предоставил ISCB более постоянный дом в UCSD, что включало в себя обязательство университета принимать у себя общество как минимум в течение 2005 года и его предложение поддержки персонала. Хотя Борн был президентом всего один год, он оставил свой след в обществе, расширив взаимодействие с региональными группами и организаторами конференций по всему миру, а также улучшив присутствие в Интернете. За время его пребывания в должности членство выросло до более чем 1700 исследователей, а конференция ISMB 2002 года в Эдмонтоне, Альберта, Канада, приняла более 1600 участников.

Расширение

Майкл Грибсков, затем работал в отделе суперкомпьютеров Калифорнийского университета в Сан-Диего, а теперь на факультете биологических наук в Университете Пердью, был избран президентом в 2003 году. В том же году ISMB состоялась в Брисбене, Австралия, где встреча впервые проводилась за пределами Северной Америки или Европы. Эта фаза принесла обществу много неуверенности, когда посещаемость упала до половины бюджетных ожиданий из-за опасений по поводу поездок и ограничений, связанных со вспышками тяжелого острого респираторного синдрома или SARS, началом войны в Ираке и локация, которая противоречила традициям североамериканских и европейских заведений. Несмотря на успех с научной точки зрения, финансовые потери ISMB 2003 впервые в истории сделали ISCB финансово нестабильным.

Отчасти для уменьшения зависимости ISCB от доходов ISMB для финансирования деятельности общества и ежегодных накладных расходов, пилотная региональная конференция была организована в США для оценки интереса к небольшим локальным собраниям. В декабре 2003 года в Аспене, штат Колорадо, стартовала региональная конференция по биоинформатике Роки-Маунтин, Rocky 1. С тех пор встреча проводится ежегодно и теперь привлекает посетителей со всего мира.

В 2005 году в рамках дискуссий общества о роли публикаций и официального журнала общества, сопровождавшихся появлением публикаций с открытым доступом, ISCB объявил о партнерстве с Публичной научной библиотекой и запустил новый журнал с открытым доступом, PLoS Computational Biology. Журнал предназначен для подчеркивания вычислительных методов, применяемых к живым системам на всех уровнях, от молекулярной биологии до популяций пациентов и экосистем, и которые предлагают экспериментаторам понимание. Предыдущий президент и бывший председатель комитета по публикациям Фил Борн служил главным редактором нового издания, и он остается в этой должности. Выход первого номера нового журнала совпал с днем ​​открытия ISMB 2005, проходившего в Детройте, Мичиган.

Буркхард Рост, тогдашний профессор кафедры биохимии и молекулярной биофизики в Колумбийский университет, а теперь профессор Александра фон Гумбольдта и заведующий кафедрой биоинформатики и вычислительной биологии, вычислительных наук в Техническом университете Мюнхена, сменивший Михаила Грибскова на посту президента в 2007 году. и дважды переизбирался с текущим сроком до января 2013 года. Под его руководством конференция ISMB / ECCB 2007 в Вене, Австрия, под председательством Томаса Ленгауэра из Института информатики Макса-Планка, и другие - под председательством Буркхарда Роста и Питера Шустера из Венского университета, был дополнительно расширен, чтобы включить в общей сложности восемь параллельных направлений, а также участие в конференции 2007 года примерно 1700 человек оправдали свои ожидания. Вена как место назначения и Австрия-центр Вены были настолько хорошо встречены как организаторами конференции, так и участниками, что она была выбрана для проведения конференции 2011 года, что является первым местом из серии ISMB, которое никогда ранее не повторялось.

В 2010 году первая конференция ISCB Latin America прошла в Монтевидео, Уругвай.

Руководство и структура

Президент, исполнительный комитет и совет директоров составляют научное руководство ISCB, опираясь на выдающихся, всемирно известных исследователей, которые избираются за свои срок членством в обществе. Исполнительный директор возглавляет персонал ISCB и поддерживает различные комитеты, занимающиеся конкретными проблемами, важными для сообщества вычислительной биологии и биоинформатики, включая образование, политику и публикации.

Президенты

Президенты Международного общества вычислительной биологии

Совет директоров

По состоянию на 2018 год в число заметных членов совета директоров входят: Алекс Бейтман, Бонни Бергер, Терри Гаастерленд, Джанет Келсо, Томас Ленгауэр, Ив Моро, Кристин Оренго, Буркхард Рост, Альфонсо Валенсия и Мартин Вингрон.

Стипендиаты

Начиная с 2009 года ISCB выбирает стипендиатов. Эти награды присуждаются за выдающийся вклад в области вычислительной биологии и биоинформатика. Первый класс был отдан предыдущим получателям награды ISCB за выдающиеся достижения ; в последующие годы ISCB стремился выдвинуть кандидатов на стипендию от своих членов. Стипендиаты традиционно представляются ежегодно на флагманской конференции Интеллектуальные системы для молекулярной биологии ISCB. По состоянию на Класс 2017 года было избрано 64 стипендиата.

Сообщества особых интересов (COSI)

Сообщества особых интересов ISCB (COSI) являются членами сообществ, представляющих общие интересы, которые самостоятельно организованы и проводят несколько мероприятий или взаимодействий в течение года, а не проводят встречи только в рамках программы SIG конференции ISMB. Важной целью любого COSI является создание тематически ориентированного сообщества, в котором ученые общаются друг с другом по исследовательским проблемам и / или возможностям в конкретных областях вычислительной биологии. Такое общение часто происходит в форме встреч, но также может осуществляться с помощью других инструментов социальных сетей, которые позволяют активно участвовать в виртуальной среде.

Студенческий совет

В 2004 году Студенческий совет ISCB был основан Мануэлем Корпасом для содействия развитию мирового сообщества студентов, изучающих компьютерную биологию.. Одна из основных задач студенческого совета - продвигать soft skills для развития потенциала стажеров в области биоинформатики и вычислительной биологии. По состоянию на 2017 год студенческий совет представляет более 1000 студентов со всего мира.

Конференции

ISCB вырос из потребности в стабильной организационной структуре для поддержки планирования и управления финансами Серия конференций «Интеллектуальные системы для молекулярной биологии» (ISMB), начавшаяся в 1993 году. ISMB - это наиболее заметное ежегодное мероприятие ISCB, на которое ежегодно выделяется значительная часть ресурсов. С 2004 года, когда ISMB проводится в Европе, он проводится совместно с Европейской конференцией по компьютерной биологии (ECCB).

ISCB начал расширять свои предложения конференций, представив серию ежегодных конференций по биоинформатике в Скалистых горах в 2003 году, конференцию по семантике в здравоохранении и биологических науках (CSHALS ) в 2008 году, ежегодная конференция ISCB Africa ASBCB по биоинформатике в 2009 году и конференция ISCB в Латинской Америке, проходящая два раза в год в 2010 году. ISCB также проводит ежегодную конференцию по биоинформатике Великого озера и сотрудничает с RECOMB для проведения конференции по регуляторной и системной геномике с DREAM Проблемы. Встреча ISCB-Asia началась в 2012 году и продолжает формироваться после последней конференции в 2014 году в Японии, проводившейся совместно с GIW.

В дополнение к конференциям, организуемым ISCB, общество поддерживает другие конференции по вычислительной биологии и биоинформатике через членство и спонсорство. К ним относятся ежегодный Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу (PSB), ежегодная международная конференция Исследования в области вычислительной молекулярной биологии (RECOMB), ежегодная Международная конференция по биоинформатике (InCoB) и ежегодное общее собрание Европейской сети молекулярной биологии или EMBnet.

Официальные журналы

  • В 1998 году Bioinformatics стал официальным журналом ISCB. Члены общества, платящие взносы, воспользовались онлайн-подпиской на журнал. Материалы конференций ISMB публикуются в Bioinformatics с 2001 года. В 2004 году, поскольку многие члены ISCB имели институциональные подписки на Bioinformatics, ISCB решила не продлевать свой контракт с журналом. В январе 2009 года Bioinformatics снова стал официальным журналом ISCB, наряду с PLOS Computational Biology.
  • PLOS Computational Biology - это открытый рецензируемый журнал с открытым доступом, ежемесячно публикуемый Public Library of Science (PLOS). Он стал официальным журналом ISCB в 2005 году.
  • В 2015 году ISCB объявил о создании журнала сообщества ISCB, специального канала на платформе онлайн-публикаций F1000Research, предоставляющего участникам возможность открыто публиковать исследовательские статьи независимо от их формата или предполагаемого воздействия.

Аффилированные организации

ISCB имеет несколько дочерних организаций (в основном региональных), включая Европейскую сеть молекулярной биологии (EMBnet), Нидерландский центр биоинформатики (NBIC), Африканское общество биоинформатики и вычислительной биологии и Японское общество биоинформатики.

ISCB также является одним из основателей. В сотрудничестве с GOBLET ISCB участвует в развитии основных компетенций для различных типов стажеров в области биоинформатики; эти компетенции используются при разработке новых учебных программ по биоинформатике.

Ссылки

Последняя правка сделана 2021-05-24 04:44:17
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте