KDM2B

редактировать
KDM2B
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы KDM2B, CXXC2, FBXL10, Fbl10, JHDM1B, PCCX2, лизиндеметилаза 2B
Внешние идентификаторыOMIM: 609078 MGI: 1354737 HomoloGene : 13069 Генные карты: KDM2B
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человеческая)
Chr. Хромосома 12 (человек)
Хромосома 12 (человеческая) Местоположение генома для KDM2B Местоположение генома для KDM2B
Полоса 12q24.31Начало121,429,096 bp
Конец121,581,023 bp
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

84678

30841

Ensembl

ENSG00000089094

ENSMUSG00000029475

UniProt

Q8NHM5

Q6P1G2

RefSeq (mRNA)

NM_001005366 <30581003><1253_032>NM_001005366 <305810031002>NM_032>NM_032>312>NM_013910. NM_001378863. NM_001378864.

NM_001378865

RefSeq (белок)

NP_001005366. NP_115979

NP_001003953. NP_115979

NP_001003953. NP_038938413313>NP_092_314007

Местоположение (UCSC)Chr 12: 121,43 - 121,58 Мб Chr 5: 122,87 - 122,99 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / Edit Mouse

Ген KDM2Bчеловека кодирует белок лизин (K) -специфическую деметилазу 2B.

Содержание
  • 1 Ткань и субклеточное распределение
  • 2 Структура
  • 3 Функция
  • 4 Клиническая значимость
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
  • 7 Внешние ссылки
Тканевые и субклеточные распределение

KDM2B широко и высоко экспрессируется в эмбриональных тканях (особенно в развивающейся центральной нервной системе позвоночных). Экспрессия KDM2B также сохраняется в большинстве органов у взрослых. Белок присутствует в нуклеоплазме и обогащен ядрышком, где он связывает транскрибируемую область рибосомной РНК, подавляя транскрипцию генов рибосомной РНК, что ингибирует рост и пролиферацию клеток.

Структура

Белок KDM2B имеет несколько доменов, включая домен JmjC, который обладает гистон-деметилазной активностью, деметилируя триметилированный Lys-4 и диметилированный Lys-36 гистона H3. Он также является основным каркасом неканонического репрессивного комплекса поликомб 1.1 (ncPRC1.1), содержащего BCOR, PCGF1, RING1 / 2 и RYBP, который моноубиквитилирует гистон H2A на K119.

Функция

Этот ген кодирует член семейства белков F-бокса, который характеризуется мотивом из приблизительно 40 аминокислот, F-боксом. Белки F-бокса составляют одну из четырех субъединиц комплекса убиквитин белок лигаза, называемых SCF (SKP1-cullin-F-box), которые участвуют в фосфорилировании -зависимое убиквитинирование. Белки F-бокса делятся на 3 класса: Fbws, содержащие домены WD-40, Fbls, содержащие лейциновые -богатые повторы, и Fbxs, содержащие либо различные модули взаимодействия белок-белок, либо нераспознаваемые мотивы. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к классу Fbls. Для этого гена были обнаружены множественные альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, но полноразмерная природа некоторых вариантов не была определена.

Как часть ncPRC1. 1, KDM2B быстро и временно рекрутируется в участки повреждения ДНК PARP1- и TIMELESS-зависимым образом, способствуя моноубиквитилированию гистона H2A на K119 с одновременным локальным снижением уровней H2A и увеличением H2A.Z. Эти события способствуют репрессии транскрипции в повреждениях ДНК, передаче сигналов о двухцепочечном разрыве и восстановлению гомологичной рекомбинации. Активность комплекса ncPRC1.1 в повреждениях ДНК была необходима для правильного рекрутирования двух канонических комплексов PRC1 (cPRC1.2 и cPRC1.4), определяемых их субъединицами PCGF, MEL18 и BMI1 соответственно. Таким образом, рекрутирование комплекса ncPRC1.1 представляет собой ранний и критический этап регуляции восстановления гомологичной рекомбинации.

Клиническая значимость

Потеря KDM2B приводит к серьезным дефектам развития (дефекты роста в головном мозге, включая нарушение закрытия нервной трубки и черепно-лицевые пороки развития, развитие кроветворения), ведущие к эмбриональной летальности

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
  • Обзор всей доступной структурной информации в PDB для UniProt : Q8NHM5 (лизин-специфическая деметилаза 2B) в PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, которая находится в общественном достоянии.

.

Последняя правка сделана 2021-05-25 08:13:58
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте