Ген KDM2Bчеловека кодирует белок лизин (K) -специфическую деметилазу 2B.
KDM2B широко и высоко экспрессируется в эмбриональных тканях (особенно в развивающейся центральной нервной системе позвоночных). Экспрессия KDM2B также сохраняется в большинстве органов у взрослых. Белок присутствует в нуклеоплазме и обогащен ядрышком, где он связывает транскрибируемую область рибосомной РНК, подавляя транскрипцию генов рибосомной РНК, что ингибирует рост и пролиферацию клеток.
Белок KDM2B имеет несколько доменов, включая домен JmjC, который обладает гистон-деметилазной активностью, деметилируя триметилированный Lys-4 и диметилированный Lys-36 гистона H3. Он также является основным каркасом неканонического репрессивного комплекса поликомб 1.1 (ncPRC1.1), содержащего BCOR, PCGF1, RING1 / 2 и RYBP, который моноубиквитилирует гистон H2A на K119.
Этот ген кодирует член семейства белков F-бокса, который характеризуется мотивом из приблизительно 40 аминокислот, F-боксом. Белки F-бокса составляют одну из четырех субъединиц комплекса убиквитин белок лигаза, называемых SCF (SKP1-cullin-F-box), которые участвуют в фосфорилировании -зависимое убиквитинирование. Белки F-бокса делятся на 3 класса: Fbws, содержащие домены WD-40, Fbls, содержащие лейциновые -богатые повторы, и Fbxs, содержащие либо различные модули взаимодействия белок-белок, либо нераспознаваемые мотивы. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к классу Fbls. Для этого гена были обнаружены множественные альтернативно сплайсированные варианты транскрипта, но полноразмерная природа некоторых вариантов не была определена.
Как часть ncPRC1. 1, KDM2B быстро и временно рекрутируется в участки повреждения ДНК PARP1- и TIMELESS-зависимым образом, способствуя моноубиквитилированию гистона H2A на K119 с одновременным локальным снижением уровней H2A и увеличением H2A.Z. Эти события способствуют репрессии транскрипции в повреждениях ДНК, передаче сигналов о двухцепочечном разрыве и восстановлению гомологичной рекомбинации. Активность комплекса ncPRC1.1 в повреждениях ДНК была необходима для правильного рекрутирования двух канонических комплексов PRC1 (cPRC1.2 и cPRC1.4), определяемых их субъединицами PCGF, MEL18 и BMI1 соответственно. Таким образом, рекрутирование комплекса ncPRC1.1 представляет собой ранний и критический этап регуляции восстановления гомологичной рекомбинации.
Потеря KDM2B приводит к серьезным дефектам развития (дефекты роста в головном мозге, включая нарушение закрытия нервной трубки и черепно-лицевые пороки развития, развитие кроветворения), ведущие к эмбриональной летальности
Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, которая находится в общественном достоянии.
.