HAVCR1

редактировать
HAVCR1
Доступные структуры
PDB Human UniProt search: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы HAVCR1, HAVCR, HAVCR-1, KIM-1, KIM1, TIM, TIM-1, TIM1, TIMD-1, TIMD1, CD365, клеточный рецептор 1 вируса гепатита A
Внешние идентификаторыOMIM : 606518 HomoloGene : 134424 Генные карты : HAVCR1
Расположение гена (человек)
Хромосома 5 (человека)
Chr. Хромосома 5 (человек)
Хромосома 5 (человека) Геномное расположение HAVCR1 Геномное расположение HAVCR1
Полоса 5q33.3Начало157,029,413 bp
Конец157,059,119 bp
Экспрессия РНК паттерн
PBB GE HAVCR1 207052 at fs.png
Дополнительные справочные данные по экспрессии
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

26762

н / д

Ensembl

ENSG00000113249

н / д

UniProt

Q96D42

н / д

RefSeq (мРНК)

NM_001099414. NM_001173393. NM_001308156. NM_012206

н / д

RefSeq (белок)

NP_001166864. NP_0012950850242>NP_0012950850248 / a

Location (UCSC)Chr 5: 157.03 - 157.06 Mb нет данных
PubMed поискнет данных
Wikidata
Просмотр / редактирование человека

Клеточный рецептор 1 вируса гепатита A (HAVcr-1), также известный как Т-клеточный иммуноглобулин и домен муцина 1 (TIM-1), представляет собой белок, который в у человека кодируется геном HAVCR1 .

. Он также известен как KIM-1 Kidney Injury Molecule -1, который представляет собой белок, который в наибольшей степени активируется в поврежденных почках при различных типах повреждений. Его повышенная регуляция при повреждении почек была обнаружена в почках позвоночных, таких как рыбки данио и люди.

Клеточный рецептор 1 вируса гепатита A (HAVCR1 / TIM-1) является членом семейства генов TIM (трансмембранные Т-клетки, иммуноглобулин и муцин), которые играют важную роль в регулировании иммунной активность клетки, особенно в отношении ответа хозяина на вирусную инфекцию. TIM-1 также участвует в аллергической реакции, астме и толерантности к трансплантату.

Семейство генов TIM было впервые клонировано из мышиной модели астмы в 2001 году., было продемонстрировано, что члены семейства генов TIM, включая TIM-1, участвуют в иммунном ответе хозяина . Семейство генов TIM мыши состоит из восьми членов (TIM-1-8), в то время как только три гена TIM (TIM-1, TIM-3 и TIM-4 ) были идентифицированы в люди.

Содержание
  • 1 Структура и функции
  • 2 Роль в вирусной инфекции
    • 2.1 Гепатит A
    • 2.2 Эбола
    • 2.3 Денге
  • 3 Ссылки
  • 4 Дополнительная литература
Структура и функция

гены TIM принадлежат к поверхностным гликопротеинам клеточной поверхности типа I, которые включают N-концевой иммуноглобулин (Ig) -подобный домен, муцин домен разной длины, единственный трансмембранный домен и C-концевой короткий цитоплазматический хвост. Локализация и функции генов TIM различны для каждого члена. TIM-1 предпочтительно экспрессируется на клетках Tdiv class="ht" и был идентифицирован как молекула, стимулирующая активацию Т-клеток. TIM-3 преимущественно экспрессируется на клетках Th1 и Tc1 и функционирует как ингибирующая молекула, которая опосредует апоптоз клеток Th1 и Tc1. TIM-4 преимущественно экспрессируется на антигенпрезентирующих клетках, модулируя фагоцитоз апоптозных клеток, взаимодействуя с фосфатидилсерином (PS), экспонированным на поверхности апоптотических клеток.

Роль в вирусной инфекции

Гены TIM также участвуют во взаимодействии вируса-хозяина. В качестве рецепторов фосфатидилсерина белки TIM связывают многие семейства вирусов [филовирус, флавивирус, аренавирус Нового Света и альфавирус], включая такие вирусы, как лихорадка денге и лихорадка Эбола. На проникновение вируса лихорадки Ласса, вируса гриппа A и коронавируса SARS экспрессия TIM-1 не влияла. TIM-1 и TIM-4 увеличивают проникновение вируса больше, чем TIM-3.

Гепатит A

TIM-1 был идентифицирован как фактор прикрепления для экзосомы, упакованной вирус гепатита А (HAV). Инфекционные HAV-содержащие экзосомы интернализуются HAVCR1, но истинное проникновение в цитозоль достигается путем слияния с NPC1. Также было показано, что неэкзосомная инфекция HAV (инкапсидируемая) происходит независимо от экспрессии HAVCR1. Используя библиотеку клонирования экспрессии, было продемонстрировано, что IgA является специфическим лигандом TIM-1. Комбинация TIM-1 и IgA способна усилить взаимодействие вирус-рецептор.

Эбола

Недавно было показано, что TIM-1 является рецептором или кофактор для записи вируса Эбола. TIM-1 связывается с гликопротеинами (GP) вируса Эбола и опосредует проникновение вируса Эбола в клетки, повышая инфекционность вируса Эбола в клеточных линиях с низкой чувствительностью. Более того, снижение экспрессии эндогенного TIM-1 в высокопермиссивных клеточных линиях снижает инфекционность вируса Эбола. Кроме того, специфическое антитело ARD5 к домену TIM-1 IgV ингибировало инфекционность вируса Эбола, что указывает на то, что TIM-1 имеет решающее значение для проникновения вируса Эбола. Кроме того, экспрессия TIM-1 на эпителиальных клетках слизистой оболочки человека из трахеи, роговицы и конъюнктивы продемонстрировала корреляцию функции экспрессии TIM-1 и путей проникновения вируса.

Денге

TIM-1 был идентифицирован как клеточный фактор для проникновения вируса денге за счет сверхэкспрессии TIM-1 на слабо восприимчивых клеточных линиях к инфекции вируса денге. TIM-1 увеличил инфекционность вируса денге в 500 раз, в частности, увеличил интернализацию вируса. TIM-1 напрямую взаимодействовал с частицей вируса денге, распознавая PS на поверхности вириона. Кроме того, чувствительность различных клеточных линий к вирусу Денге соответствовала уровню эндогенной экспрессии гена TIM-1 в таких клеточных линиях, что позволяет предположить, что TIM-1 имеет решающее значение для проникновения вируса Денге.

Ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-05-22 08:12:26
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте