Войти
| Ингибитор диссоциации GDP | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура двойного пренилированный комплекс ypt1: gdi | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | GDI | ||||||||||
| Pfam | PF00996 | ||||||||||
| Pfam клан | CL0063 | ||||||||||
| InterPro | IPR018203 | ||||||||||
| SCOPe | 1gnd / SUPFAM | ||||||||||
| |||||||||||
В молекулярной биологии ингибиторы диссоциации гуанозина (GDI s) составляют семейство малых GTPases, которые выполняют регуляторную роль в везикулярном мембранном движении. GDI связываются с GDP-связанной формой Rho и Rab малых GTPases и не только предотвращают обмен (поддержание малой GTPase в выключенном состоянии), но также предотвращают локализацию малой GTPase на мембране, что это их место действия. Это ингибирование может быть снято действием фактора смещения GDI. GDI также ингибируют cdc42, связываясь с его хвостом и предотвращая его встраивание в мембраны; следовательно, он не может запускать WASP и не может привести к зарождению F- актина.
C-терминал GDIs 'C-терминал геранилгеранилирование имеет решающее значение для их мембран ассоциация и функция. Эта посттрансляционная модификация катализируется Rab геранилгеранилтрансферазой (Rab-GGTase), многосубъединичным ферментом, который содержит каталитический гетеродимер и вспомогательный компонент, называемый белок сопровождения Rab (REP) -1. REP-1 представляет вновь синтезированные Rab белки в каталитический компонент и образует стабильный комплекс с пренилированными белками после реакции переноса. Механизм REP-1-опосредованной мембранной ассоциации Rab5 аналогичен механизму, опосредованному ингибитором диссоциации Rab GDP (GDI). REP-1 и Rab GDI также обладают другими функциональными свойствами, включая способность ингибировать высвобождение GDP и удалять белки Rab с мембран.
Кристаллическая структура бычьей альфа- изоформы Rab GDI была определена с разрешением 1,81 Ангстрем. Белок состоит из двух основных структурных единиц: большого сложного многослойного домена I и меньшего альфа-спирального домена II.
Структурная организация домена I тесно связана с FAD -содержащими монооксигеназами и оксидазами. Консервативные области, общие для GDI и продукта гена хориодеремии , который доставляет Rab в каталитические субъединицы Rab геранилгеранилтрансферазы II, сгруппированы на одном лицо домена. Два наиболее консервативных участка образуют компактную структуру на вершине молекулы; сайт-направленный мутагенез показал, что эти области играют решающую роль в связывании белков Rab.
