Войти
| Альфакоронавирус | |
|---|---|
 | |
| Вирус эпидемической диареи свиней геном и структура вириона | |
Классификация вируса  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Pisuviricota |
| Класс: | Pisoniviricetes |
| Порядок: | Nidovirales |
| Семейство: | Coronaviridae |
| Подсемейство: | Orthocoronavirinae |
| Род: | Alphacoronavirus |
| Подроды и виды | |
См. Текст | |
Alphacoronaviruses (Alpha-CoV) являются представителями первого из четырех родов (Alpha-, Beta-, Gamma- и Delta- ) коронавирусы. Они представляют собой одноцепочечные одноцепочечные РНК-вирусы с положительным смыслом, которые инфицируют как людей, так и млекопитающих. У них есть сферические вирионы с булавовидными выступами на поверхности и вирусной оболочкой.
Alphacoronavirinae относятся к подсемейству Orthocoronavirinae семейства Coronaviridae. И альфа-, и бетакоронавирусные линии происходят от генофонда вирусов летучих мышей. Альфакоронавирусы ранее были известны как «коронавирусы филогруппы 1».
Название альфа-коронавирус происходит от древнегреческого ἄλφα (álpha, «первая буква греческого алфавита «) и κορώνη (korṓnē,« гирлянда, венок »), что означает корона, которая описывает внешний вид видимых под электронной микроскопией выступов на поверхности, которые напоминают солнечную корону.
Вирион имеет оболочку сферической формы диаметром 120–160 нм и сердцевиной оболочки около 65 нм. Гликопротеины и тримеры образуют большие выступы на поверхности, которые создают вид солнечной короны. Этот род, как и другие коронавирусы, имеет белок-шип с машиной слияния типа II (S2) и рецептор-связывающим доменом (S1). Он собирается в тример. В отличие от бета- и гаммакоронавирусов, этот белок не расщепляется на две половины.
Генетическая взаимосвязь между различными генотипами коронавирусов кошек (FCov) и коронавирусов собак (CCoV). Рекомбинация, обозначенная стрелками. Геном представляет собой положительно-смысловую, одноцепочечную РНК длиной от 27 до 29 тысяч оснований и 3’-полиА-хвостом. Две большие перекрывающиеся ORF на 5'-конце генома кодируют основные неструктурные белки, экспрессируемые как слитый белок посредством рибосомного сдвига рамки считывания. К ним относятся области с мотивами протеазы, геликазы и РНК-полимеразы. Следующие семь генов кодируют структурные белки. Они экспрессируются из 3'-котерминального вложенного набора субгеномных мРНК.
Оба типа альфакоронавируса 1, коронавируса кошек (FCoV) и коронавирус собак (CCoV), как известно, существует в двух серотипах. Серотип II нацелен на аминопептидазу N, тогда как рецептор для серотипа I неизвестен. Разница связана с другим белком-шипом. Есть общий предок FCoV и CCoV. Этот предок постепенно превратился в FCoV I и CCoV I. Белок S из неизвестного вируса был рекомбинирован в предка и дал начало CCoV II. CCoV II снова рекомбинировал с FCoV для создания FCoV II. CCoV II постепенно превратился в TGEV. Удаление пика в TGEV создает PRCV. Все эти вирусы разделены на подрод.
Филогенетическое дерево рода Alphacoronaviruses с животными-хозяевами, указанными справа. Выделяются следующие подроды и виды:
