Белок Риске из комплекса цитохрома b6f. ( PDB : 1vf5 ) | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Условное обозначение | Rieske | ||||||||
Pfam | PF00355 | ||||||||
ИнтерПро | IPR005806 | ||||||||
ПРОФИЛЬ | PDOC00177 | ||||||||
SCOP2 | 1rie / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
TCDB | 3.E.2 | ||||||||
OPM суперсемейство | 92 | ||||||||
Белок OPM | 1q90 | ||||||||
CDD | cd03467 | ||||||||
|
Цитохром B6-F комплекс Fe-S субъединица, альфа-спиральный трансмембранный домен | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
кристаллическая структура комплекса цитохрома b6f из m.laminosus | |||||||||
Идентификаторы | |||||||||
Условное обозначение | CytB6-F_Fe-S | ||||||||
Pfam | PF08802 | ||||||||
ИнтерПро | IPR014909 | ||||||||
|
Rieske белки являются белком железо-сера (ISP): компоненты цитохрома BC 1 комплексов и цитохрома б 6 е комплексов и отвечают за перенос электронов в некоторых биологических системах. Джон С. Риске и его сотрудники впервые открыли этот белок и в 1964 году выделили ацетилированную форму митохондриального белка крупного рогатого скота. В 1979 году лаборатория Трампауэра выделила «фактор окисления» из митохондрий крупного рогатого скота и показала, что это восстановительно-активная форма железо-серного белка Риске. Это уникальный кластер [2Fe-2S], в котором один из двух атомов Fe координируется два остатка гистидина, а не два остатка цистеина. С тех пор они были обнаружены у растений, животных и бактерий с широким диапазоном потенциалов восстановления электронов от -150 до +400 мВ.
Убихинол-цитохром-с редуктаза (также известная как комплекс bc1 или комплекс III) представляет собой ферментный комплекс бактериальной и митохондриальной систем окислительного фосфорилирования. Он катализирует окислительно-восстановительную реакцию мобильных компонентов убихинола и цитохрома с, внося свой вклад в разность электрохимических потенциалов на внутренней или бактериальной мембране митохондрий, что связано с синтезом АТФ.
Комплекс состоит из трех субъединиц в большинстве бактерий и девяти в митохондриях: как бактериальные, так и митохондриальные комплексы содержат субъединицы цитохрома b и цитохрома c1, а также железо-серную субъединицу «Риске», которая содержит высокопотенциальный кластер 2Fe-2S. Митохондриальная форма также включает шесть других субъединиц, не имеющих окислительно-восстановительных центров. Пластохинон-пластоцианинредуктаза (комплекс b6f), присутствующая в цианобактериях и хлоропластах растений, катализирует окислительное восстановление пластохинола и цитохрома f. Этот комплекс, который функционально подобен убихинол-цитохром с редуктазе, включает цитохром b6, цитохром f и субъединицы Риске.
Субъединица Риске действует, связывая либо убихинол, либо пластохинол- анион, передавая электрон на кластер 2Fe-2S, а затем высвобождая электрон на цитохром с или цитохром f гемовое железо. Восстановление центра Риске увеличивает сродство субъединицы на несколько порядков, стабилизируя семихиноновый радикал в сайте Q (P). Домен Риске имеет центр [2Fe-2S]. Два консервативных цистеина координируют один ион Fe, в то время как другой ион Fe координируется двумя консервативными гистидинами. Кластер 2Fe-2S связан в высококонсервативной С-концевой области субъединицы Риске.
Гомологи этих белков Rieske включают ISP компоненты цитохрома Ь 6 F сложных, ароматическое кольцо-гидроксилирование-диоксигеназ (фталат диоксигеназу, бензол, нафталин и толуол 1,2-диоксигеназ) и Арсенит оксидазу ( EC 1.20.98.1 ). Сравнение аминокислотных последовательностей выявило следующую консенсусную последовательность:
Кристаллические структуры ряда белков Риске известны. В общей складке, состоящей из двух субдоменов, преобладает антипараллельная β-структура и содержится переменное количество α-спиралей. Меньшие субдомены "связывания кластера" в митохондриальных и хлоропластных белках практически идентичны, тогда как большие субдомены существенно различаются, несмотря на общую топологию сворачивания. Субдомены связывания кластера [Fe 2 S 2 ] имеют топологию неполного антипараллельного β-ствола. Один атом железа кластера Риске [Fe 2 S 2 ] в домене координирован двумя остатками цистеина, а другой - двумя остатками гистидина через атомы N δ. Лиганды, координирующие кластер, происходят из двух петель; каждая петля вносит один Cys и один His.