Войти
| Apocytochr_F_C | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 цитохром f из комплекса b6f Phormidium ламинозум | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Apocytochr_F_C | ||||||||
| Pfam | PF01333 | ||||||||
| Pfam клан | CL0105 | ||||||||
| InterPro | IPR002325 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00169 | ||||||||
| SCOPe | 1ctm / SUPFAM | ||||||||
| TCDB | 3.D.3 | ||||||||
| суперсемейство OPM | 92 | ||||||||
| белок OPM | 3h1j | ||||||||
| |||||||||
Цитохром f является самой большой субъединицей комплекса цитохрома b 6 f (пластохинол-пластоцианинредуктаза; EC 1.10.99.1 ). По своей структуре и функциям комплекс цитохрома b6f имеет обширную аналогию с комплексом цитохрома bc1 митохондрий и фотосинтетическими пурпурными бактериями. Цитохром f (cyt f) играет роль, аналогичную роли цитохрома c1, несмотря на их различные структуры.
Трехмерная структура cyt f Brassica rapa (репы ) была определена. Сегмент cyt f со стороны просвета включает два структурных домена: маленький над большим, который, в свою очередь, находится над местом прикрепления к мембранному домену. Большой домен состоит из антипараллельного бета-сэндвича и короткого гемосвязывающего пептида, которые образуют трехслойную структуру . Малый домен вставлен между бета-цепями F и G большого домена и является полностью бета-доменом. Гем располагается между двумя короткими спиралями на N-конце cyt f. Внутри второй спирали находится мотив последовательности для цитохромов c-типа, CxxCH (остатки 21-25), который ковалентно присоединен к гему через тиоэфир. связывает с Cys-21 и Cys-24. His-25 является пятым лигандом гема железа . Шестой железный лиганд гема представляет собой альфа-аминогруппу Tyr-1 в первой спирали. Cyt f имеет внутреннюю сеть из молекул воды, которые могут функционировать как протонная проволока. Водная цепь, по-видимому, является консервативным признаком cyt f.
