База данных классификации транспортеров
редактировать
классификация мембранных белков, включая ионные каналы
База данных классификации транспортеров (или TCDB ) - это утвержденная Международным союзом биохимии и молекулярной биологии (IUBMB) система классификации для мембранных транспортных белков, включая ионных каналов.
Содержание
- 1 Классификация
- 1.1 1. Каналы и поры
- 1.1.1 1.A каналы α-типа
- 1.1.2 1.B. β-бочкообразные порины и другие белки внешней мембраны
- 1.1.3 1.C Порообразующие токсины (белки и пептиды)
- 1.1.4 1.D Каналы, не синтезируемые рибосомами
- 1.1.5 1.E Холины
- 1.1.6 1.F Поры слияния везикул
- 1.1.7 1.G Поры слияния вирусов
- 1.1.8 1.H Параклеточные каналы
- 1.1.9 1.I Связанные с мембраной каналы
- 1,2 2. Электрохимические переносчики потенциала
- 1.2.1 2.A Портеры (унипортеры, симпортеры, антипортеры)
- 1.2.2 2.B Нерибосомно синтезированные переносчики
- 1.2.3 2.C Ионно- активизаторы, управляемые градиентом
- 1.3 3. Первичные активные транспортеры
- 1.3.1 3.A. Транспортеры, управляемые гидролизом P-P-связи
- 1.3.2 3.B Транспортеры, управляемые декарбоксилированием
- 1.3.3 3.C Транспортеры, управляемые метилпереносом
- 1.3.4 3.D. Транспортеры, управляемые окислением и восстановлением
- 1.3.5 3.E. Транспортеры, управляемые поглощением света
- 1.4 4. Групповые транслокаторы
- 1.4.1 4.A Групповые транслокаторы, управляемые фосфопереносом
- 1.4.2 4.B Транспортеры захвата никотинамид-рибонуклеозида
- 1.4.3 4.C Ацил Транспортеры, связанные с КоА-лигазой
- 1.4.4 4.D Полисахарид-синтаза / Экспортеры
- 1.4.5 4.E. Групповые транслокаторы, катализируемые вакуолярными полифосфат-полимеразой
- 1,5 5. Транспортные переносчики электронов
- 1.5.1 5.A Трансмембранные переносчики 2-электронов
- 1.5.2 5.B Трансмембранные переносчики 1-электронов
- 1,6 8. Дополнительные факторы, участвующие в транспорте
- 1.6.1 8.A Вспомогательные транспортные белки
- 1.6.2 8.B Белковые / пептидные токсины, синтезируемые рибосомами, которые нацелены на каналы и носителей
- 1.6.3 8.C Не- синтезированные рибосомами токсины, которые нацелены на каналы и носители
- 1,7 9. Не полностью охарактеризованные транспортные системы
- 1,7.1 9.A Распознанные переносчики с неизвестным биохимическим механизмом
- 1.7.2 9.B Предполагаемые транспортные белки
- 1.7. 3 9.C Функционально охарактеризованные транспортеры без идентифицированных последовательностей
- 2 Ссылки
- 3 Внешние ссылки
Классификация
Верхний уровень классификации и несколько примеров белков с известной трехмерной структурой:
1.A каналы α-типа
- 1.A.1 Суперсемейство управляемых напряжением ионных каналов
- 1.A.2 Семейство K-каналов с внутренним выпрямителем
- 1.A.3 Семейство Ca-каналов рианодин-инозитол-1,4,5-трифосфатного рецептора
- 1.A.4 Переходный потенциал рецептора семейства Ca-каналов
- 1.A.5 Семейство катионных каналов полицистина
- 1.A.6 Семейство эпителиальных Na-каналов
- 1.A.7 Семейство катионных каналов АТФ-управляемых рецепторов P2X
- 1.A.8 Основное суперсемейство внутренних белков
- 1.A.9 Рецептор нейротрансмиттера, петля Cys, семейство лиганд-зависимых ионных каналов
- 1.A.10 Глутамат-зависимый Семейство ионных каналов из рецепторов нейротрансмиттеров
- 1.A.11 Семейство транспортеров аммониевых каналов
- 1.A.12 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов
- 1.A.13 Семейство эпителиальных хлоридных каналов
- 1.A.14 Семейство передачи генов, усиленных семенниками
- 1.A.15 Семейство неселективных катионных каналов-2
- 1.A.16 Семейство переносчиков формиата-нитрита
- 1.A.17 Семейство кальцийзависимых хлоридных каналов
- 1.A.18 Семейство Tic110, образующее анионный канал в оболочке хлоропласта
- 1.A.19 Семейство каналов матрикс-2 вируса гриппа типа A
- 1.A.20 BCL2 / Adenovirus E1B-взаимодействующий белок 3, семейство
- 1.A.21 Bcl-2 семейство
- 1.A.22 механочувствительный ионный канал с большой проводимостью
- 1.A.23 Механочувствительный ионный канал с малой проводимостью
- 1.A.24 Семейство коннексинов, формирующих щелевые соединения
- 1.A.25 Щелевые соединения- образует семейство иннексинов
- 1.A.26 Семейство транспортеров Mg-E
- 1.A.27 Семейство фосфолемманов
- 1.A.28 Семейство транспортеров мочевины
- 1.A.29
- 1.A.30
- 1.A.31 Семейство аннексинов
- 1.A.32
- 1.A.33 Семейство белков теплового шока 70, образующих катионные каналы
- 1.A.34
- 1.A.35 Семейство переносчиков ионов металлов CorA
- 1.A.36 Семейство внутриклеточных хлоридных каналов
- 1.A.37
- 1.A.38
- 1.A.39
- 1.A.40 Человек вирус иммунодефицита типа I Vpu канал Семейство el
- 1.A.41
- 1.A.42
- 1.A.43
- 1.A.44
- 1.A.45
- 1.A.46
- 1.A.47
- 1.A.48
- 1.A.49
- 1.A.50 Семейство фосфоламбанов (регулятор Са-канала и Са-АТФазы)
- 1.A.51 Семейство управляемых напряжением протонных каналов (VPC)
- 1. A.52 Семейство Ca (CRAC) каналов (CRAC-C)
- 1.A.53 Семейство катион-селективных каналов виропорина P7 вируса гепатита C (HCV-P7)
- 1.A.54 Семейство Presenilin ER Ca Leak Channel (пресенилин)
- 1.A.55 Ca-канал, связанный с синаптическими пузырьками, семейство цветков
- 1.A.56 Семейство переносчиков меди (Ctr)
- 1.A.57 Виропорин коронавируса SARS человека (SARS-VP)
- 1.A.58 Матричный белок 2 вируса гриппа типа B ( BM2-C) Семейство
- 1.A.59 Порообразующий пептид вируса болезни носа, семейство Pep46 (Pep46)
- 1.A.60 Пептид, преобразующий реовирус млекопитающих, Mu -1 (Му-1) Семья
- 1.A.61 Насекомое Нодави rus Семейство каналообразующих цепей F (гамма-пептид)
- 1.A.62 Семейство гомотримерных катионных каналов (TRIC)
- 1.A.63 α-спиральный порин внешней мембраны Ignicoccus (Семейство I-OMP
- 1.A.64 Семейство плазмолипинов (плазмолипинов)
- 1.A.65 Семейство белков коронавируса Виропорин E (Виропорин E)
- 1.A.66 Семейство пардаксина (пардаксина)
- 1.A.67 Семейство мембранных переносчиков Mg (MMgT)
- 1.A.68 Вирусный малый гидрофобный виропорин (V-SH) Семейство
- 1.A.69 Семейство каналов рецепторов гетеромерного одоранта (HORC)
- 1.A.70 Молекула против микробов A (MamA) Семейство
- 1.A.71 Семейство кислотно-растворимых белков мозга (канал BASP1)
- 1.A.72 Надсемейство Mer
- 1.A.73 Семейство белков лизиса колицина (CLP)
- 1.A.74 Семейство мицугуминов 23 (MG23)
- 1.A.75 Механические ноцицепторы, семейство пьезо (пьезо)
- 1.A.76 Транспортер магния1 ( MagT1) Семейство
- 1.A.77 Mg / Ca Uniporter (MCU) Семейство
- 1.A.78 K-селективный канал в эндосомах и лизосомах (KEL) Семейство
- 1.A.79 Белок захвата холестерина (ChUP) или семейство захвата двухцепочечной РНК
- 1.A.80 Семейство виропоринов NS4a (NS4a)
- 1.A.81 Семейство низкоаффинных Са-каналов (LACC)
- 1.A.82 Семейство каналов механотрансдукции волосковых клеток (HCMC)
- 1.A.83 Семейство вирусов SV40 Viroporin VP2 (SV40 VP2)
- 1.A.84 Ca-канал модулятора гомеостаза кальция (CALHM-C) Семейство
- 1.A.85 Семейство полиовируса 2B Виропорин (2B Виропорин)
- 1.A.86 Семейство вируса папилломы человека типа 16 (HPV16) L2 виропорин (L2 виропорин)
- 1.A.87 Семейство механочувствительных кальциевых каналов (MCA)
- 1.A.88 Семейство грибковых калиевых каналов (F-Kch)
- 1.A.89 Семейство человеческих коронавирусов 229E виропорин (229E виропорин)
- 1.A.90 Семейство виропоринов (HMPV-виропорин) человеческого метапневмовируса (HMPV)
- 1.A.91 Асексуал, связанный с цитоадгезией Protei n 3.2 семейства Plasmodium falciparum (Clag3)
- 1.A.92 Семейство реовирусов Viroporin VP10 (RVP10)
- 1.A.93 Неструктурный белок 3 вируса синего языка Виропорин (NS3) Семейство
- 1.A.94 Семейство ротавирусных неструктурных гликопротеинов 4 виропоринов (NSP4)
- 1.A.95 Семейство эфемеровирусов виропоринов (EVVP)
- 1.A.96 Семейство виропоринов вируса полиомы человека (PVVP)
- 1.A.97 Семейство виропоринов E5 вируса папилломы человека типа 16 (HPV-E5)
- 1.A.98 T человека -Лимфотропный белок P13 вируса 1 (HTLV1-P13) Семейство
- 1.A.99 Семейство малых мембранных белков E оболочки вируса инфекционного бронхита (IBV-E)
- 1.A.100 Rhabdoviridae Предполагаемое семейство виропоринов U5 (RV-U5)
- 1.A.101 Семейство пероксисомальных порообразующих Pex11 (Pex11)
- 1.A.102 Виропорин PB1-F2 гриппа A ( PB1-F2) Семейство
- 1.A.103 Семейство обезьяньего вируса 5 (вирус парагриппа 5) SH (SV5-SH)
- 1.A.104 Предлагаемый Na канал биосинтеза жгутиков, FlaH (F laH) Семейство
- 1.A.105 Семейство киназных доменов смешанного происхождения (MLKL)
- 1.A.106 Семейство кальциевых каналов, активируемых нагрузкой кальция (CLAC)
- 1.A.107 Семейство порообразующих глобинов (глобинов)
- 1.B.1 Общее бактериальное семейство поринов
- 1.B.2 Хламидийное семейство поринов (CP)
- 1.B.3 Семейство сахарных поринов (SP)
- 1.B.4 (BRP) Семейство
- 1.B.5 Pseudomonas Семейство поринов OprP (POP)
- 1.B.6 Семейство поринов OmpA-OmpF (OOP)
- 1.B.7 Семейство поринов Rhodobacter PorCa (RPP)
- 1.B.8 Семейство митохондриальных и пластидных поринов (MPP)
- 1.B.9 Семейство белков внешней мембраны FadL (FadL)
- 1.B.10 Семейство нуклеозид-специфичных каналообразующих поринов внешней мембраны (Tsx)
- 1.B.11 Семейство фимбриальных поринов-активистов внешней мембраны (FUP)
- 1.B.12 Автотранспортер-1 (AT-1) семейство
- 1.B.13 (AEP) семейство
- 1.B.14 семейство рецепторов наружной мембраны (OMR)
- 1.B. 15 Семейство рафинозопоринов (RafY)
- 1.B.16 Семейство короткоцепочечных амидов и мочевинных поринов (SAP)
- 1.B.17 Семейство факторов внешней мембраны (OMF)
- 1.B.18 Дополнительная защита внешней мембраны (OMA) Семейство ein
- 1.B.19 Глюкозоселективное семейство поринов OprB (OprB)
- 1.B.20 Семейство секреции двух партнеров (TPS)
- 1.B.21 Семейство поринов OmpG (OmpG)
- 1.B.22 Семейство секретинов (секретинов) внешней бактериальной мембраны
- 1.B.23 Семейство цианобактериальных поринов (CBP)
- 1.B.24 Микобактериальный порин
- 1.B.25 Семейство поринов внешней мембраны (Opr)
- 1.B.26 Семейство циклодекстринпоринов (CDP)
- 1.B.31 Campylobacter jejuni семейство ооринов основной внешней мембраны (MomP)
- 1.B.32 Семейство поринов внешней мембраны фузобактерий (FomP)
- 1.B.33 Вставка белка внешней мембраны семейство поринов (комплекс Bam) (OmpIP)
- 1.B.34 Коринебактериальные порины
- 1.B.35 Семейство олигогалактуронат-специфических поринов (KdgM)
- 1.B.39 Бактериальный порин, семейство OmpW (OmpW)
- 1.B.42 Семейство экспортных поринов липополисахаридов внешней мембраны (LPS-EP)
- 1.B.43 Семейство Coxiella porin P1 (CPP1)
- 1.B.44 Вероятная транслокация белка porphyromonas gingivalis por в семействе (PorT)
- 1.B.49 Семейство поринов Anaplasma P44 (A-P44)
- 1.B.48 Curli-like транспортеры
- 1.B. 54 Intimin / Invasin (Int / Inv) или Autotransporter-3 семейство
- 1.B.55 Семейство полиацетил-D-глюкозаминпоринов (PgaA)
- 1.B.57 Семейство белков внешней мембраны Legionella (LM-OMP)
- 1.B.60 Семейство поринов Omp50 (Omp50 поринов)
- 1.B. 61 Семейство дельта-протеобактериальных поринов (дельта-поринов)
- 1.B.62 Предполагаемое семейство бактериальных поринов (PBP)
- 1.B.66 Предполагаемый бета-цилиндрический порин-2 (BBP2) семейство
- 1.B.67 Предполагаемое семейство бета-стволовых поринов-4 (BBP4)
- 1.B.68 Предполагаемое суперсемейство бета-ствольных поринов-5 (BBP5)
- 1.B.70 Семейство наружных мембранных каналов (OMC)
- 1.B.71 Семейство протеобактериальных / веррукомикробных поринов (PVP)
- 1.B.72 Порин внешней мембраны протохламидий (PomS / T) семейство
- 1.B.73 Семейство биогенеза / сборки капсул (CBA)
- 1.B.78 DUF3374 Семейство поринов, связанных с переносом электронов (ETPorin)
1.D Каналы, синтезированные не рибосомами
- 1.D.1 Семейство каналов грамицидин A
- 1.D.2 Каналообразующее Сирингомицин Семейство
- 1.D.3 Семейство каналообразующих сирингопептинов
- 1.D.4 Семейство толаазиновых каналов
- 1.D.5 Аламетицин или Пептаибол Канальная форма антибиотика Семейство ing
- 1.D.6 Семейство комплексных поли 3-гидроксибутиратных каналов Са (cPHB-CC)
- 1.D.7 Семейство бетиколина
- 1.D.8 Семейство сапонинов
- 1.D.9 Семейство ионных каналов (PG-IC)
- 1.D.10 Керамид -формирование семейства каналов
- 1.D.11 Семейство сурфактина
- 1.D.12 Семейство Боверицина (Боверицина)
- 1.D.13 Амфипатические пептидные антибиотики с доставкой ДНК (DAPA)
- 1.D.14 Семейство синтетических Leu / Ser амфипатических каналообразующих пептидов (l / S-SCP)
- 1.D. 15 Семейство даптомицина (даптомицина)
- 1.D.16 Семейство синтетических амфипатических порообразующих гептапептидов (SAPH)
- 1.D.17 Комбинаторно-разработанное, порообразующее, β- лист Семейство пептидов
- 1.D.18 Семейство порообразующих конъюгатов гуанозин-желчная кислота
- 1.D.19 Препарат, образующий канал Са, Дигитоксин Семейство
- 1.D.20 Семейство порообразующих полиеновых макролидных антибиотиков / грибковых агентов (PMAA)
- 1.D.21 Lipid Nanopo re (LipNP) Семейство
- 1.D.22 Каротиноидный пигмент, перемещающий протоны, Зеаксантин Семья
- 1.D.23 Фениленэтиниленовый порообразующий антимикробный препарат (PEPA) Семейство
- 1.D.24 Семейство морских губок из политеонамида B (pTB)
- 1.D.25 Семейство ариламиновых фолдамеров (AAF)
- 1.D. 26 Семейство 9'-O-β-D-глюкозидов дигидродегидродикониферилового спирта (DDDC9G)
- 1.D.27 Семейство изостер тиомочевины
- 1.D.28 Семейство липопептаиболов
- 1.D.29 Семейство макроциклических олигохолатов
- 1.D.30 Семейство искусственных гидразид-связанных столбов [5] ареновых каналов (HAPA-C)
- 1.D. 31 Семейство Амфотерицин B
- 1.D.32 Семейство порообразующих
- 1.D.33 Семейство каналообразующих
- 1.D.34 Каналообразующие олигоэфирные Bolaamphiphiles
- 1.D.35 Порообразующие циклические семейства
- 1.D.36 Семейство ионных каналов
- 1. D.37 Семейство
- 1.D.38 Семейство циклических пептидных нанотрубок (cPepNT)
- 1.D.3 9 Семейство контролируемых светом амфифильных молекулярных ионных каналов на основе азобензола (AAM-IC)
- 1.D.40 Семейство тороидальных липидных пор, индуцированных белком
- 1.D.41 Спротетонат Семейство ионофоров (спирогексанолидов) типа
- 1.D.42 Семейство Phe-Arg трипептид-столб [5] ареновый канал (TPPA-C)
- 1.D.43 Триазол- семейство адаптированных гуанозиндинуклеозидных каналов (TT-GDN-C)
- 1.D.44 Синтетические ионные каналы с редокс-активным ферроценом (ICRF) Семейство
- 1.D.45 Сонопорация и Семейство пор мембран электропорации (SEMP)
- 1.D.46 Семейство ДНК-нанопор (DnaNP)
- 1.D.47 Семейство порообразующих синтетических циклических пептидов (PSCP)
- 1.D.48 Семейство порообразующих Сирингомицина E
- 1.D.49 Семейство трансмембранных каротиноидных радикальных каналов (CRC)
- 1.D.50 Семейство переносчиков амфифильных бис-катехол-анионов (AC-AT)
- 1.D.51 Семейство белковых нанопор (ProNP)
- 1.D.52 Нанопо макроцикла ароматических олигоамидов Семейство re (OmnNP)
- 1.D.53 Семейство альфа, гамма-пептидных нанотрубок (a, gPepNT)
- 1.D.54 Калий-селективный гексил-бензоуреидо-15- Семейство краун-5-эфирных ионных каналов (HBEC)
- 1.D.55 Семейство нанопор на основе порфирина (PorNP)
- 1.D.56 Олигомерный альфа-аминоизобутират (Aib) Семейство нанопор (AibNP)
- 1.D.57 Семейство липидных электро-пор (LEP)
- 1.D.58 Семейство продигиозена (продигиозена), переносящего анионы
- 1.D.59 Семейство переносчиков анионов перенозина (перенозина)
- 1.D.60 Семейство альфа, гамма-циклических пептидов (AGCP)
- 1.D.61 Анионофорное 2, Семейство 6-бис (бензимидазол-2-ил) пиридина (ABBP)
- 1.D.62 Семейство производных бис-триазолилдигуанозина, образующих каналы (TDG)
- 1.D.63 Семейство нанопор на основе пептидов (PepNP)
- 1.D.64 Семейство углеродных нанотрубок (CarNT)
- 1.D.65 Семейство порообразующих амфидинолов (амфидинол)
- 1.D.66 Семейство спиральных макромолекул и нанопор (HmmNP)
- 1.D.67 Семейство спиральных пептидных ионных каналов (CEHP), модифицированных эфиром Краун
- 1.D.68 Семейство порообразующих плейроновых блочных полимеров (PPBP)
- 1. D.69 Семейство конических нанопор (ConNP)
- 1.D.70 Семейство металлических (Au / Ag / Pt / графен) нанопор (MetNP)
- 1.D.71 Синтетические Семейство пептидов TP359 (TP359)
- 1.D.72 Семейство триазиновых рецепторов на основе хлорид-носителей (CCTTR)
- 1.D.73 Семейство мезопористых нанопор кремнезема (SilNP)
- 1.D.74 Семейство синтетических жестких п-октифенилстейвных пор (SSROP), реагирующих на стимул
1.E Холины- 1.F.1 Семейство слияния синаптосомных пузырьков (SVF-Pore)
- 1.F.2 Семейство октамерных экзоцист (экзоцист)
- 1.G.1 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков-1 (VMFP1)
- 1.G.2 Вирусные порообразующие слитые мембранные протеины-2 (VMFP2) Семья
- 1.G.3 Защита от слияния вирусных порообразующих мембран Семейство ein-3 (VMFP3)
- 1.G.4 Семейство вирусных порообразующих мембранных слитых белков (VMFP4)
- 1.G.5 Вирусные порообразующие слитые мембраны Семейство белков-5 (VMFP5)
- 1.G.6 Семейство слитых белков гепаднавируса S (белок HBV-S)
- 1.G.7 Слитые белки FAST реовируса (R-FAST) Семейство
- 1.G.8 Семейство слитых белков аренавируса (AV-FP)
- 1.G.9 Семейство синцитина (синцитина)
- 1.G. 10 Семейство слитых мембранных комплексов вируса простого герпеса (HSV-MFC)
- 1.G.11 Семейство комплексов входных белков поксвирусных клеток (PEP-C)
- 1.G.12 Птичий лейкоз Семейство слитых белков вируса gp95 (ALV-gp95)
- 1.G.13 Семейство малых трансмембранных белков, связанных с слиянием ортореовирусов (FAST)
- 1.G.14 Гемагглютинин / поры слияния вируса гриппа Семейство гриппа-образующих белков (Influenza-H / FPP)
- 1.G.15 Семейство гликопротеинов основной оболочки вируса ядерного полиэдроза Autographa californica GP64 (GP64)
- 1.G.16 Иммунодефицит человека Vi rus Семейство слитых пептидов типа 1 (ВИЧ-1) (HIV-FP)
- 1.G.17 Семейство гликопротеинов оболочки вируса лейкемии крупного рогатого скота (BLV-Env)
- 1.G.18 Пептид слияния SARS-CoV в семействе предшественников гликопротеинов Spike (SARS-FP)
- 1.G.19 Семейство ротавирусных порообразующих комплексов слияния мембран (Rotavirus MFC)
- 1.G.20 Семейство гликопротеинов слияния с оболочкой Gc хантавируса (Gc-EFG)
- 1.G.21 Семейство вирусов Эпштейна-Барра (вирус герпеса 4 человека) Gp42 (Gp42)
- 1.G. 22 Семейство гликопротеинов gO (gO) цитомегаловируса (вируса герпеса человека 5)
1.H
- 1.H.1 Семейство Claudin Tight Junction (Claudin1)
- 1. H.2 Семейство PMP22-Claudin (Claudin2) беспозвоночных
1.I
2. Транспортеры, управляемые электрохимическим потенциалом
- 2.A.1 Суперсемейство Major Facilitator (MFS), см. Также Лактозопермеаза, Фосфатпермеаза и Транспортер глюкозы
- 2.A.2 Гликозид-пентозид-гексуронид ( GPH): Семейство катионов-симпортеров
- 2.A.3 Семейство аминокислот-полиамин-органических соединений (APC)
- 2.A.4 Семейство катализаторов диффузии катионов (CDF)
- 2.A.5 Цинк (Zn) -Iron (Fe) пермеаза Семейство
- 2.A.6 Надсемейство «резистентность-нодуляция-деление клеток» см. также мембранный белок, экспортирующий белок SecDF
- 2.A.7 Суперсемейство переносчик наркотиков / метаболитов (DMT)
- 2.A.8 Глюконат: Семейство H-симпортеров (GntP)
- 2.A.9 Семейство мембранных протеиновых инсертаз (YidC / Alb3 / Oxa1)
- 2.A.10 Транспортер 2-кето-3-дезоксиглюконата ( Семейство KdgT)
- 2.A.11 Симпортер цитрат-Mg: H (CitM) цитрат-Ca: H (CitH) (CitMHS) Fam ily
- 2.A.12 АТФ: семейство антипортеров АДФ
- 2.A.13 Семейство поглощения C4-дикарбоксилата (Dcu)
- 2.A.14 Семейство лактатпермеаз
- 2.A.15 Семейство переносчиков бетаина / карнитина / холина (BCCT)
- 2.A.16 Устойчивость к теллуриту / переносчик дикарбоксилата Семейство
- 2.A.17 Семейство протон-зависимых переносчиков олигопептидов
- 2.A.18 Семейство аминокислот / ауксинпермеаз (AAAP)
- 2.A.19 Ca: катион Семейство антипортеров (CaCA)
- 2.A.20 Семейство переносчиков неорганического фосфата (PiT)
- 2.A.21 Растворенное вещество: семейство симпортеров натрия
- 2.A. 22 Нейротрансмиттер: натрий-симпортер Семья
- 2.A.23 Семейство дикарбоксилат / аминокислота: катионный (Na или H) симпортер (DAACS)
- 2.A.24 Семейство переносчиков 2-гидроксикарбоксилата (2-HCT)
- 2.A.25 Семейство аланина или глицина: симпортер катионов (AGCS)
- 2.A. 26 Семейство аминокислот с разветвленной цепью: симпортер катионов (LIVCS)
- 2.A.27 Глутамат: Na Symporte r (ESS) Семейство
- 2.A.28 Желчная кислота: Na Symporter Семья
- 2.A.29 Митохондриальный носитель Семья
- 2.A.30 Семейство катионно-хлоридных котранспортеров (CCC)
- 2.A.31 Семейство анионообменников
- 2.A.32 Кремний Семейство переносчиков (сидеть)
- 2.A.33 NhaA Na: H Antiporter (NhaA) Семейство
- 2.A.34 NhaB Na: H Antiporter (NhaB) Семейство
- 2.A.35 Семейство NhaC Na: H-антипортер (NhaC)
- 2.A.36 Моновалентный катион: протонный антипортер-1 (CPA1) Семейство
- 2.A.37 Моновалентный катион: протонный антипортер-2 (CPA2) Семейство
- 2.A.38 K Transporter (Trk) Семейство
- 2.A.39 Нуклеарное основание: катионный симпортер-1 (NCS1) Семейство
- 2.A.40 Нуклеарное основание: катионный симпортер-2 (NCS2) Семейство
- 2.A.41 Семейство концентрированных переносчиков нуклеозидов (CNT)
- 2.A.42 Семейство гидрокси / ароматических аминокислотных пермеаз (HAAAP)
- 2.A.43 Семейство лизосомальных переносчиков цистина (LCT)
- 2.A.45 Семейство выделений арсенит-антимонита
- 2.A.46 Семейство бензоат: H-симпортер (BenE)
- 2.A.47 Двухвалентный анион: симпортер Na (DASS) Семейство
- 2.A.48 Семейство сокращенных фолатных носителей (RFC)
- 2.A.49 Хлоридных носителей / каналов (ClC) Семейство
- 2.A.50 Семейство захвата глицерина (GUP)
- 2.A.51 Семейство переносчиков хромат-ионов (CHR)
- 2.A.52 Ni- Семейство ко-транспортеров (NiCoT)
- 2.A.53 Семейство сульфатпермеазы (SulP)
- 2.A.54 Семейство митохондриальных трикарбоксилатных переносчиков (MTC)
- 2.A.55 Металлический ионный транспортер (Mn-железо) (Nramp) Семейство
- 2.A.56 Трехсторонний АТФ-независимый периплазматический транспортер (TRAP-T) Семейство
- 2.A.57 Семейство равновесных переносчиков нуклеозидов (ЛОР)
- 2.A.58 Семейство фосфат-натриевых симпортеров (PNaS)
- 2.A.59 Семейство Arsenical Resistance-3 (ACR3)
- 2.A.60 Семейство органо-анионных транспортеров (OAT)
- 2.A.61 C4-дикарб Семейство поглощения оксилата C (DcuC)
- 2.A.62 Семейство NhaD Na: H-антипортер (NhaD)
- 2.A.63 Моновалентный катион (K или Na): протонный антипортер -3 (CPA3) Семейство
- 2.A.64 Семейство двойного аргинина (Tat)
- 2.A.65 Семейство переносчиков билирубина (BRT)
- 2. A.66 Суперсемейство мультилекарственных / олигосахаридиллипидов / полисахаридов (MOP) и флиппаз
- 2.A.67 Семейство переносчиков олигопептидов (OPT)
- 2.A.68 p-Аминобензоил- Семейство переносчиков глутамата (AbgT)
- 2.A.69 Семейство переносчиков оттока ауксина (AEC)
- 2.A.70 Семейство малонат: Na Symporter (MSS)
- 2.A.71 Семейство переносчиков фолата-биоптерина (FBT)
- 2.A.72 Семейство пермеазы, поглощающей K (KUP)
- 2.A.73 Короткоцепочечные жирные кислоты Семейство поглощения (AtoE)
- 2.A.74 Семейство мультилекарственных эндосомных переносчиков 4 TMS (MET)
- 2.A.75 Семейство L-Lysine Exporter (LysE)
- 2.A.76 Устойчивость к семейству гомосерина / треонина (RhtB)
- 2.A.77 The Cad Семейство устойчивости к миуму (CadD)
- 2.A.78 Семейство экспортеров аминокислот с разветвленной цепью (LIV-E)
- 2.A.79 Семейство экспортеров треонина / серина (ThrE)
- 2.A.80 Семейство трикарбоксилатных переносчиков (TTT)
- 2.A.81 Семейство аспартат-аланиновых обменников (AAEx)
- 2.A.82 Органические Семейство транспортеров растворенных веществ (OST)
- 2.A.83 Семейство Na-зависимых транспортеров бикарбонатов (SBT)
- 2.A.84 Семейство Chloroplast Maltose Exporter (MEX)
- 2.A.85 Семейство экспортеров ароматических кислот (ArAE)
- 2.A.86 Семейство экспортеров Autoinducer-2 (AI-2E) (ранее семейство PerM, TC № 9.B.22)
- 2.A.87 Семейство прокариотических транспортеров рибофлавина (P-RFT)
- 2.A.88 Семейство транспортеров захвата витаминов (VUT или ECF)
- 2. A.89 Семейство вакуумных переносчиков железа (VIT)
- 2.A.90 Семейство рецепторов / переносчиков витамина A (STRA6)
- 2.A.91 Митохондриальная тРНК Импортный комплекс (M-RIC) (ранее 9.C.8)
- 2.A.92 Транспор холина Семейство тер-подобных (CTL)
- 2.A.94 Семейство фосфатпермеазы (Pho1)
- 2.A.95 Семейство переносчиков нейтральных аминокислот 6TMS (NAAT)
- 2.A.96 Семейство переносчиков захвата ацетата (AceTr)
- 2.A.97 Семейство митохондриальных внутренних мембран K / H и Ca / H-обменников (LetM1)
- 2. A.98 Семейство предполагаемых экспортеров сульфатов (PSE)
- 2.A.99 Семейство переносчиков захвата 6TMS Ni (HupE-UreJ)
- 2.A.100 Семейство ферропортинов (Fpn)
- 2.A.101 Семейство пермеазы захвата малоната (MatC) (ранее UIT1)
- 2.A.102 Семейство пермеазы захвата 4-толуолсульфоната (TSUP)
- 2.A.103 Семейство бактериальных экспортеров прекурсоров муреина (MPE)
- 2.A.104 Семейство экспортеров L-аланина (AlaE)
- 2.A.105 Митохондриальные переносчики пирувата ( Семейство MPC)
- 2.A.106 Семейство Ca: H Antiporter-2 (CaCA2)
- 2.A.107 Семейство MntP Mn Exporter (MntP)
- 2.A.108 Семейство транспортеров железа / свинца (ILT)
- 2.A.109 Сопротивление ионам теллура (TerC) Семейство
- 2.A.110 Семейство переносчиков гема, гем-зависимых генных белков (HRG)
- 2.A.111 Семейство Na / H-антипортеров-E (NhaE)
- 2.A.112 Семейство антигенов группы крови KX (KXA)
- 2.A.113 Семейство переносчиков никеля / кобальта (NicO)
- 2.A.114 Предполагаемое семейство пептидных переносчиков углеродного голодания CstA (CstA)
- 2.A.115 Семейство экспортеров новобиоцина (NbcE)
- 2.A.116 Семейство пептидогликолипидных адресуемых белков (GAP)
- 2.A.117 Семейство экспортеров хлоргексадина (CHX)
- 2.A.118 Семейство основных антипортеров аминокислот (ArcD)
- 2.A.119 Семейство органо-мышьяковых экспортеров (ArsP)
- 2.A.120 Предполагаемое семейство аминокислотных пермеаз (PAAP)
- 2.A.121 Семейство переносчиков сульфатов (CysZ)
- 2.A.122 Семейство холиноподобных вспомогательных белков LrgB / CidB (LrgB / CidB)
- 2.A.123 The Sweet; PQ-петля; Слюна; Семейство MtN3 (Sweet)
- 2.A.124 Семейство экспортеров лизина (LysO)
- 2.A.125 Семейство эукариотических переносчиков рибофлавина (E-RFT)
- 2.A.126 Семейство экспортеров жирных кислот (FAX)
- 2.A.127 Семейство энтеробактериальных переносчиков кардиолипина (CLT)
2.B Нерибосомно синтезированные портеры
- 2.B.1 Валиномицин Семейство носителей
- 2.B.2 Семейство Монензин
- 2.B.3 Семейство Нигерицин
- 2.B.4 Семейство антибиотиков (MA)
- 2.B.5 Семейство макроциклических полиэфиров (MP)
- 2.B.6 Иономицин Семейство
- 2.B.7 Семейство трансмембранной α-спиральной транслокации пептид-фосфолипидов (TMP-PLT)
- 2.B.8 Бафиломицин A1 (бафиломицин) Семейство
- 2.B.9 Функциональное семейство пептидов, проникающих в клетки (CPP)
- 2.B.10 Синтетические CPP, семейство
- 2.B.11 Семейство ионофоров носителя кальцимицина или A23187
- 2.B.12 Семейство салиномицина
- 2.B. 13 т Семейство тетрапирролических макроциклических анионов (TPMC-AA)
- 2.B.14 Семейство ласалоцидов A или X-537A Ionophore (Lasalocid)
- 2.B.15 Трис-тиомочевина Триподаль Семейство хлоридных носителей (TTT-CC)
- 2.B.16 Семейство анионных носителей, содержащих галогеновые связи (HCAC)
- 2.B.17 Производное изофталаминда H: Семейство ко-переносчиков Cl (IDC)
- 2.B.18 Семейство производных пиридин-2,6-дикарбоксамина (PDCA) H +: Cl
- 2.B.19 Семейство каликс (4) производных пиррола (C4P)
- 2.B.20 Семейство хлорид / бикарбонатный обменник продигиозина (продигиозина)
- 2.B.21 Орто-фенилендиамин-бис-мочевина Семейство производных переносчиков анионов (oPDA-U)
- 2.B.22 Семейство переносчиков анионов, функционализированных имидазолием (IAT)
- 2.B.23 Гомотетрамерные трансмембранные Zn / Co: синтетические протоны Антипортер, семейство рокеров (рокеров)
- 2.B.24 Семейство 2,6-бис (бензимидазол-2-ил) пиридин-анион-носителей (BBP-AC)
- 2.B. 25 Семейство опосредованных пептидами липидных триггеров (PLFF)
- 2.B.26 Семейство бис (имидазолил) -функционализированных бис (холоил) конъюгатов (BIBCC)
- 2.B.27 Семейство транспортеров анионов трис-мочевины
- 2.B.29 Анионофорные морские алкалоиды Тамбджамин Семейство
2.C Активизаторы, управляемые ионным градиентом
- 2.C.1 Семейство вспомогательных белков TonB-ExbB-ExbD / TolA-TolQ-TolR (TonB) для активации активного транспорта, опосредованного рецепторами внешней мембраны (OMR)
3. Первичные активные транспортеры3.A. Управляемые гидролизом PP-связи транспортеры
- 3.A.1 ABC-транспортеры включая BtuCD, транспортер захвата молибдата, регулятор трансмембранной проводимости при муковисцидозе и другие
- 3.A.2 Суперсемейство АТФазы H- или Na-типа F-типа, АТФазы V-типа и АТФазы A-типа
- 3.A.3 АТФаза P-типа Надсемейство
- 3.A.4 Отток арсенита-антимонита семейство
- 3.A.5 Общий секретор путь (сек) транслокон (препротеин транслоказа SecY)
- 3.A.6 Семейство секреторных путей типа III (связанные с вирулентностью) (IIISP)
- 3.A.7 The Type IV (Conjugal DNA-Protein Transfer or VirB) Secretory Pathway (IVSP) Family
- 3.A.8 The Mitochondrial Protein Translocase (MPT) Family
- 3. A.9 The Chloroplast Envelope Protein Translocase (CEPT or Tic-Toc) Family
- 3.A.10 H, Na-translocating Pyrophosphatase family
- 3.A. 11 The Bacterial Competence-related DNA Transformation Transpor ter (DNA-T) Family
- 3.A.12 The Septal DNA Translocator (S-DNA-T) Family
- 3.A.13 The Filamentous Phage Exporter (FPhE) Family
- 3.A.14 The Fimbrilin/Protein Exporter (FPE) Family
- 3.A.15 The Outer Membrane Protein Secreting Main Terminal Branch (MTB) Family
- 3.A.16 The Endoplasmic Reticular Retrotranslocon (ER-RT) Family
- 3.A.17 The Phage T7 Injectisome (T7 Injectisome) Family
- 3.A.18 The Nuclear mRNA Exporter (mRNA-E) Family
- 3.A.19 The TMS Recognition/Insertion Complex (TRC) Family
- 3.A.20 The Peroxisomal Protein Importer (PPI) Family
- 3.A.21 The C-terminal Tail-Anchored Membrane Protein Biogenesis/ Insertion Complex (TAMP-B) Family
- 3.A.22 The Transcription-coupled TREX/TAP Nuclear mRNA Export Complex (TREX) Family
- 3.A.23 The Type VI Symbiosis/Virulence Secretory Pathway (VISP) Family
- 3.A.24 Type VII or ESX Protein Secretion System (T7SS) Family
- 3.A.25 The Symbiont-specif ic ERAD-like Machinery (SELMA) Family
- 3.A.26 The Plasmodium Translocon of Exported proteins (PTEX) Family
3.B Decarboxylation-driven transporters
- 3.B.1 The Na-transporting Carboxylic Acid Decarboxylase (NaT-DC) Family
3.C Methyltransfer-driven transporters
- 3.C.1 The Na Transporting Methyltetrahydromethanopterin:Coenzyme M Methyltransferase (NaT-MMM) Family
3.D. Oxidoreduction-driven transporters
They include a number of transmembrane cytochrome b -like proteins including coenzyme Q - cytochrome c reductase (cytochrome bc1); cytochrome b6f complex ; formate dehydrogenase, respiratory nitrate reductase ; succinate - coenzyme Q reductase (fumarate reductase); and succinate dehydrogenase. See electron transport chain.
- 3.D.1 The H or Na-translocating NADH Dehydrogenase ("complex I") family
- 3.D.2 The Proton-translocating Transhydrogenase (PTH) Family
- 3.D.3 The Proton-translocating Quinol:Cytochrome c Reductase ) Superfamily
- 3.D.4 Proton-translocating Cytochrome Oxidase (COX) Superfamily
- 3.D.5 The Na-translocating NADH:Quinone Dehydrogenase (Na-NDH or NQR) Family
- 3.D.6 The Putative Ion (H or Na)-translocating NADH:Ferredoxin Oxidoreductase (NFO or RNF) Family
- 3.D.7 The H2:Heterodisulfide Oxidoreductase (HHO) Family
- 3.D.8 The Na- or H-Pumping Formyl Methanofuran Dehydrogenase (FMF-DH) Family
- 3.D.9 The H-translocating F420H2 Dehydrogenase (F420H2DH) Family
- 3.D.10 The Prokaryotic Succinate Dehydrogenase (SDH) Family
3.E. Light absorption-driven transporters
4. Group translocators
4.A Phosphotransfer-driven group translocators
- 4.A.1 The PTS Glucose-Glucoside (Glc) Family
- 4.A.2 The PTS Fructose-Mannitol (Fru) Family
- 4.A.3 The PTS Lactose-N,N'-Diacetylchitobiose-β-glucoside (Lac) Family
- 4.A.4 The PTS Glucitol (Gut) Family
- 4.A.5 The PTS Galactitol (Gat) Family
- 4.A.6 The PTS Mannose-Fructose-Sorbose (Man) Family
- 4.A.7 The PTS L-Ascorbate (L-Asc) Family
4.B Nicotinamide ribonucleoside uptake transporters
- 4.B.1 The Nicotinamide Ribonucleoside (NR) Uptake Permease (PnuC) Family
4.C Acyl CoA ligase-coupled transporters
- 4.C.1 The Proposed Fatty Acid Transporter (FAT) Family
- 4.C.2 The Carnitine O-Acyl Transferase (CrAT) Family
- 4.C.3 The Acyl-CoA Thioesterase (AcoT) Family
4.D Polysaccharide Synthase/Exporters
- 4.D.1 The Putative Vectorial Glycosyl Polymerization (VGP) Family
- 4.D.2 The Glycosyl Transferase 2 (GT2) Family
- 4.D.3 The Glycan Glucosyl Transferase (OpgH) Family
4.E. Групповые транслокаторы, катализируемые вакуолярной полифосфат-полимеразой
- 4.E.1 Семейство вакуолярных (ацидокальцисом) полифосфат-полимераз (V-PPP)
5. Транспортные переносчики электронов
5.A Трансмембранные переносчики 2-электронов
- 5.A.1 Семейство оксидоредуктазы D с дисульфидной связью (DsbD)
- 5.A.2 Оксидоредуктаза с дисульфидной связью Семейство B (DsbB)
- 5.A.3 Семейство прокариотических молибдоптерин-содержащих оксидоредуктаз (PMO)
5.B Трансмембранные переносчики 1-электронов
- 5.B.1 Фагоцит (gp91phox) Семейство НАДФН-оксидазы
- 5.B.2 Семейство эукариотических цитохромов b561 (Cytb561)
- 5.B.3 Семейство Geobacter Nanowire Electron Transfer (G-NET)
- 5.B.4 Семейство суперкомплексов фотосистемы I (PSI) растений
- 5.B.5 Семейство внеклеточных металлооксидоредуктаз (EMOR)
- 5.B.6 Трансмембранный эпителий Семейство антиген-протеин-3 ферроредуктазы (STEAP)
- 5.B.7 Семейство YedZ (YedZ)
- 5.B.8 Транс-внешний мембранный комплекс порин / цитохром для переноса электронов ( Семейство ET-PCC
- 5.B.9 Семейство порин-цитохром c (Cyc2)
8. Дополнительные факторы, участвующие в транспорте
8.A Вспомогательные транспортные белки
8.B Белковые / пептидные токсины, синтезируемые рибосомами, которые нацелены на каналы и носителей
8.C Синтезируются не рибосомами токсины, нацеленные на каналы и носителей
9. Неполностью охарактеризованные транспортные системы
9.A Распознанные переносчики с неизвестным биохимическим механизмом
9.B Предполагаемые транспортные белки
9.C Функционально охарактеризованные переносчики без идентифицированных последовательностей
Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-11 10:07:33
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).