POLRMT

POLRMT
Доступные конструкции PDB Ортолог поиск: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3SPA, 4BOC
Идентификаторы
Псевдонимы	POLRMT, APOLMT, MTRNAP, MTRPOL, h-mtRPOL, митохондриальная полимераза (РНК), митохондриальная РНК-полимераза
Внешние идентификаторы	OMIM : 601778 MGI : 1915843 HomoloGene : 37996 GeneCards : POLRMT
Расположение гена ( человек ) Chr. Хромосома 19 (человек) Группа 19p13.3 Начинать 617 221 п.н. Конец 633 537 п.н.
Расположение гена ( Мышь ) Chr. Хромосома 10 (мышь) Группа 10 | 10 C1 Начинать 79 736 123 п.н. Конец 79746581 п.о.
Паттерн экспрессии РНК Дополнительные данные эталонного выражения
Онтология генов Молекулярная функция • ДНК-направленная активность 5'-3 'РНК-полимеразы • активность трансферазы • связывание ДНК • активность нуклеотидилтрансферазы • связывание с белком GO: 0001948 • связывание РНК • GO: 0070361, GO: 0070364, GO: 0070363, GO: 0070362 последовательность митохондриального промотора- специфическое связывание с ДНК • специфическое для последовательности связывание с ДНК Сотовый компонент • митохондриальный матрикс • митохондриальный нуклеоид • митохондрия • митохондриальный ДНК-направленный комплекс РНК-полимеразы • протеинсодержащий комплекс Биологический процесс • митохондриальная транскрипция • инициация транскрипции с митохондриального промотора • организация митохондрий • транскрипция, ДНК-шаблон Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	5442	216151
Ансамбль	ENSG00000099821	ENSMUSG00000020329
UniProt	O00411	Q8BKF1
RefSeq (мРНК)	NM_005035	NM_172551
RefSeq (белок)	NP_005026	NP_766139
Расположение (UCSC)	Chr 19: 0,62 - 0,63 Мб	Chr 10: 79.74 - 79.75 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-РНК - полимеразы направлены, митохондриальная приведен фермент, который у человека кодируется POLRMT гена.

• 1 Функция
• 2 Структура
• 3 ссылки
• 4 Дальнейшее чтение
• 5 Внешние ссылки

Этот ген кодирует митохондриальную ДНК- направленную РНК-полимеразу. Продукт гена отвечает за экспрессию митохондриального гена, а также за предоставление праймеров РНК для инициации репликации митохондриального генома. Хотя этот полипептид имеет ту же функцию, что и три ядерных ДНК-направленных РНК-полимеразы, он более тесно связан с РНК-полимеразами бактериофага (включая РНК-полимеразу Т7 ), митохондриальными полимеразами низших эукариот, а также хлоропластными полимеразами RpoT.

Структура фермента решена. Он демонстрирует общую структуру, аналогичную структуре фаговой RNAP, но механизм инициации отличается тем, что для него требуются факторы инициации TFAM (только у млекопитающих) и TFB2M. Для удлинения требуется коэффициент удлинения TEFM. Точный процесс завершения менее понят, но считается, что MTERF1 играет роль.

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин. 138 (1–2): 171–4. DOI : 10.1016 / 0378-1119 (94) 90802-8. PMID   8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Джин. 200 (1–2): 149–56. DOI : 10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID   9373149.
• Фалькенберг М., Гаспари М., Рантанен А. и др. (2002). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». Nat. Genet. 31 (3): 289–94. DOI : 10.1038 / ng909. PMID   12068295. S2CID   11164308.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. США. 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS... 9916899M. DOI : 10.1073 / pnas.242603899. PMC   139241. PMID   12477932.
• Маккалок V, Шадель GS (2003). «Фактор транскрипции митохондрий человека B1 взаимодействует с С-концевой областью активации h-mtTFA и стимулирует транскрипцию независимо от его активности РНК-метилтрансферазы». Мол. Клетка. Биол. 23 (16): 5816–24. DOI : 10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003. PMC   166325. PMID   12897151.
• Гримвуд Дж., Гордон Л.А., Олсен А. и др. (2004). «Последовательность ДНК и биология хромосомы человека 19». Природа. 428 (6982): 529–35. Bibcode : 2004Natur.428..529G. DOI : 10,1038 / природа02399. PMID   15057824.
• Graziewicz MA, Longley MJ, Bienstock RJ, et al. (2004). «Структурно-функциональные дефекты митохондриальной ДНК-полимеразы человека при аутосомно-доминантной прогрессирующей внешней офтальмоплегии». Nat. Struct. Мол. Биол. 11 (8): 770–6. DOI : 10.1038 / nsmb805. PMID   15258572. S2CID   12460199.
• Гаспари М., Фалькенберг М., Ларссон Н.Г., Густафссон С.М. (2005). «Митохондриальная РНК-полимераза играет решающую роль в специфичности промотора в клетках млекопитающих». EMBO J. 23 (23): 4606–14. DOI : 10.1038 / sj.emboj.7600465. PMC   533051. PMID   15526033.
• Кравченко Ю.Е., Рогозин И.Б., Кунин Е.В., Чумаков П.М. (2005). «Транскрипция матричных РНК млекопитающих с помощью ядерной РНК-полимеразы митохондриального происхождения». Природа. 436 (7051): 735–9. Bibcode : 2005Natur.436..735K. DOI : 10,1038 / природа03848. PMC   1352165. PMID   16079853.
• Ван З., Котни Дж., Шадель Г.С. (2007). «Митохондриальный рибосомный белок MRPL12 человека напрямую взаимодействует с митохондриальной РНК-полимеразой, чтобы модулировать экспрессию митохондриальных генов». J. Biol. Chem. 282 (17): 12610–8. DOI : 10.1074 / jbc.M700461200. PMC   2606046. PMID   17337445.

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O00411 (ДНК-направленная РНК-полимераза человека, митохондриальная (POLRMT)) в PDBe-KB.

• Биологический портал

• v
• т
• е