KLF3

редактировать
KLF3
Белок KLF3 PDB 1p7a.png
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы KLF3, BKLF, Kruppel-like factor 3 (basic), Kruppel like factor 3
External IDsOMIM: 609392 MGI: 1342773 HomoloGene: 7396 GeneCards: KLF3
Местоположение гена (человек)
Хромосома 4 (человека)
Chr. Хромосома 4 (человек)
Хромосома 4 (человека) Местоположение генома для KLF3 Местоположение генома для KLF3
Полоса 4p14Начало38,664,197 bp
Конец38,701,517 bp
Экспрессия РНК паттерн
PBB GE KLF3 219657 s at fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
SpeciesHumanMouse
Entrez

51274

16599

Ensembl

ENSG00000109787

ENSMUSG00000029178

UniProt

P57682

Q60980

RefSeq (мРНК)

NM_016531

NM_008453

RefSeq (протеин)

NP_197_09206 216>Местоположение (UCSC)

Chr 4: 38,66 - 38,7 Мб Chr 5: 64,8 - 64,83 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Krüppel-подобный фактор 3 представляет собой белок, который у человека кодируется геном KLF3 .

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Функция
  • 3 Взаимодействия
  • 4 Ссылки
  • 5 Дополнительная литература
  • 6 Внешние ссылки
Структура

KLF3, первоначально называвшийся базовым фактором Крюппеля (BKLF), был третьим членом подобного Крюппелю фактор семейство цинковый палец факторы транскрипции, которые предстоит открыть. Факторы транскрипции в этом семействе связывают ДНК благодаря 3 характерным трем C 2H2цинковым пальцам на их C-концах. Поскольку их ДНК-связывающие домены в семействе высококонсервативны, все белки KLF распознают боксы CACCC или CGCCC общей формы NCR CRC CCN (где N представляет собой любое основание, а R представляет собой пурин ).

Функция

В то время как C-концы сходны в разных KLF, N-концы различаются, и, соответственно, разные KLF могут либо активировать, либо репрессировать транскрипцию, либо и то, и другое. KLF3, по-видимому, функционирует преимущественно как репрессор транскрипции. Это выключает гены. Он делает это путем привлечения корепрессоров C-концевого связывающего белка CTBP1 и CTBP2. CtBP стыкуется с коротким мотивом (остатки 61-65) на N-конце KLF3 общей формы пролин - изолейцин - аспартат - лейцин - серин (мотив PIDLS). CtBP, в свою очередь, привлекает ферменты, модифицирующие гистон, для изменения хроматина и подавления экспрессии гена.

KLF3 высоко экспрессируется в эритроцитах или клонах эритроидных клеток. Здесь он управляется другим KLF, Erythroid KLF или KLF1, и его экспрессия увеличивается по мере созревания эритроидных клеток. Исследования на мышах с нокаутом выявляют легкую анемию в отсутствие функционального KLF3 и дерепрессию нескольких генов-мишеней, которые содержат CACCC-боксы в своих регуляторных областях. Многие из этих генов активируются KLF1, следовательно, похоже, что KLF3 действует в петле отрицательной обратной связи, чтобы сбалансировать активирующий потенциал KLF1. KLF3 также регулирует другой репрессивный KLF, KLF8. Таким образом, KLF1, KLF3 и KLF8 работают в жесткой регулирующей сети. KLF3 и KLF8 могут иметь избыточные функции, поскольку у мышей, лишенных как KLF3, так и KLF8, обнаруживаются более серьезные дефекты, чем при любом одиночном нокауте. Они умирают внутриутробно примерно на 14 день беременности.

Помимо экспрессии в эритроидных клетках, KLF3 присутствует и в других типах клеток, и анализ мышей с нокаутом выявил дефекты, затрагивающие жировая ткань и В-клетки. У мышей с дефицитом KLF3 меньше жировой ткани и признаки метаболического здоровья, что может быть связано с депрессией гена гормона адипокина адиполина. Роль KLF3 в В-лимфоцитах сложна, но он, по-видимому, работает в сети с KLF2 и KLF4, чтобы влиять на переключение между селезенкой маргинальной зоной и фолликулярные В-клетки.

Взаимодействия

Было показано, что KLF3 взаимодействует с:

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-25 08:37:22
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте