IRF6

редактировать
IRF6
Идентификаторы
Псевдонимы IRF6, LPS, OFC6, PIT, PPS, PPS1, VWS, VWS1, регуляторный фактор интерферона 6
Внешние идентификаторыOMIM: 607199 MGI: 1859211 HomoloGene: 4479 Генные карты: IRF6
Местоположение гена (человек)
Хромосома 1 (человека)
Chr. Хромосома 1 (человек)
Хромосома 1 (человека) Геномное расположение IRF6 Геномное расположение IRF6
Полоса 1q32.2Начало209,785,617 bp
Конец209,806,175 bp
Orthologs
Spe ciesЧеловекМышь
Энтрез

3664

54139

Ensembl

ENSG00000117595

ENSMUSG00000026638

UniProt

O14896

P97431

RefSemb мРНК)

NM_006147. NM_001206696

NM_016851. NM_178083

RefSeq (белок)

NP_001193625. NP_006138

NP_058547

Местоположение (UCSCr) <: 209,79 - 209,81 Мб Chr 1: 193,15 - 193,17 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование Человека Просмотр / редактирование мыши

Регуляторный фактор интерферона 6 также известный как IRF6 - это белок, который у человека кодируется геном IRF6 .

Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Патология
  • 3 Эпигенетика
  • 4 Рак
  • 5 См. Также
  • 6 Ссылки
  • 7 Внешние ссылки
Функция

Этот ген кодирует член фактора транскрипции, регулирующего интерферон ( IRF) семья. Члены семейства разделяют высококонсервативный N-концевой ДНК-связывающий домен спираль-поворот-спираль и менее консервативный C-концевой белок-связывающий домен. Функция IRF6 связана с образованием соединительной ткани, например, функции неба. Этот ген кодирует члена семейства регуляторных факторов транскрипции (IRF) интерферона. Кроме того, было замечено, что ген IRF6 находится под эпигенетической регуляцией промотором метилированием.

Патология

A мутация гена IRF6 может привести к аутосомно-доминантному синдром Ван дер Вуда (VWS) или родственный синдром подколенного птеригиума (PPS). Синдром Ван дер Вуда может включать заячью губу и нёбо, а также аномалии зубов и свищи губ. Кроме того, общие аллели в IRF6 также были связаны с несиндромальными случаями расщелины губы и / или неба в рамках полногеномных исследований ассоциации и во многих исследованиях генов-кандидатов. Эти нарушения вызваны мутациями в гене IRF6, а некоторая фенотипическая гетерогенность обусловлена ​​различными типами мутаций IRF6. Одно объяснение этой фенотипической вариации между синдромами основано на различном влиянии на структуру димеризованных мутантных белков. Мутации VWS, по-видимому, приводят к гаплонедостаточности, тогда как мутации PPS могут быть доминантно-отрицательными по природе. Недавно был обобщен спектр мутаций VWS и PPS. Было показано, что IRF6 играет критическую роль в развитии кератиноцитов. Роль IRF6 в распространенных формах заячьей губы и неба также была продемонстрирована и может объяснить только ~ 20% случаев заячьей губы. Варианты IRF6 дали последовательные доказательства связи с синдромальной расщелиной и / или нёбом в нескольких исследованиях. Исследование Бирнбаума и его коллег в 2009 году подтвердило влияние этого гена на этиологию расщелины губы и / или неба, а исследование GENEVA Cleft Consortium, в котором изучались семьи из нескольких популяций, подтвердило выводы о том, что мутации IRF6 тесно связаны с расщелиной. и / или нёбо. Роль IRF6 в возникновении расщелины губы и / или неба дополнительно подтверждается анализом мышей с мутантным IRF6, которые демонстрируют гиперпролиферативный эпидермис, который не может подвергнуться терминальной дифференцировке, что приводит к множественным эпителиальным спайкам, которые могут закупоривать ротовую полость и приводить к расщелине. нёбо. Исследования на животных моделях показывают, что IRF6 определяет пролиферацию кератиноцитов, а также играет ключевую роль в формировании перидермы полости рта. Недавно с помощью генетики мышей, анализов экспрессии генов, исследований иммунопреципитации хроматина и репортерных анализов люциферазы было показано, что IRF6 является прямой мишенью для p63, который лежит в основе нескольких синдромов пороков развития, которые включают особенности расщелины, и p63 активирует транскрипцию IRF6 через Элемент энхансера IRF6. Вариация в элементе энхансера увеличивает восприимчивость только к заячьей губе. И заячья губа с или без волчья пасть, и особенности только заячьей губы были замечены в семьях с мутацией IRF6. Кроме того, в одном и том же семействе могут выделяться различные типы щелей.

Эпигенетика

Аберрантный промотор IRF6 гиперметилирование ДНК было обнаружено, связанное с началом / прогрессированием рака. Действительно, этот неправильный эпигенетический феномен наблюдался у женщин, страдающих плоскоклеточной карциномой вульвы, возникшей из склеротического лишая вульвы. Метилирование промотора IRF6 может быть маркером риска рака у пациентов, страдающих этим заболеванием.

Рак

Ген IRF6 наблюдался прогрессивно подавляющимся у вируса папилломы человека -положительного неопластические кератиноциты, полученные из цервикальных предопухолевых поражений на разных уровнях злокачественности. По этой причине этот ген, вероятно, связан с онкогенезом и может быть потенциальным прогностическим маркером прогрессирования пренеопластических поражений шейки матки. Аналогичным образом было обнаружено, что IRF6 генетически и эпигенетически не регулируется при раке вульвы.

См. Также
Ссылки
Внешние ссылки

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США, которая находится в общественное достояние.

Последняя правка сделана 2021-05-23 07:44:38
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте