Общий коэффициент транскрипции

редактировать
Факторы транскрипции. В средней части над промотором выделенная розовым цветом часть факторов транскрипции - это общие факторы транскрипции.

Общие факторы транскрипции (GTF ), также известные как базальные факторы транскрипции, являются основными факторами транскрипции. класс белка факторов транскрипции, которые связываются с конкретными сайтами (промотор ) на ДНК для активации транскрипции генетических информация из ДНК в информационную РНК. GTF, РНК-полимераза и медиатор (мультибелковый комплекс) составляют основной транскрипционный аппарат, который сначала связывается с промотором, а затем запускает транскрипцию. GTF также принимают непосредственное участие в процессе регуляции генов, и большинство из них необходимы для жизни.

Фактор транскрипции - это белок, который связывается со специфическими последовательностями ДНК (энхансером или промотором) либо по отдельности или с другими белками в комплексе, чтобы контролировать скорость транскрипции генетической информации из ДНК в информационную РНК путем стимулирования (служащего активатором ) или блокирования (служащим репрессором ) рекрутирование РНК-полимеразы. Как класс белков, общие факторы транскрипции связываются с промоторами вдоль последовательности ДНК или образуют большой комплекс преинициации транскрипции для активации транскрипции. Для возникновения транскрипции необходимы общие факторы транскрипции.

Содержание
  • 1 Типы
  • 2 Функция и механизм
    • 2.1 У бактерий
    • 2.2 У архей и эукариот
      • 2.2.1 Сборка комплекса преинициации транскрипции
  • 3 Ссылки
  • 4 Внешние ссылки
Типы

В бактериях для инициации транскрипции требуется РНК-полимераза и один GTF: сигма-фактор.

Транскрипция комплекс преиниции

В архей и эукариот для инициации транскрипции требуется РНК-полимераза и набор множественных GTF для образования комплекса преиницииции транскрипции. Инициация транскрипции эукариотической РНК-полимеразой II включает следующие GTF:

  • TFIIA
  • TFIIB - распознает элемент BRE в промоторах
  • TFIID - связывается с TATA-боксом, TATA-связывание. белок (TBP) и распознает факторы, связанные с TATA boxTBP (TAF), и увеличивает селективность промотора
  • TFIIE - привлекает и регулирует TFIIH
  • TFIIF - стабилизирует взаимодействие РНК-полимеразы с TBP и TFIIB; помогает привлекать TFIIE и TFIIH
  • TFIIH - Разматывает ДНК в начальной точке транскрипции, фосфорилирует Ser5 РНК-полимеразы CCTD, высвобождает РНК-полимеразу из промотора

Распознавать ТАТА-бокс

Функция и механизм

У бактерий

A сигма-фактор представляет собой белок, необходимый только для инициации синтеза РНК в бактериях. Сигма-факторы обеспечивают специфичность распознавания промотора для РНК-полимеразы (РНКП) и способствуют разделению цепей ДНК, а затем диссоциации от ядра РНК-полимеразы фермента после инициации транскрипции. Ядро РНК-полимеразы связывается с сигма-фактором с образованием холофермента РНК-полимеразы. Сигма-фактор снижает сродство РНК-полимеразы к неспецифической ДНК, одновременно увеличивая специфичность для промоторов, что позволяет транскрипции инициировать в правильных сайтах. Основной фермент РНК-полимеразы имеет пять субъединиц (белковые субъединицы ) (~ 400 кДа ). Вследствие ассоциации РНК-полимеразы с сигма-фактором полная РНК-полимераза, таким образом, имеет 6 субъединиц: сигма-субъединицу - в дополнение к двум альфа (α), одной бета (β), одному бета-простому (β ') и одному омега-субъединицам. (ω) субъединицы, составляющие основной фермент (~ 450 кДа). Кроме того, у многих бактерий может быть несколько альтернативных σ-факторов. Уровень и активность альтернативных σ-факторов строго регулируются и могут варьироваться в зависимости от сигналов окружающей среды или развития.

У архей и эукариот

комплекс преинициации транскрипции представляет собой большой комплекс белков, необходимый для транскрипции генов, кодирующих белки, у эукариот и архей. Он прикрепляется к промотору ДНК (ei, TATA-бокс) и помогает позиционировать РНК-полимеразу II на сайтах начала транскрипции генов, денатурирует ДНК и затем запускает транскрипцию.

Сборка комплекса преинициации транскрипции

Сборка комплекса преинициации транскрипции осуществляется следующим образом:

  1. ТАТА-связывающий белок (ТВР), субъединица TFIID (самый большой GTF) связывается с промотором (ТАТА-бокс), создавая резкий изгиб в промоторная ДНК. Затем взаимодействия TBP-TFIIA привлекают TFIIA к промотору.
  2. Взаимодействия TBP-TFIIB привлекают TFIIB к промотору. РНК-полимераза II и TFIIF собираются с образованием комплекса полимеразы II. TFIIB помогает комплексу Pol II правильно связываться.
  3. TFIIE и TFIIH затем связываются с комплексом и образуют преинициативный комплекс транскрипции. TFIIA / B / E / H удаляются, как только начинается элонгация РНК. TFIID будет оставаться до завершения элонгации.
  4. Субъединицы в TFIIH, которые обладают активностью АТФазы и геликазы, создают отрицательное сверхспиральное натяжение в ДНК. Это отрицательное сверхспиральное натяжение вызывает раскручивание примерно одного витка ДНК и формирование пузыря транскрипции.
  5. Цепь матрицы пузыря транскрипции взаимодействует с активным центром РНК-полимеразы II, после чего начинается синтез РНК.
Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-21 14:46:49
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте