Коллаген, тип IV, альфа 1

редактировать
COL4A1
Белок COL4A1 PDB 1li1.png
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы COL4A1, HANAC, ICH, POREN1, arresten, BSVD, RATOR, тип коллагена IV альфа 1, альфа-1 цепь коллагена IV типа, BSVD1, PADMAL, COL4A1s
Внешние идентификаторыOMIM: 120130 MGI: 88454 HomoloGene: 20437 GeneCards: COL4A1
Расположение гена (человек)
Хромосома 13 (человек)
Chr. Хромосома 13 (человек)
Хромосома 13 (человек) Геномное расположение COL4A1 Геномное расположение COL4A1
Полоса 13q34Начало110,148,963 bp
Конец110,307,157 bp
Экспрессия РНК паттерн
PBB GE COL4A1 211980 на fs. png .. PBB GE COL4A1 211981 на fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
Speci esЧеловекМышь
Entrez

1282

12826

Ensembl

ENSG00000187498

ENSMUSG00000031502

UniProt

P02462

P02463

RefSeq мРНК)

NM_001845. NM_001303110

NM_009931

RefSeq (белок)

NP_001290039. NP_001836

NP_034061

Местоположение (UCSC)Chr 13: 110,15 - 110,31 МБ Chr 8: 11.2 - 11.31 Mb
PubMed поиск
Wikidata
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

цепочка коллагена альфа-1 (IV) (COL4A1) представляет собой белок, который у человека кодируется геном COL4A1 на хромосоме 13. Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток. COL4A1 является субъединицей коллагена типа IV и играет роль в ангиогенезе. Мутации в гене связаны с заболеваниями мозга, мышц, почек, глаз и сердечно-сосудистой системы. Ген COL4A1 также содержит один из 27 SNP, связанных с повышенным риском ишемической болезни сердца.

Содержание
  • 1 Структура
    • 1.1 Ген
    • 1.2 Белок
  • 2 Функция
  • 3 Клиническая значимость
    • 3.1 Клинический маркер
  • 4 Ссылки
  • 5 Дополнительная литература
  • 6 Внешние ссылки
Структура

Ген

Ген COL4A1 находится на хромосоме 13 в полосе 13q34 и содержит 54 экзонов. [5] Этот ген продуцирует 2 изоформы через альтернативный сплайсинг.

Белок

COL4A1 принадлежит к семейству коллагенов IV типа и содержит три домена: короткий N-концевой домен, длинный трехспиральный 7S домен в его центре и неколлагеновый 1 (NC1) домен на его C-терминале. Тройной спиральный домен содержит прерванные повторы G-X-Y, которые, как предполагается, обеспечивают гибкость домена. Домен NC1 состоит из двух тримерных колпачков, каждая из которых содержит два фрагмента альфа 1 и один фрагмент альфа 2, которые образуют шестиконечный пропеллер, расположенный вокруг осевого туннеля. Взаимодействие между этими двумя крышками происходит вдоль большой плоской поверхности раздела и стабилизируется за счет ковалентной поперечной связи между альфа-1 и альфа-2 цепями через две крышки.

Функция

Коллаген IV типа является основным структурным компонентом базальных мембран, который содержит два или три белка COL4A1. Таким образом, COL4A1 широко распространен и обнаружен во всех типах базальных мембран. Домен NC1 COL4A1 является важной антиангиогенной молекулой, контролирующей образование новых капилляров. NC1 связывается с α1β1 интегрином и ингибирует специфические пути передачи сигналов интегрина в эпителиальных клетках сосудов. Он также регулирует экспрессию HIF-1α и VEGF, предположительно путем ингибирования каскада передачи сигналов MAPK. Эти данные могут объяснить противоопухолевую функцию NC1.

Клиническая значимость

Мутации в экзонах 24 и 25 COL4A1 связаны с HANAC (аутосомно-доминантная наследственная ангиопатия с нефропатией, аневризмами и мышечными спазмами ). Также было подтверждено, что мутации в гене COL4A1 встречаются у некоторых пациентов с порэнцефалией и шизэнцефалией.

. У людей была обнаружена новая мутация гена COL4A1, кодирующего коллаген типа IV. связана с аутосомно-доминантной врожденной катарактой в китайской семье. Эта мутация не была обнаружена у здоровых членов семьи или у 200 неродственных контролей. В этом исследовании анализ последовательности подтвердил, что аминокислотный остаток Gly782 является высококонсервативным. Это сообщение о новой мутации в гене COL4A1 - первое сообщение о несиндромальной аутосомно-доминантной врожденной катаракте, которое подчеркивает важную роль коллагена типа IV в физиологических и оптических свойствах хрусталика.

Кроме того, в области сердечно-сосудистой системы области COL4A1 и COL4A2 на хромосоме 13q34 представляют собой высоко реплицируемый локус ишемической болезни сердца. В нормальной стенке артерий коллаген IV типа ингибирует пролиферацию гладкомышечных клеток. Соответственно, было продемонстрировано, что экспрессия белка коллагена типа IV в клетках гладких мышц сосудов человека регулируется как белком SMAD3, так и опосредованной TGFβ стимуляцией мРНК. В целом был сделан вывод, что патогенез ишемической болезни сердца может регулироваться генами COL4A1 и COL4A2.

Также сообщалось об аутосомно-рецессивной энцефалопатии, связанной с мутациями в этом гене.

Клинический маркер.

Мультилокусное исследование генетической шкалы риска, основанное на комбинации 27 локусов, включая ген COL4A1, выявило лиц с повышенным риском как эпизодов, так и рецидивов ИБС, а также увеличило клиническую пользу от статиновая терапия. Исследование было основано на когортном исследовании сообщества (исследование Malmo Diet and Cancer) и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22).

Ссылки
Дополнительная литература
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-15 14:44:57
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте