Хлорамфениколацетилтрансфераза

редактировать
Хлорамфениколацетилтрансфераза
Хлорамфениколацетилтрансфераза 3CLA transparent.png Ленточная диаграмма тримера хлорамфениколацетилтрансферазы со связанным хлорамфениколом. Из PDB : 3CLA ​.
Идентификаторы
SymbolCAT
Pfam PF00302
InterPro IPR001707
PROSITE PDOC00093
SCOPe 3cla / SUPFAM
Хлорамфениколацетилтрансфераза
Идентификаторы
Номер ЕС 2.3.1.28
Номер CAS 9040-07-7
Базы данных
IntEnz Представление IntEnz
BRENDA Запись BRENDA
ExPASy Представление NiceZyme
KEGG Запись KEGG
MetaCyc метаболический путь
PRIAM профиль
PDB структурыRCSB PDB PDBe PDBsum
Онтология гена AmiGO / QuickGO

Хлорамфениколацетилтрансфераза (или CAT ) представляет собой бактериальный фермент (EC 2.3.1.28 ), который выводит токсины на антибиотик хлорамфеникол и отвечает за хлорамфеникол устойчивость у бактерий. Этот фермент ковалентно присоединяет ацетил группу ацетил-КоА к хлорамфениколу, что предотвращает связывание хлорамфеникола с рибосомами. Остаток гистидина, расположенный в С-концевой части фермента, играет центральную роль в его каталитическом механизме.

Была определена кристаллическая структура фермента типа III из Escherichia coli со связанным хлорамфениколом. CAT представляет собой тример из идентичных субъединиц (мономер Mr 25000), и тримерная структура стабилизируется рядом водородных связей, некоторые из которых приводят к протяжению бета-слоя через границу раздела субъединиц. Хлорамфеникол связывается в глубоком кармане, расположенном на границе между соседними субъединицами тримера, так что большинство остатков, образующих связывающий карман, принадлежат одной субъединице, в то время как каталитически важный гистидин принадлежит соседней субъединице. His195 имеет подходящее положение, чтобы действовать в качестве основного основного катализатора в реакции, а требуемая таутомерная стабилизация обеспечивается необычным взаимодействием с карбонильным кислородом основной цепи.

Применение

Используется CAT в качестве репортерной системы для измерения уровня промотора или его тканеспецифической экспрессии. Анализ CAT включает мониторинг ацетилирования радиоактивно меченного хлорамфеникола на планшете TLC ; Активность CAT определяется путем поиска ацетилированных форм хлорамфеникола, которые имеют значительно более высокую скорость миграции по сравнению с неацетилированной формой.

Ссылки
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR001707
Последняя правка сделана 2021-05-14 13:18:24
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте