ULK1

редактировать
ULK1
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы ULK1, ATG1, ATG1A, UNC51, Unc51.1, hATG1, unc-51, как киназа 1, активирующая аутофагию
Внешние идентификаторыOMIM: 603168 MGI: 1270126 HomoloGene: 2640 GeneCards: ULK1
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человека)
Chr. Хромосома 12 (человек)
Хромосома 12 (человека) Геномное расположение ULK1 Геномное расположение ULK1
Полоса 12q24.33Начало131 894 622 bp
Конец131 923 150 bp
Экспрессия РНК паттерн
PBB GE ULK1 209333 в fs.png
Дополнительные справочные данные по экспрессии
Orthologs
SpeciesHumanMouse
Entrez

8408

22241

Ensembl

ENSG00000177169

ENSMUSG00000029512

UniProt

O75385

O70405

RefSeq (mRNA)

NM_003565

<134739><134739>NM_009>RefSeq (белок)

NP_003556

NP_001334323. NP_033495

Местоположение (UCSC)Chr 12: 131,89 - 131,92 МБ Chr 5: 110,78 - 110,81 МБ
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ULK1 - это фермент, который у человека кодируется геном ULK1 .

Unc-51, подобная киназе, активирующей аутофагию (ULK1 / 2), представляет собой две похожие изоформы фермента, которые i У людей кодируются генами ULK1 / 2 . . Это, в частности, киназа, которая участвует в аутофагии, особенно в ответ на отмену аминокислот. Было проведено не так много исследований по сравнению двух изоформ, но были зарегистрированы некоторые различия.

Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Взаимодействия
  • 3 Структура
  • 4 Связанные заболевания
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
Функция

Ulk1 / 2 является важным белком в аутофагии для клеток млекопитающих и гомологичен ATG1 в дрожжах. Он является частью ULK1-комплекса, который необходим на ранних этапах биогенеза аутофагосом. Комплекс ULK1 также состоит из белка, взаимодействующего с киназой семейства FAK, с массой 200 кДа (FIP200 или RB1CC1) и белков ATG13 и ATG101, содержащих домен HORMA (Hop / Rev7 / Mad2). ULK1, в частности, оказывается наиболее важным для аутофагии и активируется в условиях дефицита питательных веществ несколькими вышестоящими сигналами, за которыми следует инициация аутофагии. Однако ULK1 и ULK2 демонстрируют высокую функциональную избыточность; исследования показали, что ULK2 может компенсировать потерю ULK1. Аутофагия, зависящая от питательных веществ, полностью подавляется только в том случае, если нокаутированы и ULK1, и ULK2.

ULK1 имеет множество нижестоящих мишеней фосфорилирования, чтобы способствовать этой индукции изолирующей мембраны / аутофагосомы. Недавно был выяснен механизм аутофагии. Модели предположили, что активный ULK1 непосредственно фосфорилирует Beclin-1 по Ser 14 и активирует проаутофагическую фосфоинозитид-3-киназу класса III (PI (3) K), комплекс VPS34, чтобы способствовать индукции аутофагии и созреванию..

Ulk1 / 2 негативно регулируется активностью mTORC1, которая активна во время сигналов окружающей среды анаболического типа. Напротив, Ulk1 / 2 активируется активностью AMPK из сигналов голодания.

Ulk1 / 2 может иметь критические роли помимо того, что выполняет ATG1 в дрожжах, включая рост и развитие нейронов.

Взаимодействия

В активном состоянии mTORC1 ингибирует аутофагию, фосфорилируя как ULK1, так и ATG13, что снижает киназную активность ULK1. В условиях голодания mTORC1 ингибируется и диссоциирует от ULK1, позволяя ему стать активным. AMPK активируется, когда внутриклеточный AMP увеличивается, что происходит в условиях голодания, что инактивирует mTORC1 и, таким образом, напрямую активирует ULK1. AMPK также непосредственно фосфорилирует ULK1 по множеству сайтов в линкерной области между киназным и С-концевым доменами.

ULK1 может фосфорилировать себя, а также ATG13 и RB1CC1, которые являются регуляторными белками; однако прямой субстрат ULK1 не был идентифицирован, хотя недавние исследования показывают, что он фосфорилирует Beclin-1.

Было обнаружено, что при протеотоксическом стрессе ULK1 фосфорилирует адаптерный белок p62, что увеличивает сродство связывания p62 с убиквитином.

Было показано, что ULK1 взаимодействовать с Raptor, Beclin1, Class-III-PI3K, GABARAPL2, GABARAP, SYNGAP1 и SDCBP.

Структура

ULK1 представляет собой белок массой 112 кДа. Он содержит N-концевой домен киназы, богатую серином и пролином область и C-концевой взаимодействующий домен. Экспериментально показано, что область, богатая серин-пролином, является местом фосфорилирования mTORC1 и AMPK - отрицательного и положительного регуляторов активности ULK1 соответственно. С-концевой домен содержит два домена, взаимодействующие с микротрубочками и транспортный (MIT), и действует как каркас, который связывает ULK1, ATG13 и FIFP200 вместе с образованием комплекса, необходимого для инициации аутофагии. Домены нацеливания / привязки ранней аутофагии (EAT) на С-конце расположены как домены MIT, состоящие из двух трехспиральных пучков. Домены MIT также опосредуют взаимодействия с мембранами. N-конец содержит домен серин-треонинкиназы. ULK1 также содержит большую активационную петлю между N и C-концом, которая заряжена положительно. Эта область может регулировать активность киназы и играть роль в распознавании различных субстратов. ULK1 и ULK2 имеют значительную гомологию как в C-концевом, так и в N-концевом доменах.

Связанные заболевания

Учитывая роль ULK1 в аутофагии, многие заболевания, такие как рак, нейродегенеративные расстройства, нарушения нервного развития, болезнь Крона может быть связана с любыми нарушениями регуляции аутофагии.

В частности, при раке ULK1 стал привлекательной терапевтической мишенью. Поскольку аутофагия является признаком выживания клеток, она позволяет опухолям (когда они уже сформированы) пережить энергетическую депривацию и другие стрессы, такие как химиотерапевтические препараты. По этой причине может оказаться полезным подавление аутофагии. Таким образом, ингибиторы были нацелены на ULK1.

Ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-06-20 06:13:00
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru