Войти
 | |
|---|---|
| Содержание | |
| Описание | Химические вещества и их биологические анализы |
| Организмы | Люди и другие животные |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | NCBI |
| Первичное цитирование | PMID 15879180 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | https: //pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ |
| Download URL | FTP |
| Web service URL | PUG-View |
| Miscellaneous | |
| License | Public domain |
PubChem - это база данных химических молекул и их активности в отношении биологических анализов. Система поддерживается Национальным центром биотехнологической информации (NCBI), компонентом Национальной медицинской библиотеки, которая является частью Национальных институтов здравоохранения США. (NIH). Доступ к PubChem можно получить бесплатно через веб-интерфейс пользователя. Миллионы составных структур и описательных наборов данных можно бесплатно загрузить через FTP. PubChem содержит описания веществ и небольшие молекулы, содержащие менее 1000 атомов и 1000 связей. Более 80 поставщиков баз данных вносят свой вклад в растущую базу данных PubChem.
PubChem состоит из трех динамически растущих баз данных-источников. На 1 ноября 2017 г.:
Поиск в базах данных возможен для широкого диапазона свойств, включая химическую структуру, фрагменты имен, химическая формула, молекулярная масса, XLogP и водородная связь количество доноров и акцепторов.
PubChem содержит собственный онлайн-сервис с поддержкой SMILES / SMARTS и InChI, который позволяет импортировать и экспортировать все распространенные химические форматы файлов для поиска для конструкций и фрагментов.
Каждое обращение предоставляет информацию о синонимах, химических свойствах, химической структуре, включая строки SMILES и InChI, биоактивности и ссылки на структурно родственные соединения и другие базы данных NCBI, такие как PubMed.
. В форме текстового поиска в полях базы данных можно искать, добавляя имя поля в квадратных скобках к поисковому запросу. Числовой диапазон представлен двумя числами, разделенными двоеточием. Условия поиска и имена полей не чувствительны к регистру. Можно использовать круглые скобки и логические операторы И, ИЛИ и НЕ. И предполагается, если оператор не используется.
Пример (Правило пяти Липинского ):
0: 500 [mw] 0: 5 [hbdc] 0:10 [hbac] -5: 5 [logp ]
PubChem был выпущен в 2004 году.
Американское химическое общество выразило обеспокоенность по поводу публичного поддерживала базу данных PubChem, поскольку она, похоже, напрямую конкурирует с их существующей Chemical Abstracts Service. Они очень заинтересованы в этом вопросе, поскольку Chemical Abstracts Service генерирует значительную часть доходов общества. Чтобы отстаивать свою позицию против базы данных PubChem, ACS активно лоббировала Конгресс США.
Вскоре после создания PubChem Американское химическое общество лоббировало США. Конгресс ограничил работу PubChem, которая, по их утверждениям, конкурирует с их Chemical Abstracts Service.
| . Идентификационные номера | ||
| • | Идентификационный номер в текущей базе данных | [UID] |
| • | Идентификационный номер вещества | [SID] |
| • | Идентификационный номер соединения | [CID] |
| • | Идентификационный номер BioAssay | [BAID], [AID] |
| . Общие | ||
| • | Любое поле базы данных | [ALL] |
| • | Комментарий | [CMT] |
| • | Дата депонирования | [DDAT], [DEPDAT] |
| • | Внешний идентификатор вкладчика | [SRID], [SRCID] |
| • | Имя источника | [SRC], [SRCNAM], [SRCNAME] |
| • | Дата выпуска источника | [SRD], [SRDAT], [RLSDAT] |
| • | Термин медицинской предметной рубрики (MeSH) | [MSHT], [MESHT] |
| • | узел дерева MeSH | [MSHN], [MESHTN] |
| • | Фармакологические действия MeSH | [PHMA], [PHARMA] |
| . Свойства веществ | ||
| • | Синонимы веществ | [SYNO] |
| • | ИЮПАК имя | [UPAC], [IUPAC] |
| • | Международный химический идентификатор (InChI) | [INCHI] |
| • | Молекулярная масса | [MW], [MWT], [MOLWT] |
| • | Химические элементы | [ELMT], [EL] |
| • | Неводородные атомы | [HAC], [HACNT] |
| • | Изотоп count | [IAC], [IACNT] |
| • | Общий формальный платеж | [TFC], [CHG], [CHRG] |
| • | Хиральный количество атомов | [ACC], [ACCNT] |
| • | Определенное количество хиральных атомов | [ACDC], [ACDCNT] |
| • | Неопределенное количество хиральных атомов | [ACUC], [ACUCNT] |
| • | Водородная связь количество акцепторов | [HBAC], [HBACNT] |
| • | Количество доноров водородной связи | [HBDC], [HBDCNT] |
| • | Таутомер count | [TC], [TCNT], [TTMC] |
| • | Количество вращающихся связей | [RBC], [RBCNT] |
| • | XLogP | [XLGP], [LOGP] |
| . Свойства соединения | ||
| • | Синонимы соединения | [CSYN], [CSYNO] |
| • | Количество компонентов | [CC], [ CCNT] |
| • | Количество ковалентных единиц (молекул) | [CUC], [CUCNT] |
| • | Общее количество биоактивностей | [TAC] |
 | Викиданные имеют свойство:
|
PubChem CID (P662) (см.