Войти
 | |
|---|---|
| Содержание | |
| Описание | Биологическая база данных |
| Типы данных. захваченные | Молекулы с лекарственными свойствами и биологической активностью |
| Связаться | |
| Исследовательский центр | Европейская лаборатория молекулярной биологии |
| Лаборатория |  Европейский институт биоинформатики |
| Авторы | Эндрю Лич, руководитель группы с 2016 г. по настоящее время; Джон Оверингтон, руководитель группы 2008-2015 |
| Основное упоминание | PMID 21948594 |
| Дата выпуска | 2009 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | ChEMBL |
| URL загрузки | Загрузки |
| веб-сервис URL | веб-службы ChEMBL |
| Sparql конечная точка | Платформа ChEMBL EBI-RDF |
| Разное | |
| Лицензия | The ChEMBL данные доступны на Creative Commons Attribution-Share Alike 3.0 Непортированная лицензия |
| Управление версиями | ChEMBL_25 |
ChEMBL или ChEMBLdb - вручную подобранный химическая база данных о биологически активных молекулах с лекарственными свойствами. Он поддерживается Европейским институтом биоинформатики (EBI), Европейской лабораторией молекулярной биологии (EMBL ), базирующейся в Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, СОЕДИНЕННОЕ КОРОЛЕВСТВО.
База данных, первоначально известная как StARlite, была разработана биотехнологической компанией Inpharmatica Ltd., позже приобретенной Galapagos NV. Данные были получены для EMBL в 2008 году с награды от The Wellcome Trust, что привело к созданию группы ChEMBL хемогеномики в EMBL-EBI под руководством Джона Оверингтона.
База данных ChEMBL содержит данные о биологической активности соединений против мишеней наркотиков. Биоактивность указывается в Ki, Kd, IC50 и EC50. Данные могут быть отфильтрованы и проанализированы для разработки библиотек для скрининга соединений для идентификации свинца во время открытия лекарств.
ChEMBL версии 2 (ChEMBL_02) был запущен в январе 2010 года, включая 2,4 миллиона биоанализов измерений, охватывающих 622 824 соединения, в том числе 24 000 натуральных продуктов. Это было получено в результате изучения более 34 000 публикаций в двенадцати журналах по медицинской химии. Охват доступных данных о биоактивности ChEMBL стал «самым полным из когда-либо представленных в общедоступной базе данных». В октябре 2010 года был запущен ChEMBL версии 8 (ChEMBL_08) с более чем 2,97 миллиона измерений биологических анализов, охватывающих 636 269 соединений.
ChEMBL_10 был дополнен PubChem подтверждающими тестами , для интеграции данных, которые сопоставимы с типом и классом данных, содержащихся в ChEMBL.
ChEMBLdb можно получить через веб-интерфейс или загрузить с помощью протокола передачи файлов. Он отформатирован таким образом, чтобы его можно было использовать для компьютеризированного интеллектуального анализа данных, и в нем предпринимаются попытки стандартизировать действия между различными публикациями, чтобы обеспечить возможность сравнительного анализа. ChEMBL также интегрирован в другие крупномасштабные ресурсы по химии, включая PubChem и ChemSpider систему Королевского химического общества.
Помимо базы данных, группа ChEMBL разработала инструменты и ресурсы для интеллектуального анализа данных. К ним относится Kinase SARfari, интегрированная рабочая среда хемогеномики, ориентированная на киназы. Система объединяет и связывает последовательность, структуру, соединения и данные скрининга.
GPCR SARfari - аналогичная рабочая среда, ориентированная на GPCR, а ChEMBL-Neglected Tropical Diseases (ChEMBL-NTD) - это хранилище для Открытый доступ данные первичного скрининга и медицинской химии, направленные на эндемические тропические болезни в развивающихся регионах Африки, Азии и Америки. Основная цель ChEMBL-NTD - предоставить свободный доступ к постоянному архиву и распределительному центру для депонированных данных.
В июле 2012 г. была выпущена новая служба данных по малярии, спонсируемая Предприятие «Лекарства от малярии» (MMV ), предназначенное для исследователей со всего мира. Данные в этой службе включают соединения из набора для скрининга Malaria Box, а также другие предоставленные данные о малярии, найденные в ChEMBL-NTD.
myChEMBL, виртуальная машина ChEMBL, была выпущена в октябре 2013 года, чтобы позволить пользователям получить доступ к полной и бесплатной, простой в установке инфраструктуре химинформатики.
В декабре 2013 года операции с базой данных по патентной информатике SureChem были переданы в EMBL-EBI. В сумке SureChem была переименована в SureChEMBL.
В 2014 г. был представлен новый ресурс ADME SARfari - инструмент для прогнозирования и сравнения межвидовых целей ADME.
 | Викиданные имеют свойство:
|
