Войти
| Pelagibacteraceles | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Proteobacteria |
| Класс : | Alphaproteobacteria |
| Подкласс: | Rickettsidae |
| Порядок: | Pelagibacterales |
Pelagibacterales - это порядок в Alphaproteobacteria, состоящий из свободных- живые бактерии, которые составляют примерно одну из трех клеток на поверхности океана. В целом, представители Pelagibacterales, по оценкам, составляют от четверти до половины всех прокариотических клеток в океане.
Первоначально этот таксон был известен исключительно по метагеномным данным и был известен как клада SAR11 . Сначала он был помещен в Rickettsiales, но позже был повышен до ранга порядка, а затем помещен как родственный орден Rickettsiales в подклассе Rickettsidae. Он включает в себя очень многочисленные морские виды Pelagibacter ubique.
Бактерии в этом отряде необычно малы. Из-за своего небольшого размера генома и ограниченной метаболической функции Pelagibacterales стали модельным организмом для 'теории оптимизации '.
P. ubique и родственные виды являются олиготрофами (поглотителями) и питаются растворенным органическим углеродом и азотом. Они не могут связывать углерод или азот, но могут выполнять цикл TCA с обходом глиоксилата и способны синтезировать все аминокислоты, кроме глицина, а также некоторые кофакторы. У них также есть необычная и неожиданная потребность в пониженном содержании серы.
P. ubique и представители океанической подгруппы I обладают глюконеогенезом, но не имеют типичного пути гликолиза, тогда как другие подгруппы способны к типичному гликолизу.
В отличие от Acaryochloris marina, P. ubique не фотосинтезирует - в частности, он не использует свет для увеличения энергии связи пары электронов - но он обладает протеородопсином (включая ретинол биосинтез) для производства АТФ из света.
Бактерии SAR11 ответственны за большую часть растворенного метана на поверхности океана. Они извлекают фосфат из метилфосфоновой кислоты.
Хотя таксон получил свое название от типового вида P. ubique (статус вида Candidatus), этот вид еще не был официально опубликован, и поэтому ни название для заказа, ни название вида имеет официальный таксономический статус.
В настоящее время отряд разделен на пять подгрупп:
Вышеупомянутая кладограмма Pelagibacterales выглядит следующим образом:
| |||||||||||||||||||||||||||||||
Подгруппа V (включает α-протеобактерии HIMB59) | |||||||||||||||||||||||||||||||
Исследование 2011 года, проведенное учеными из Гавайского университета в Mānoa и Государственный университет Орегона указали, что SAR11 мог быть предком митохондрий в большинстве эукариотических клеток. Однако этот результат может представлять артефакт реконструкции дерева из-за смещения композиции.
| Схема филогении рибосомных РНК Alphaproteobacteria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
