Hyphomicrobiales

Hyphomicrobiales
Agrobacterium (изображение СЭМ)
Научная классификация
Королевство:	Бактерии
Тип:	Протеобактерии
Класс:	Alphaproteobacteria
Заказ:	Hyphomicrobiales Дуглас 1957 (утвержденные списки 1980)
Семьи
См. Текст
Синонимы
Rhizobiales Kuykendall 2006

В Hyphomicrobiales является порядком из грамотрицательных Alphaproteobacteria.

Ризобии, который фиксирует азот и симбиотические корни растений, появляются в нескольких различных семействах. Четыре семейства Nitrobacteraceae, Hyphomicrobiaceae, Phyllobacteriaceae и Rhizobiaceae содержат по крайней мере несколько родов азотфиксирующих, клубенько -бобовых и микросимбиотических бактерий. Примерами являются роды Bradyrhizobium и Rhizobium. Виды Methylocystaceae - метанотрофы ; они используют метанол (CH 3 OH) или метан (CH 4) в качестве единственных источников энергии и углерода. Другими важными родами являются патогены человека Bartonella и Brucella, а также Agrobacterium (полезные в генной инженерии ).

• 1 Таксономия
  • 1.1 Принятые семьи
  • 1.2 Неназначенные роды
  • 1.3 Предварительные таксоны
• 2 Филогения
• 3 Естественная генетическая трансформация
• 4 См. Также
• 5 Примечания
• 6 Ссылки
• 7 Дальнейшее чтение

Принятые семьи

• Aestuariivirgaceae Li et al. 2019 г.
• Afifellaceae Hördt и др. 2020 г.
• Ahrensiaceae Hördt и др. 2020 г.
• Alsobacteraceae Sun et al. 2018 г.
• Amorphaceae Hördt и др. 2020 г.
• Ancalomicrobiaceae Dahal и др. 2018 г.
• Aurantimonadaceae Hördt и др. 2020 г.
• Bartonellaceae Gieszczykiewicz 1939 (утвержденные списки 1980 г.)
• Beijerinckiaceae Garrity et al. 2006 г.
• Blastochloridaceae Hördt и др. 2020 г.
• Boseaceae Hördt и др. 2020 г.
• Breoghaniaceae Hördt и др. 2020 г.
• Brucellaceae Breed et al. 1957 г. (утвержденные списки 1980 г.)
• Chelatococcaceae Dedysh et al. 2016 г.
• Cohaesibacteraceae Hwang and Cho 2008 г.
• Devosiaceae Hördt и др. 2020 г.
• Hyphomicrobiaceae Babudieri 1950 (утвержденные списки 1980 г.)
• Kaistiaceae Hördt и др. 2020 г.
• Lichenibacteriaceae Pankratov et al. 2020 г.
• Lichenihabitantaceae Noh et al. 2019 г.
• Methylobacteriaceae Garrity et al. 2006 г.
• Methylocystaceae Bowman 2006 г.
• Nitrobacteraceae corrig. Бьюкенен, 1917 г. (утвержденные списки 1980 г.)
• Notoacmeibacteraceae Huang et al. 2017 г.
• Parvibaculaceae Hördt и др. 2020 г.
• Phreatobacteraceae Hördt и др. 2020 г.
• Phyllobacteriaceae Mergaert and Swings 2006 г.
• Pleomorphomonadaceae Hördt и др. 2020 г.
• Pseudoxanthobacteraceae Hördt и др. 2020 г.
• Rhabdaerophilaceae Ming et al. 2020 г.
• Rhizobiaceae Conn 1938 (утвержденные списки 1980 г.)
• Rhodobiaceae Garrity et al. 2006 г.
• Roseiarcaceae Kulichevskaya и др. 2014 г.
• Salinarimonadaceae Cole et al. 2018 г.
• Segnochrobactraceae Akter et al. 2020 г.
• Stappiaceae Hördt и др. 2020 г.
• Tepidamorphaceae Hördt и др. 2020 г.
• Xanthobacteraceae Lee et al. 2005 г.

Неназначенные роды

Следующий род не отнесен к семейству:

• Flaviflagellibacter Dong et al. 2019 г.

Предварительные таксоны

Эти таксоны были опубликованы, но не прошли валидацию в соответствии с Бактериологическим кодексом :

• " Nordella " La Scola et al. 2004 г.
• " Propylenellaceae " Liu et al. 2021 г.
  • " Propylenella " Liu et al. 2021 г.
    • " Propylenella binzhouense " Лю и др. 2021 г.
• « Термопетробактер » Сислак 2013 г.

В настоящее время принятая таксономия основана на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре, а филогения основана на полногеномных последовательностях.

Сообщалось о естественной генетической трансформации по крайней мере четырех видов Hyphomicrobiales: Agrobacterium tumefaciens, Methylobacterium organophilum, Ensifer adhaerens и Bradyrhizobium japonicum. Естественная генетическая трансформация - это половой процесс, включающий передачу ДНК от одной бактериальной клетки к другой через промежуточную среду и интеграцию донорной последовательности в геном реципиента путем гомологичной рекомбинации.

• Lar1

• Kuykendall LD, Dazzo FB (2005). « Аллоризобиум ». В Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (ред.). Альфа-, бета-, дельта- и эпсилонпротеобактерии, протеобактерии, часть C, Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2 (2-е изд.). Спрингер, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. С. 345–346. ISBN   978-0-387-24144-9.
• Куйкендалл Л.Д. (2005). «Род Азорхизобиум ». В Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (ред.). Альфа-, бета-, дельта- и эпсилонпротеобактерии, протеобактерии, часть C, Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2 (2-е изд.). Спрингер, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. С. 505–506. ISBN   978-0-387-24144-9.
• Куйкендалл Л.Д. (2005). "Род Bradyrhizobium, семья Bradyrhizobiaceae ' ". В Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (ред.). Альфа-, бета-, дельта- и эпсилонпротеобактерии, протеобактерии, часть C, Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2 (2-е изд.). Спрингер, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. С. 438–443. ISBN   978-0-387-24144-9.
• Kuykendall LD, Young JM, Martínez-Romero, Kerr A, Sawada H (2005). «Род Rhizobium, сильно расходящийся род в пересмотренном семействе». В Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (ред.). Альфа-, бета-, дельта- и эпсилонпротеобактерии, протеобактерии, часть C, Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2 (2-е изд.). Спрингер, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. С. 324–340. ISBN   978-0-387-24144-9.
• Чен В.Х., Ван Э.Т., Куйкендалл Л.Д. (2005). " enus Mesorhizobium, семейство Photobacteriaceae.". В Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity G (ред.). Альфа-, бета-, дельта- и эпсилонпротеобактерии, протеобактерии, часть C, Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2 (2-е изд.). Спрингер, Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. С. 403–408. ISBN   978-0-387-24144-9.