Bradyrhizobium japonicum | |
---|---|
Штамм Bradyrhizobium japonicum USDA 110 на чашке с агаром | |
Научная классификация | |
Царство: | Бактерии |
Тип: | Proteobacteria |
Класс: | Alphaproteobacteria |
Порядок: | Rhizobiales |
Семейство: | Bradyrhizobiaceae |
Род: | Bradyrhizobium |
Виды: | Б. japonicum |
Биномиальное название | |
Bradyrhizobium japonicum . (Kirchner 1896 ), 1982 | |
Синонимы | |
Rhizobium japonicum Buchanan 1926. Rhizobacterium japonicum Kirchner 1896 |
Bradyrhizobium japonicum представляет собой вид бобовых - клубеньковых, микросимбиотических азотфиксирующих бактерий. Этот вид является одним из многих грамотрицательных, палочковидных бактерий, обычно называемых ризобиями. В рамках этой широкой классификации, состоящей из трех групп, исследования таксономии с использованием секвенирования ДНК показывают, что B. japonicum принадлежит к группе гомологии II.
Б. japonicum добавляют к семенам бобовых для повышения урожайности сельскохозяйственных культур, особенно в районах, где бактерия не является аборигенной (например, в почвах Арканзаса ). Часто инокулят приклеивают к семенам перед посадкой с использованием раствора сахара.
Штамм B. japonicum, USDA110, модельный организм используется с 1957 года. Он широко используется для изучения молекулярной генетики, физиологии растений и экологии растений из-за относительно превосходной симбиотической азотфиксации с соей (т.е. по сравнению с другими видами ризобий). Его весь геном был секвенирован в 2002 году, и было обнаружено, что этот вид имеет единственную кольцевую хромосому с 9 105 828 парами оснований.
B. japonicum способен расщеплять катехин с образованием флороглюцинкарбоновой кислоты, далее декарбоксилированной до флороглюцина, который дегидроксилируется до резорцина и гидроксихинол.
B. japonicum обладают геном nosRZDFYLX, который способствует денитрификации и имеет две каталитические субъединицы - Cu-a и Cu-z (с несколькими остатками гистидина). Он управляет каскадом экспрессии, который может определять градиенты кислорода, называемый «FixJ-FixK2-FixK1». FixJ положительно регулирует FixK2, который активирует гены азотного дыхания, а также FixK1. Мутанты FixK1 не могут дышать от азота из-за дефектной кататиловой субъединицы меди (Cu-z) в nosRZDFYLX.
Естественная генетическая трансформация у бактерий - это половой процесс, включающий передачу ДНК от одной клетки к другой через промежуточную среду и интеграцию донорной последовательности в геном реципиента посредством гомологичной рекомбинации. Клетки B. japonicum способны трансформироваться. Они становятся компетентными для захвата ДНК на поздней стадии регистрации.
Wikispecies содержат информацию, относящуюся к Bradyrhizobium japonicum |