Войти
| OmpA-подобный трансмембранный домен | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||
| Символ | OmpA_membrane | ||||||||||
| Pfam | PF01389 | ||||||||||
| Pfam клан | CL0193 | ||||||||||
| InterPro | IPR000498 | ||||||||||
| PROSITE | PDOC00819 | ||||||||||
| SCOPe | 1bxw / SUPFAM | ||||||||||
| TCDB | 1.B.6 | ||||||||||
| надсемейство OPM | 26 | ||||||||||
| Белок OPM | 1qjp | ||||||||||
| |||||||||||
OmpA-подобный трансмембранный домен представляет собой эволюционно консервативный домен белков внешней мембраны бактерий. Этот домен состоит из восьмицепочечного бета-барреля. OmpA является преобладающим поверхностным антигеном энтеробактерий, обнаруживаемым в количестве примерно 100 000 копий на клетку. Экспрессия OmpA строго регулируется множеством механизмов. Одним из механизмов, с помощью которого экспрессия OmpA регулируется у видов Vibrio, является антисмысловая некодирующая РНК, называемая VrrA.
Структура состоит из восьмицепочечного бета-цилиндра с верхним и нижним расположением цепей. Нити соединены четырьмя внеклеточными петлями и тремя внутриклеточными витками.
Многочисленные OmpA-подобные мембранные домены вносят вклад в бактериальную вирулентность посредством различных механизмов, таких как связывание с клетками-хозяевами или иммунные регуляторы, такие как фактор H. Известные примеры включают E. coli OmpA и Yersinia pestis Ail. Некоторые из этих белков являются кандидатами в вакцины.
Э. coli OmpA, как было показано, специфически взаимодействует с человеческим гликопротеином Ecgp на эндотелиальных клетках микрососудов головного мозга. Cronobacter sakazakii является пищевым патогеном, вызывающим менингит у новорожденных, и был показано, что он связывает фибронектин через OmpA, и это играет важную роль в проникновении через гематоэнцефалический барьер. Белок Y. pestis Ail связывается с ламинином и гепарином, тем самым обеспечивая прикрепление бактерий к клеткам-хозяевам. Белок Borrelia afzelii BAPKO_0422 представляет собой OmpA-подобный трансмембранный домен и связывается с человеческим фактором H.
.
