GLI1

редактировать
GLI1
Белок GLI1 PDB 2gli.png
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы GLI1, GLI, семейства GLI цинковый палец 1, PAPA8, PPD1
Внешние идентификаторыOMIM: 165220 MGI: 95727 HomoloGene: 3859 Генные карты: GLI1
Местоположение гена (человек)
Хромосома 12 (человека)
Chr. Хромосома 12 (человек)
Хромосома 12 (человека) Местоположение генома для GLI1 Местоположение генома для GLI1
Полоса 12q13.3Начало57,459,785 bp
Конец57,472,268 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE GLI1 206646 в fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
ВидыЧеловекМышь
Entrez

2735

14632

Ensembl

ENSG 00000111087

ENSMUSG00000025407

UniProt

P08151

P47806

RefSeq (мРНК)

NM_001160045. NM_001167609. NM_005269

NM_01029Seal (белок) NP_001153517. NP_001161081. NP_005260

NP_034426

Местоположение (UCSC)Chr 12: 57,46 - 57,47 Мб Chr 10: 127,33 - 127,34 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок цинкового пальца GLI1, также известный как связанный с глиомой онкоген, представляет собой белок, человека кодируется геном GLI1 . Первоначально он был выделен из клеток глиобластомы человека.

Содержание
  • 1 Функция
  • 2 Семейство Gli
  • 3 Изоляция
  • 4 Взаимодействия
  • 5 Ссылки
  • 6 Внешние links
Функция

Белки Gli являются эффекторами передачи сигналов Hedgehog (Hh) и, как было показано, участвуют в определении судьбы клетки, пролиферации и формировании паттерна во многих типах клеток и большинстве органов во время развития эмбриона. В развивающемся спинном мозге гены-мишени белков Gli, которые сами по себе являются факторами транскрипции, организованы в сложную регуляторную сеть генов, которая транслирует градиент внеклеточной концентрации Sonic hedgehog в различные клеточные судьбы вдоль дорсовентральной оси.

Факторы транскрипции Gli активируют / ингибируют транскрипцию, связываясь с генами, отвечающими за Gli, и взаимодействуя с комплексом транскрипции. Факторы транскрипции Gli имеют ДНК связывающие «цинковые пальцы» домены, которые связываются с консенсусными последовательностями на своих генах-мишенях для инициации или подавления транскрипции. Юн показал, что мутация домена цинкового пальца Gli ингибирует эффект белков, доказывая его роль в качестве фактора транскрипции. Белки Gli имеют 18-аминокислотную область, очень похожую на домен активации 16 α-спирального белка вируса простого герпеса. Этот домен содержит консенсусный элемент распознавания человеческого фактора TAFII31, связанного с TFIID TATA box белком. Было показано, что другие белки, такие как отсутствующие в метастазах (MIM / BEG4), усиливают эффекты факторов транскрипции Gli на транскрипцию целевого гена. Было показано, что Gli и MIM действуют синергетически, индуцируя рост эпидермиса, а трансплантаты со сверхэкспрессией MIM + Gli1 демонстрируют сходные модели роста с трансплантатами Shh.

Семейство Gli

Есть три члена этого семейства; Gli1, Gli2 и Gli3, которые все являются факторами транскрипции, опосредующими путь Hh. Гены GLI1, GLI2 и GLI3 кодируют факторы транскрипции, все из которых содержат консервативные тандемные домены «цинковые пальцы» C2-H2 и консенсусную линкерную последовательность гистидин / цистеин между цинковыми пальцами. Этот мотив Gli родственен мотивам Kruppel, который является геном сегментации Drosophila класса gap. У трансгенных мышей мутант Gli1, лишенный цинковых пальцев, не индуцирует мишени Sonic Hedgehog (Shh). Консервативный участок из 9 аминокислот соединяет С-концевой гистидин одного пальца с N-концевым цистеином следующего. Аминокислотная последовательность консенсусного пальца GLI представляет собой [Y / F] JXCX3GCX3 [F / Y] X5LX2HX4H [T / S] GEKP. Было показано, что связывающий домен цинкового пальца ДНК белков Gli1 и Gli2 связывается с консенсусным ДНК-связывающим сайтом GLI GACCACCCA.

Регуляция транскрипции белков Gli является тканеспецифичной для многих мишеней. Например, Gli1 в первичных кератиноцитах активирует FOXM1, тогда как в мезенхимальных клетках C3H10T1 / 2 было показано, что он активирует рецептор тромбоцитарного фактора роста PDGFRa.

Gli1 человека кодирует активатор транскрипции, участвующий в развитии, который известен онкоген. Было обнаружено, что N-концевые области Gli1 рекрутируют гистондеацетилазные комплексы через SuFu, которые участвуют в фолдинге ДНК в хромосомах. Это может отрицательно регулировать транскрипцию, указывая на то, что Gli1 может действовать как ингибитор транскрипции, а также как активатор. Область промотора GLI1 человека регулируется 5’-областью 1,4 т.п.н., включающей 5 ’фланкирующую последовательность, нетранслируемый экзон и 425 п.н. первого интрона. Многочисленные белки, такие как Sp1, USF1, USF2 и Twist, также участвуют в регуляции промотора Gli1. Во время развития эмбрионов мышей экспрессия Gli1 может быть обнаружена в мезодерме кишечника, брюшной нервной трубке, эпендимном слое спинного мозга, переднем мозге, среднем мозге, мозжечке и в местах формирования эндохондральной кости. Некоторые из нижележащих генов-мишеней человеческого Gli1 включают регуляторы клеточного цикла и апоптоза, такие как циклин D2 и плакоглобин соответственно. Gli1 также активирует FoxM1 в BCC. Экспрессия Gli1 также может имитировать экспрессию Shh в определенных типах клеток.

Выделение

GLI1 был первоначально выделен из глиомы опухоли, и было обнаружено, что его активность повышается во многих опухолях. включая опухоли мышц, мозга и кожи, такие как базальноклеточная карцинома (BCC). Изменения числа копий ДНК, которые способствуют повышенному превращению онкогенов Gli1–3 в активаторы транскрипции посредством сигнального пути Hedgehog, включены в структуру всего генома, которая, как было обнаружено, коррелирует с исходом пациента с астроцитомой. Гены Shh и Gli обычно экспрессируются в волосяных фолликулах, а опухоли кожи, экспрессирующие Gli1, могут возникать из волосяных фолликулов. Уровень экспрессии Gli1 коррелирует со степенью опухоли в костных и мягких тканях сарком. У трансгенных мышей и лягушек со сверхэкспрессией Gli1 развиваются BCC-подобные опухоли, а также другие новообразования, происходящие из волосяных фолликулов, такие как как трихоэпителиомы, цилиндромы и трихобластомы. Экспрессия Gli1 в эмбриональном эпидермисе лягушки приводит к развитию опухолей, которые экспрессируют эндогенный Gli1. Это говорит о том, что сверхэкспрессии Gli1 одного, вероятно, достаточно для развития опухоли. Таким образом, предполагается, что мутации, приводящие к экспрессии Gli1 в базальных клетках, вызывают образование BCC.

Взаимодействия

GLI1 было показано, что взаимодействует с:

Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-05-21 09:01:37
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте