XPO5

редактировать
XPO5
Доступные структуры
PDB Поиск по ортологу: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы XPO5, exp5, exportin 5
Внешние идентификаторыOMIM: 607845 MGI: 1913789 ГомолоГен: 69316 Генные карты: XPO5
Местоположение гена (человек)
Хромосома 6 (человека)
Chr. Хромосома 6 (человек)
Хромосома 6 (человека) Расположение в геноме XPO5 Расположение в геноме XPO5
Полоса 6p21.1Начало43,522,334 bp
Конец43,576,038 bp
Экспрессия РНК паттерн
PBB GE XPO5 gnf1h05645 s at fs.png
Дополнительные справочные данные по экспрессии
Orthologs
SpeciesHumanMouse
Entrez

57510

72322

Ensembl

ENSG00000124571

ENSMUSG00000067150

UniProt

Q9HAV4

Q924C1

RefSeq (mRNA_020210>NM0210>NM_028198

RefSeq (белок)

NP_06 5801

NP_082474

Местоположение (UCSC)Chr 6: 43,52 - 43,58 МБ Chr 17: 46,2 - 46,24 МБ PubMed поискWikidata
Просмотр / редактирование Человек Просмотр / редактирование мыши

Идентификатор гена: 57510

Экспортин-5 (XPO5 ) - это белок, который у людей кодируется ген XPO5 . В эукариотических клетках основной целью XPO5 является экспорт пре-микроРНК (также известной как пре-миРНК) из ядра в .>цитоплазма, для дальнейшей обработки ферментом Dicer. Попадая в цитоплазму, микроРНК (также известная как миРНК) может действовать как глушитель, регулируя трансляцию мРНК. Хотя XPO5 в первую очередь участвует в транспорте пре-миРНК, сообщалось также, что он транспортирует тРНК.

В настоящее время ведутся многочисленные исследования XPO5. miRNA является важной темой исследований из-за ее потенциального использования в качестве терапевтического средства, причем несколько препаратов на основе miRNA уже используются.

Содержание
  • 1 Механизм
    • 1.1 Связывание с пре-miRNA
    • 1.2 тройной комплекс XPO5 Транспортный механизм
    • 1.3 Экспорт из ядра
  • 2 Дополнительные взаимодействия
  • 3 Потенциальная онкогенная роль
  • 4 Ссылки
  • 5 Дополнительная литература
Механизм

Связывание с пре-миРНК

Изображение тройного комплекса XPO5, созданного в PyMol из записи кристаллической структуры 3A6P в банке данных белков. XPO5 помечен зеленым, Ran - красным, РНК - многоцветным, а GTP - белым.

После того, как RanGTP связывается с XPO5, комплекс XPO5-RanGTP образует U-подобную структуру для удерживания пре-миРНК. Комплекс XPO5-RanGTP узнает пре-миРНК по своей двухнуклеотидной 3 ’выступающей последовательности, состоящей из двух оснований на 3’ конце пре-миРНК, которые не спарены с другими основаниями. Этот мотив является уникальным для пре-миРНК, и, узнавая его, XPO5 обеспечивает специфичность для транспорта только пре-миРНК. Сама по себе пре-миРНК находится в «закрытой» конформации с 3’-выступом, повернутым вверх по направлению к малой бороздке РНК. Однако при связывании с XPO5 3’-выступ переворачивается вниз от остальной части молекулы пре-миРНК в «открытую» конформацию. Это помогает фосфатам скелета этих двух нуклеотидов образовывать водородные связи со многими остатками XPO5, позволяя XPO5 распознавать РНК как пре-миРНК. Поскольку эти взаимодействия затрагивают только фосфатный остов РНК, они неспецифичны и позволяют XPO5 распознавать и транспортировать любую пре-миРНК. Остальная часть ствола пре-миРНК связывается с XPO5 посредством взаимодействий между отрицательно заряженным фосфатным остовом и несколькими положительно заряженными внутренними остатками XPO5.

Механизм транспорта тройного комплекса XPO5

Комбинированная структура XPO5, RanGTP и пре-миРНК известны как тройной комплекс. Как только тройной комплекс сформирован, он диффундирует через комплекс ядерных пор в цитоплазму, транспортируя пре-миРНК в цитоплазму. Попав в цитоплазму, RanGAP гидролизует GTP до GDP, вызывая конформационное изменение, которое высвобождает пре-миРНК в цитоплазму.

Экспорт из ядра

Это было предположено на основании предоставленных доказательств по контурным картам плотности воды видно, что внутренняя часть XPO5 гидрофильна, а внешняя часть XPO5 гидрофобна. Следовательно, это увеличивает связывающую способность XPO5 с комплексом ядерной поры, позволяя транспортировать тройной комплекс из ядра.

Дополнительные взаимодействия

Было показано, что XPO5 взаимодействует с ILF3 и Ran.

Потенциальная онкогенная роль

Недавние данные показали более высокие уровни XPO5 в клеточных линиях рака простаты in-vitro, предполагая, что измененная экспрессия XPO5 уровни могут иметь значение в развитии рака. Также было обнаружено, что подавление XPO5 оказывает терапевтическое действие in vitro.

Ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-06-22 06:43:54
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте