Войти
Токсикогеномика является подразделом фармакология, которая занимается сбором, интерпретацией и хранением информации об активности гена и белка в конкретной клетке или ткани организма в ответ на воздействие токсичных веществ. Токсикогеномика сочетает в себе токсикологию с геномикой или другими высокопроизводительными технологиями молекулярного профилирования, такими как транскриптомика, протеомика и метаболомика. Токсикогеномика стремится выяснить молекулярные механизмы, возникшие в результате проявления токсичности, и вывести паттерны молекулярной экспрессии (т.е. молекулярные биомаркеры ), которые предсказывают токсичность или генетическую предрасположенность к ней.
В фармацевтических исследованиях токсикогеномика определяется как изучение структуры и функции генома, когда он реагирует на неблагоприятное воздействие ксенобиотиков. Это токсикологическая субдисциплина фармакогеномики, которая в широком смысле определяется как изучение межиндивидуальных вариаций в полногеномных картах или картах генов-кандидатов однонуклеотидного полиморфизма, гаплотипов маркеры и изменения в экспрессии гена, которые могут коррелировать с реакциями на лекарства. Хотя термин «токсикогеномика» впервые появился в литературе в 1999 году, к тому времени он уже широко использовался в фармацевтической промышленности, поскольку его происхождение было обусловлено маркетинговыми стратегиями компаний-поставщиков. Этот термин до сих пор не является общепринятым, и другие предложили альтернативные термины, такие как хемогеномика, чтобы описать, по сути, ту же область исследования.
Природа и сложность данные (по объему и изменчивости) требуют высокоразвитых процессов автоматизированной обработки и хранения. Анализ обычно включает широкий спектр биоинформатики и статистики, часто включая подходы статистической классификации.
В фармацевтических открытиях лекарств и разработке токсикогеномика используется для изучения возможных неблагоприятных (т.е. токсических ) эффектов фармацевтических препаратов в определенных модельных системах, чтобы сделать выводы о токсическом риске для пациентов или окружающей среды. И Агентство по охране окружающей среды США (EPA), и Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (FDA) в настоящее время не допускают принятия регулирующих решений только на основе данных геномики. Однако они поощряют добровольное предоставление хорошо задокументированных и качественных данных геномики. Оба агентства рассматривают возможность использования представленных данных в индивидуальном порядке для целей оценки (например, чтобы помочь прояснить механизм действий или внести вклад в подход, основанный на совокупности доказательств) или для заполнения соответствующих сравнительных баз данных путем поощрения параллельных представлений. данных геномики и результатов традиционных токсикологических тестов.
Химические эффекты в биологических системах - это проект, организованный Национальным институтом гигиены окружающей среды, создающий базу знаний токсикологических исследований, включая дизайн исследования, клиническую патологию, а также данные гистопатологии и токсикогеномики.
InnoMed PredTox оценивает ценность объединения результатов различных омических технологий вместе с результатами от более традиционных методов токсикологии к более информированному принятию решений в доклинической оценке безопасности.
Open TG-GATEs (Toxicogenomics Project - Genomics Assisted Toxicity Evaluation System) - это японская государственно-частная электронная ffort, который опубликовал информацию об экспрессии генов и патологии для более чем 170 соединений (в основном лекарств).
Консорциум по прогнозированию безопасности стремится идентифицировать и клинически квалифицировать биомаркеры безопасности для нормативного использования в рамках FDA "Инициатива критического пути".
ToxCast - это программа для прогнозирования опасностей, определения путей токсичности и определения приоритетности тестирования токсичности химических веществ в окружающей среде в Агентстве по охране окружающей среды США.
Tox21 это федеральное сотрудничество с участием Национальных институтов здоровья (NIH), Агентства по охране окружающей среды (EPA) и Управления по контролю за продуктами и лекарствами (FDA), направленное на разработку более эффективных методов оценки токсичности. В рамках этого проекта были оценены токсические эффекты химических соединений на клеточные линии, полученные от людей в рамках проекта 1000 Genomes Project, и определены ассоциации с генетическими маркерами. Части этих данных были использованы в исследовании NIEHS-NCATS-UNC DREAM Toxicogenetics Challenge для определения методов прогнозирования цитотоксичности для отдельных лиц.
