TNNT1

редактировать
TNNT1
Идентификаторы
Псевдонимы TNNT1, ANM, NEM5, STNT, TNT, TNTS, тропонин T1, медленный скелетный тип
Внешние идентификаторыOMIM: 191041 MGI: 1333868 HomoloGene: 20704 Генные карты: TNNT1
Местоположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr. Хромосома 19 (человек)
Хромосома 19 (человек) Геномное расположение для TNNT1 Геномное расположение для TNNT1
полоса 19q13.42Начало55,132,698 bp
Конец55,149,206 bp
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TNNT1 213201 s at fs.png
Дополнительные данные эталонной экспрессии
Orthologs
SpeciesHumanMouse
Entrez

7138

21955

Ensembl

ENSG00000105048

ENSMUSG00000064179

UniProt

P13805. Q3B759

O88346

RefSeq (мРНК)

NM_001126132. NM_001126133. NM_001291774 <27001290>NM_001291774 <27001290>NM_001291774 <27001290>. NM_011618. NM_001360154

RefSeq (белок)

NP_001119604. NP_001119605. NP_001278703. NP_003274

NP_001264832. NP_0012648330>NP_0012600_35 Местоположение (UCSC)

Chr 19: 55,13 - 55,15 Мб Chr 7: 4,5 - 4,52 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тропонин медленных скелетных мышц T (sTnT) представляет собой белок, который у человека кодируется b y ген TNNT1 .

Ген TNNT1 расположен в 19q13.4 в хромосомном геноме человека, кодируя изоформу медленных скелетных мышц тропонина T (ssTnT). ssTnT представляет собой белок массой ~ 32 кДа, состоящий из 262 аминокислот (включая первый метионин ) с изоэлектрической точкой (pI) 5,95. Это субъединица, связывающая тропомиозин и заякоряющая тонкие филаменты комплекса тропонина в саркомерах медленно сокращающихся волокон скелетных мышц. Ген TNNT1 специфически экспрессируется в медленных скелетных мышцах позвоночных, за одним исключением, что сердечная мышца сухопутной жабы (Bufo) экспрессирует ssTnT, отличный от сердечного TnT.

Содержание
  • 1 Evolution
  • 2 Альтернативный сплайсинг
  • 3 Клиническая значимость
  • 4 Взаимодействия
  • 5 Примечания
  • 6 Ссылки
  • 7 Внешние ссылки
Эволюция
пары генов TnT TnI.jpg

Три гомологичных гена развились у позвоночных, кодирующих три типа мышц изоформы TnT. Каждый из генов изоформы TnT связан с одним из трех генов изоформы тропонина I, кодирующих ингибирующую субъединицу комплекса тропонина, в хромосомной ДНК с образованием трех пар генов: TnI быстрой скелетной мышцы (fsTnI) -fsTnT, ssTnI-cardiac ( cTnT) и пары генов cTnI-ssTnT. Исследования по консервации последовательностей и эпитопов показали, что гены, кодирующие изоформы TnT и TnI, специфичные для мышечного типа, могли возникнуть в результате дупликаций пары генов fsTnI-like-fsTnT-like. Эволюционное происхождение трех пар генов TnI-TnT показывает, что cTnI-ssTnT является новейшим и наиболее тесно связанным.

Выравнивание последовательностей белков показало, что гены TNNT1 высоко консервативны среди видов позвоночных (рис. 2), особенно у среднюю и С-концевую области, тогда как три изоформы мышечного типа значительно различаются среди видов позвоночных.

филогенное дерево гена TNNT1.jpg
Альтернативный сплайсинг

У млекопитающих и птиц ген TNNT1 имеет в общей сложности 14 экзонов, среди которых экзон 5, кодирующий 11-аминокислоту в N-концевой области, альтернативно сплайсируется, генерируя формы сплайсинга медленных TnT с высокой и низкой молекулярной массой (Jin, Chen et al. 1998). Биохимические исследования показали, что сплайсинговые формы TnT обнаруживают различную молекулярную конформацию в средней и C-концевой областях, вызывая различную аффинность связывания для TnI и тропомиозина. Альтернативные сплайсинговые формы ssTnT играют роль в адаптации скелетных мышц в физиологических и патологических состояниях. Альтернативный сплайсинг на альтернативных акцепторных сайтах интрона 5 генерирует одно аминокислотное различие в N-концевой области ssTnT, функциональное значение которого не установлено.

Клиническое значение

Нонсенс мутация E180X в экзоне 11 гена TNNT1 вызывает миопатию амишей немалина (ANM), которая является тяжелой формой рецессивной миопатии немалинов, первоначально обнаруженной в популяции амишей старого порядка. в Пенсильвании, США. Усечение полипептидной цепи ssTnT мутацией E180X удаляет сайт связывания тропомиозина 2, а также сайты связывания для TnI и тропонина C (TnC) в C-концевой области (рис. 3). В соответствии с рецессивным фенотипом укороченный ssTnT неспособен встраиваться в миофиламенты и полностью разрушается в мышечных клетках.

Структура скелетного тропонинового комплекса.tif

Исследования на мышах, нацеленных на ген Tnnt1, воспроизводили миопатические фенотипы ANM. У ssTnT-нулевых мышей было обнаружено значительно уменьшенное количество медленных волокон типа I в диафрагме и камбаловидной мышце с гипертрофией быстрых волокон типа II, повышенная утомляемость и активная регенерация медленных волокон (Wei, Lu et al. 2014).

Недавний случай. отчеты выявили еще три мутации в гене TNNT1, вызывающие миопатии немалинов за пределами популяции амишей. Нонсенс-мутация S108X в экзоне 9 была идентифицирована у латиноамериканского пациента мужского пола с тяжелым рецессивным фенотипом немалиновой миопатии. У голландского пациента с составными гетерозиготными мутациями гена TNNT1, которые вызывают делеции экзона 8 и экзона 14, также проявляются фенотипы немалиновой миопатии. Перестройка гена TNNT1 (c.574_577 delins TAGTGCTGT), приводящая к аберрантному сплайсингу, вызывающему усечение С-конца белка (усечение L203), была зарегистрирована у 9 палестинских пациентов из 7 неродственных семей с рецессивно наследуемой немалиновой миопатией.

Проиллюстрировано на рис. 3, мутация S108X усекает белок ssTnT, вызывая потерю функциональных структур, эквивалентную таковой у E180X. Делеция экзона 8 разрушает сайт связывания тропомиозина 1 средней области. Усечение L203 удаляет сайты связывания для TnI и TnC, но сохраняет оба сайта связывания тропомиозина 1 и 2. Остается неясным, способна ли эта новая мутация связывать актин-тропомиозиновый тонкий филамент in vivo и как он вызывает рецессивную немалиновую миопатию.

Альтернативный сплайсинг экзона 5 дает сплайсинговые формы с высокой и низкой молекулярной массой ssTnT. Низкомолекулярный ssTnT значительно повышается при типе 1 (демиелинизация), но не при типе 2 (потеря аксонов) болезни Шарко-Мари-Тута, что позволяет предположить, что структурная модификация TnT в миофиламентах может способствовать адаптации к аномалиям нейрональной активации.

Взаимодействия

Было показано, что TNNT1 взаимодействует с PRKG1.

Примечания

Ссылки
Внешние ссылки
Последняя правка сделана 2021-06-09 06:08:51
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru