SDHA

редактировать
SDHA
SuccDeh.svg
Идентификаторы
Псевдонимы SDHA, CMD1GG, FP, PGL5, SDH1, SDH2, SDHF, субъединица A флавопротеина комплекса сукцинатдегидрогеназы
Внешние идентификаторыOMIM: 600857 MGI: 1914195 HomoloGene: 3073 GeneCards : SDHA
Расположение гена (человек)
хромосомы 5 (человек)
Chr. Хромосома 5 (человек)
хромосомы 5 (человек) Местоположение генома для SDHA Местоположение генома для SDHA
Полоса 5p15.33Начало218,241 bp
Конец257,082 bp
Orthologs
SpeciesHumanMouse
Entrez

6389

66945

Ensembl

ENSG00000073578

ENSMUSG00000021577

UniProt

P31040

Q8K2B3

RefSeq (мРНК)

NM_001294332. NM_004168. NM_001330758 <282Seq>белок NP_001281261. NP_001317687. NP_004159

NP_075770

Местоположение (UCSC)Chr 5: 0,22 - 0,26 Мб Chr 13: 74,32 - 74,35 Мб
PubMed поиск
Викиданные
Просмотр / E dit Человек Просмотр / редактирование Мышь

Комплекс сукцинатдегидрогеназы, субъединица A, вариант флавопротеина представляет собой белок, который у человека кодируется геном SDHA . Этот ген кодирует главную каталитическую субъединицу сукцинат-убихинон оксидоредуктазы, комплекса дыхательной цепи митохондрий. Комплекс состоит из четырех ядерно-кодируемых субъединиц и локализован во внутренней мембране митохондрий. SDHA содержит сайт связывания FAD, где сукцинат депротонируется и превращается в фумарат. Мутации в этом гене были связаны с формой дефицита митохондриальной дыхательной цепи, известной как синдром Ли. псевдоген был идентифицирован на хромосоме 3q29. Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, кодирующие различные изоформы.

Содержание
  • 1 Структура
  • 2 Функция
  • 3 Клиническая значимость
  • 4 Интерактивная карта путей
  • 5 Ссылки
  • 6 Дополнительная литература
Структура

Ген SDHA расположен на плече p хромосомы 5 в локусе 15 и состоит из 16 экзонов. Белок SDHA , кодируемый этим геном, имеет длину 664 аминокислоты и вес 72,7 кДа.

Белок SDHA имеет четыре субдомена, включая кэпирующий домен, спиральный домен, С-конец и, прежде всего, β-ствол FAD-связывающий домен на N-конце. Следовательно, SDHA является флавопротеином (Fp) из-за простетической группы флавинадениндинуклеотида (FAD ). Кристаллическая структура предполагает, что FAD ковалентно связан с остатком гистидина (His99) и дополнительно координируется водородными связями с рядом других аминокислотных остатков в FAD-связывающем домене. FAD, который происходит из рибофлавина (витамина B 2 ), таким образом, является важным кофактором для функции SDHA и всего комплекса II.

Функция
SuccDeh.svg

Комплекс SDH расположен на внутренняя мембрана митохондрий и участвует как в цикле лимонной кислоты, так и в дыхательной цепи. Белковый комплекс сукцинатдегидрогеназа (SDH) катализирует окисление сукцината (сукцинат + убихинон =>фумарат + убихинол). Электроны, удаленные из сукцината, переносятся на SDHA, переносятся через SDHB через кластеры железной серы к субъединицам SDHC / SDHD на гидрофобном конце комплекс заякорен в митохондриальной мембране.

Первоначально SDHA окисляет сукцинат посредством депротонирования на сайте связывания FAD, образуя FADH 2 и оставляя фумарат, слабо связанный с активным сайтом, свободный для выхода из белка. Электроны выводятся из сукцинатного туннеля вдоль реле [Fe-S] в субъединице SDHB до тех пор, пока они не достигнут кластера [3Fe-4S] железо-серы. Затем электроны переносятся на ожидающую молекулу убихинона в активном центре Q-пула в димере SDHC / SDHD. O1 карбонил кислород убихинона ориентирован в активном центре (изображение 4) посредством взаимодействий водородной связи с Tyr83 из SDHD. Присутствие электронов в кластере железо-серы [3Fe-4S] вызывает движение убихинона во вторую ориентацию. Это облегчает взаимодействие второй водородной связи между карбонильной группой O4 убихинона и Ser27 SDHC. После первой стадии восстановления одним электроном образуется радикал семихинон. Второй электрон прибывает из кластера [3Fe-4S], чтобы обеспечить полное восстановление убихинона до убихинола.

SDHA действует как промежуточное соединение в основном действии фермента SDH:

  1. SDHA превращает сукцинат в фумарат как часть цикла лимонной кислоты. Эта реакция также превращает FAD в FADH 2.
  2. . Электроны из FADH 2 переносятся на кластеры железа субъединицы SDHB [2Fe-2S], [4Fe-4S], [3Fe-4S]. Эта функция является частью дыхательной цепи
  3. . Наконец, электроны передаются в пул убихинона (Q) через субъединицы SDHC / SDHD..
Клиническая значимость

Биаллельные мутации (т. Е. Обе копии гена мутированы) были описаны в синдроме Ли, прогрессирующем заболевании головного мозга, которое обычно проявляется в младенчестве или в раннем возрасте. детство. У пораженных детей могут возникнуть рвота, судороги, задержка развития, мышечная слабость и проблемы с движением. У людей с этим заболеванием также могут возникать сердечные заболевания, проблемы с почками и затрудненное дыхание. Мутации гена SDHA, ответственные за синдром Ли, изменяют отдельные аминокислоты в белке SDHA, такие как мутация G555E, наблюдаемая у нескольких пациентов, или приводят к аномально короткому белку. Эти генетические изменения нарушают активность фермента SDH, нарушая способность митохондрий вырабатывать энергию. Однако неизвестно, как мутации в гене SDHA связаны с особенностями синдрома Ли.

SDHA является геном-супрессором опухоли, и гетерозиготные носители имеют повышенный риск параганглиом, а также феохромоцитом и рака почек. Управление рисками для гетерозиготных носителей мутации SDHA может включать ежегодные анализы мочи на метанефрины и 3-метокситирамин и МРТ.

Интерактивная карта путей

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы перейти к соответствующим статьи.

[[File: TCACycle_WP78 [[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]][[]]TCACycle_WP78 | {{{bSize}}} px | alt = Цикл TCA редактировать ]] Цикл TCA редактировать
Ссылки
Дополнительная литература
Последняя правка сделана 2021-06-06 03:00:32
Содержание доступно по лицензии CC BY-SA 3.0 (если не указано иное).
Обратная связь: support@alphapedia.ru
Соглашение
О проекте