Войти
Программное обеспечение для молекулярного дизайна - известное программное обеспечение для молекулярного моделирования, которое обеспечивает специальную поддержку для разработки молекулярных моделей de novo.
В отличие от обычных программ молекулярного моделирования, например, для молекулярной динамики и квантовой химии, такое программное обеспечение напрямую поддерживает аспекты, связанные с построением молекулярных моделей, в том числе:
| 3D | Мышь | Поли | ДНК | Пепт | Кристалл | Solv | Q | Док | Мин. | ММ | QM | FF | QSAR | FBLD | FE | SN | Интернет сайт | Комментарии | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Морское ушко | да | да | да | да | да | да | да | да | Нет | да | да | да | да | Нет | biomolecular-modeling.com | Биомолекулярная графическая среда: построители макромолекул, МД с ускорением на GPU | |||
| ЯНТАРЬ | Нет | Нет | Нет | да | да | Нет | Нет | да | Нет | да | да | Нет | да | Нет | да | ambermd.org | Программа классического молекулярного моделирования | ||
| Аскалаф Дизайнер | да | да | да | да | да | да | да | да | Нет | да | да | да | да | Нет | Agile Molecule | Общий пакет молекулярного моделирования | |||
| БОСС | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | да | Нет | да | да | да | да | Нет | Йельский университет | Изобретатель OPLS | |||
| Discovery Studio | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | Dassault Systèmes BIOVIA | Среда моделирования молекул как для малых, так и для макромолекулярных систем | |||
| ДОК | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | да | да | да | да | Нет | Нет | Нет | Калифорнийский университет | DOCK алгоритм | |||
| Firefly (PC GAMESS) | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | да | Нет | да | Нет | да | да | Нет | Московский Государственный Университет | Программа вычислительной химии ab initio и DFT | |||
| FoldX | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | да | Нет | да | да | Нет | да | Нет | CRG | Силовое поле для расчета энергии и дизайна белков | |||
| Ведущий поиск | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | Нет | да | да | Нет | да | Нет | Нет | Нет | МолТех | Пакет молекулярной док-станции | |||
| Студия материалов | да | да | да | Нет | Нет | да | да | да | да | да | да | да | да | Нет | Dassault Systèmes BIOVIA | Программная среда | |||
| Молекулярная рабочая среда (MOE) | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | Группа химических вычислений | Платформа для приложений молекулярного моделирования / открытия лекарств, запрограммированная на научном векторном языке для настройки и разработки приложений | ||
| Розетта (RosettaCommons) | Нет | Нет | да | да | да | да | да | да | да | да | да | Нет | да | Нет | RosettaCommons | Программа для моделирования макромолекул. Алгоритмы моделирования и анализа белковых структур. Ключевые достижения в дизайне белков de novo, дизайне ферментов, стыковке лигандов, предсказании структуры | |||
| САМСОН | да | да | Нет | Нет | Нет | да | Нет | Нет | да | да | да | да | да | Нет | SAMSON Connect | Вычислительные нанонауки (науки о жизни, материалы и др.); модульная архитектура, модули называются Элементами; свободный | |||
| Scigress | да | да | да | Нет | да | да | да | да | да | да | да | да | да | да | Fujitsu | Пакет молекулярного моделирования общего назначения | |||
| Спартанский | да | да | Нет | да | да | Нет | да | да | Нет | да | да | да | Нет | Нет | Волновая функция | Инструмент молекулярного моделирования с молекулярной механикой и квантово-химическими двигателями | |||
| Тинкер | Нет | Нет | Нет | Нет | да | Нет | Нет | да | Нет | да | да | Нет | Нет | Нет | Вашингтонский университет | Инструменты для белкового дизайна; бесплатное ПО | |||
| Winmostar | да | да | да | Нет | Нет | да | да | да | Нет | да | да | да | да | Нет | X-способность | Программа молекулярного моделирования и визуализации для материаловедения |
